| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,762,823 | G→A | 7.3% | L240L (CTG→TTG) | abpB ← | CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,762,823 | 0 | G | A | 7.3% | 290.3 / 9.0 | 96 | L240L (CTG→TTG) | abpB | CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/40); new base A (4/3); total (53/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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TGCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCT > NC_000913/2762685‑2762972 | tGCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAAACTGCTTaagg < 1:1310315/150‑3 (MQ=255)tGCCGAACGTCTTAAAATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGAAGTTTGCTTAACg > 2:1388053/1‑150 (MQ=255) gCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCtt > 1:1439100/1‑145 (MQ=255) gCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCtt < 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agaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGt < 2:1155679/150‑1 (MQ=255) gaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGtt > 2:413494/1‑150 (MQ=255) gaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGtt > 2:1195742/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCa > 2:1510664/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCa > 1:179334/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |