| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,762,825 | T→C | 7.1% | K239R (AAA→AGA) ‡ | abpB ← | CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,762,825 | 0 | T | C | 7.1% | 292.5 / 9.8 | 98 | K239R (AAA→AGA) ‡ | abpB | CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/40); new base C (4/3); total (55/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
TGCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCTGA > NC_000913/2762685‑2762974 | tGCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAAACTGCTTaagg < 1:1310315/150‑3 (MQ=255)tGCCGAACGTCTTAAAATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGAAGTTTGCTTAACg > 2:1388053/1‑150 (MQ=255) gCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCtt > 1:1439100/1‑145 (MQ=255) gCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCtt < 2:1439100/145‑1 (MQ=255) gCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAAACTGCTTaaggt < 1:455372/150‑4 (MQ=255) gAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAAt > 2:228900/1‑150 (MQ=255) gTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg > 1:1315550/1‑150 (MQ=255) gTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTg < 1:664903/150‑1 (MQ=255) tCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGa < 1:225844/150‑1 (MQ=255) ttAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGc < 2:952397/150‑1 (MQ=255) tAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCt > 1:134440/1‑150 (MQ=255) tAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCAAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCt > 1:731509/1‑150 (MQ=255) cATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGa > 1:255985/1‑150 (MQ=255) tCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATg < 2:255985/150‑1 (MQ=255) tCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATg < 1:1424226/150‑1 (MQ=255) cTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGa > 2:1323679/1‑150 (MQ=255) gcgACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcgt > 2:1527049/1‑150 (MQ=255) aCTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACtcgttcg < 2:239994/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGTATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCATGTAAAACTGCCTGGAGACATTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtg < 2:545581/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtg < 1:1148756/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtga < 1:587308/150‑1 (MQ=255) tGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgat < 1:976672/150‑1 (MQ=255) tGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgat < 2:1030031/150‑1 (MQ=255) gAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgatg < 1:588474/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTgatgat > 1:742082/1‑150 (MQ=255) aGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTgatgat > 1:780408/1‑150 (MQ=255) tCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCa < 1:1191748/150‑1 (MQ=255) ggTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAAt > 2:801897/1‑150 (MQ=255) gTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATg < 1:1453314/150‑1 (MQ=255) gTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATg < 2:65763/150‑1 (MQ=255) aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgatg < 2:272993/139‑1 (MQ=255) aaaCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTtgatg > 1:272993/1‑139 (MQ=255) aCGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCg < 1:977999/150‑1 (MQ=255) cGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAAACTGCTTaagg < 2:1290913/102‑3 (MQ=255) cGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAAACTGCTTaagg > 1:1290913/1‑100 (MQ=255) gTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTc > 2:1465183/1‑150 (MQ=255) gTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGACCAATGTCCCCGCTTTTc < 1:589601/150‑1 (MQ=255) aTGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAg < 2:742082/150‑1 (MQ=255) aTGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAg < 2:442943/150‑1 (MQ=255) aTGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAg < 1:1323679/150‑1 (MQ=255) cGGATATCCAAGTTATTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTg > 2:987022/1‑150 (MQ=255) cGGATATACAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAAAGGTCCCGTAAGGTAAAACTGCCTGGAGACATTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGttt > 1:11718/1‑149 (MQ=255) ggATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGt > 2:71013/1‑150 (MQ=255) ggATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGt > 1:134444/1‑150 (MQ=255) tCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGaa > 1:1457356/1‑150 (MQ=255) ccAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAAc > 1:1398516/1‑150 (MQ=255) cAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACg > 1:1329259/1‑150 (MQ=255) cAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACg > 1:1202960/1‑150 (MQ=255) cGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGt > 1:1253322/1‑150 (MQ=255) agaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTaa > 1:1093641/1‑150 (MQ=255) gaCCGCGAATGCTGTTAACGAACGTTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTaaa < 1:930121/150‑1 (MQ=255) cgcgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCTGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACt > 2:237345/1‑150 (MQ=255) cgcgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACt < 2:134444/150‑1 (MQ=255) cgAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCg < 1:874671/150‑1 (MQ=255) gAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGt < 1:1464967/150‑1 (MQ=255) gAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGt < 1:1629709/150‑1 (MQ=255) cTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATg > 2:1030327/1‑150 (MQ=255) tGTTAACGAACTGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAAtta < 2:11718/150‑3 (MQ=255) tGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGa > 2:1448648/1‑150 (MQ=255) agTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACAGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGa > 2:474659/2‑150 (MQ=255) tAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGa > 2:864345/1‑150 (MQ=255) tAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGa > 1:211991/1‑150 (MQ=255) tAACGAACGGTCCCGTCACGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAACCACTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTAGATGATCAATCTCCCCCCTAATCAGTTGTCCGAACGCCAACTTCTAAAACTCGTCAATGACGa > 2:24045/1‑150 (MQ=255) acgaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAag > 2:1172312/1‑150 (MQ=255) gaacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAagag > 2:1356367/1‑150 (MQ=255) aacgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAgg < 1:915640/150‑1 (MQ=255) cgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTc > 2:39676/1‑150 (MQ=255) cgGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTc > 2:1566207/1‑150 (MQ=255) ggTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTTGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCa > 2:3119/1‑150 (MQ=255) cccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACTAAGAGGTCAATg > 1:630419/1‑150 (MQ=255) cccGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATg > 1:982570/1‑150 (MQ=255) aGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTcgacg < 1:1170180/150‑1 (MQ=255) ggTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTcgacga > 2:256529/1‑150 (MQ=255) gTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGAt < 1:24045/150‑1 (MQ=255) aaaCTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATgtc < 1:1356367/150‑1 (MQ=255) aCTGCCTTGAGTCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATTTTGTGCTCGATTACTCGTTCGTCTTTATGATCAATGTCCACGCTTTTCAGTTTTCGGAACGCAAACTTGTAAAACTCTTCAATGACGAAGAGTTCAATGTCGACGATgtcgt < 2:1168394/150‑1 (MQ=255) aCTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATgtcgt < 1:987022/150‑1 (MQ=255) cTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTGCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATgtcgtc < 2:79084/150‑1 (MQ=255) gCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCAc < 2:1398516/150‑1 (MQ=255) gCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCAc > 2:288895/1‑150 (MQ=255) ccTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACg > 2:1371730/1‑150 (MQ=255) tGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCt < 2:1329259/150‑1 (MQ=255) cattgcgttAAGCAAACTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTc > 2:995773/8‑150 (MQ=255) ttgcgttAAGCAAACTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGt > 2:1277457/6‑150 (MQ=255) ttgcgttAAGCAAACTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGt > 2:419371/6‑150 (MQ=255) agaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGt < 2:1155679/150‑1 (MQ=255) gaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGtt > 2:413494/1‑150 (MQ=255) gaCCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGtt > 2:1195742/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCa > 2:1510664/1‑150 (MQ=255) ccTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCa > 1:179334/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGAGGATGTCGTCACGCTCGTTCAc > 2:1433271/1‑150 (MQ=255) cTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCAc < 2:1315550/150‑1 (MQ=255) aGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGc > 2:1622141/1‑150 (MQ=255) aGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGc > 1:1623016/1‑150 (MQ=255) gCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCt > 1:566508/1‑150 (MQ=255) aGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTcc < 2:566508/150‑1 (MQ=255) gTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTTAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCt > 2:1018606/1‑150 (MQ=255) gTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCt > 2:5678/1‑150 (MQ=255) tttGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCTg < 1:306181/150‑1 (MQ=255) ttGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCTGa > 1:612658/1‑150 (MQ=255) | TGCCGAACGTCTTAACATCTAGCGCGACTGTATTGAAGTCGGTAGAAACGAAAGTATGCGGATATCCAAGTTTTTCGAGACCGCGAATGCTGTTAACGAACGGTCCCGTCAGGTAAAACTGCCTGGAGACCTTAAGCAGTTTGCTTAACGCAATGTTGAGCTCGATGACTCGTTCGTCTTGATGATCAATGTCCCCGCTTTTCAGTTGTCGGAACGCCAACTTGTAAAACTCGTCAATGACGAAGAGGTCAATGTCGACGATGTCGTCACGCTCGTTCACTCGCTCCTGA > NC_000913/2762685‑2762974 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |