| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,687,043 | G→T | 10.7% | intergenic (+18/+27) | hmp → / ← glnB | nitric oxide dioxygenase/nitrogen regulatory protein PII‑1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,687,043 | 0 | G | T | 10.7% | 293.4 / 17.4 | 93 | intergenic (+18/+27) | hmp/glnB | nitric oxide dioxygenase/nitrogen regulatory protein PII‑1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/42); new base T (5/5); total (46/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.19e-01 | |||||||||||
CCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGACACA > NC_000913/2686897‑2687192 | ccGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGaaa < 1:18955/150‑1 (MQ=255) cGACAATGCAGTTCTATTTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAAc > 1:1469451/1‑150 (MQ=255) gACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACa > 2:528998/1‑150 (MQ=255) aCAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAAAATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAAAAt > 2:731908/1‑150 (MQ=255) aaTGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATcc < 2:1462927/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGc < 2:1417590/150‑1 (MQ=255) gCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGc < 1:320424/150‑1 (MQ=255) cAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCa < 1:1406801/150‑1 (MQ=255) cAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGGGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCa < 2:130036/150‑1 (MQ=255) gTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGGGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCAAc < 1:842393/150‑1 (MQ=255) tCTATCTCTGCGGCCCCGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAAccc < 2:1458800/150‑1 (MQ=255) aTCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTg > 2:940863/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGAcgcg > 1:1274958/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGAcgcg > 2:319653/1‑150 (MQ=255) gCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCgg < 1:678536/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGtt > 1:215217/1‑150 (MQ=255) gCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGttt > 1:1357963/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTaa > 2:430596/1‑150 (MQ=255) ggTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAAt < 1:319653/150‑1 (MQ=255) gCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCcg > 1:798782/1‑150 (MQ=255) gCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCAGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCcg > 1:1485593/1‑150 (MQ=255) cTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCcgc > 1:1169223/1‑150 (MQ=255) cATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGcgtc < 1:110161/150‑1 (MQ=255) cAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTcc < 1:1416442/150‑1 (MQ=255) cAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTcc < 2:1480230/150‑1 (MQ=255) tttACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCctct < 2:82988/150‑1 (MQ=255) tACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTc > 2:300686/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTa > 2:1167445/1‑127 (MQ=255) ccGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTa < 1:1167445/127‑1 (MQ=255) cgcgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCAcc < 1:228407/150‑1 (MQ=255) cgcgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCAcc < 1:528998/150‑1 (MQ=255) cgcgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCAcc < 1:940863/150‑1 (MQ=255) gcgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGTTTCCATCCGGc < 2:1622152/107‑1 (MQ=255) gcgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGTTTCCATCCGGc > 1:1622152/1‑107 (MQ=255) cgAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCgg < 1:1219236/150‑1 (MQ=255) aGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGa < 2:1448477/150‑1 (MQ=255) tAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGc < 1:1046650/150‑1 (MQ=255) aGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCg < 2:1437347/150‑1 (MQ=255) gTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGa > 2:1112090/1‑150 (MQ=255) tGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGaa < 1:883935/150‑1 (MQ=255) ggATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAAt < 2:1169223/150‑1 (MQ=255) gATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATg > 1:818660/1‑150 (MQ=255) tGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGAccc > 2:1331026/1‑150 (MQ=255) gggCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCg > 2:27458/1‑150 (MQ=255) gCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTg < 2:798782/150‑1 (MQ=255) aagaagGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACg < 1:363913/150‑1 (MQ=255) aGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTg < 2:1619800/144‑1 (MQ=255) aGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTg > 1:1619800/1‑144 (MQ=255) aGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGt > 1:1029381/1‑150 (MQ=255) ggccaaagCATTCGTAATGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCa > 1:1516170/5‑150 (MQ=255) cAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCa > 1:1337817/1‑150 (MQ=255) gccaaagCATTCGTAATGAATGTTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCaa > 2:252162/4‑150 (MQ=255) aaaCATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGAc < 1:1030939/150‑1 (MQ=255) aaCATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACg < 2:567264/150‑1 (MQ=255) aCATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGa < 2:1274958/150‑1 (MQ=255) cattcattACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTTGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGaa > 2:453058/1‑150 (MQ=255) attACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGAttt > 1:356026/1‑150 (MQ=255) tACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTa > 2:666454/1‑150 (MQ=255) cGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTAcc > 1:106051/1‑150 (MQ=255) gAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCg > 1:1595398/1‑150 (MQ=255) gAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCg > 1:351812/1‑150 (MQ=255) gAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCg < 2:809823/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCa < 1:430596/150‑1 (MQ=255) gCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCAc > 1:471354/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCAcc > 1:1343064/1‑150 (MQ=255) gCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGAttt < 1:707491/150‑1 (MQ=255) cGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGc < 2:772368/150‑1 (MQ=255) cGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTACCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGc > 1:726042/1‑150 (MQ=255) gCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGcc < 1:1331026/150‑1 (MQ=255) cATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCg < 1:1112090/150‑1 (MQ=255) tAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGt > 2:143134/1‑150 (MQ=255) aGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGttt > 1:1575068/1‑150 (MQ=255) gTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTgc > 2:637205/1‑150 (MQ=255) cTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGcc > 2:430863/1‑150 (MQ=255) aaTTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGc < 2:818660/150‑1 (MQ=255) ttGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGaa > 2:432500/1‑150 (MQ=255) tGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGaat < 1:1329562/150‑1 (MQ=255) tGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGaataat > 1:663338/1‑150 (MQ=255) ggTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGc < 2:1420758/127‑1 (MQ=255) ggTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGc > 1:1420758/2‑128 (MQ=255) gTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATg > 2:992101/1‑150 (MQ=255) gTTGCCGGATGTTTCCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATg > 1:204831/1‑150 (MQ=255) tGCCGGATGTTTCCATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGt > 1:1222453/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGACTGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTa > 1:595583/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGa < 2:1523617/118‑1 (MQ=255) gCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGa > 1:1523617/1‑118 (MQ=255) gCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTa < 2:1078654/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTa < 1:432500/150‑1 (MQ=255) cGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATc < 1:696584/150‑1 (MQ=255) cGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATc < 1:430863/150‑1 (MQ=255) ggATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCg < 1:27504/150‑1 (MQ=255) aTGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGac > 1:64597/1‑150 (MQ=255) aTGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGac < 1:143134/150‑1 (MQ=255) gAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATg < 2:1256276/139‑1 (MQ=255) gAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGAcaca < 2:1357963/150‑1 (MQ=255) | CCGACAATGCAGTTCTATCTCTGCGGCCCGGTTGGCTTCATGCAGTTTACCGCGAAACAGTTAGTGGATCTGGGCGTGAAGCAGGAAAACATTCATTACGAATGCTTTGGCCCGCATAAGGTGCTGTAATTTGATGTTGCCGGATGGAAACATCCGGCAACCCTTGACGCGGTTTAAATTGCCGCGTCGTCCTCTTCACCGGTACGGATGCGAATGACCCGTGCCACGTCAAAGACGAAGATTTTACCGTCACCGATTTTGCCGGTTTGCGCCGTGCGAATAATGGTATCGACACA > NC_000913/2686897‑2687192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |