| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 335,166 | T→A | 6.5% | intergenic (‑144/‑114) | yahC ← / → yahD | uncharacterized protein YahC/ankyrin repeat‑containing protein YahD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 335,166 | 0 | T | A | 6.5% | 370.9 / 10.3 | 120 | intergenic (‑144/‑114) | yahC/yahD | uncharacterized protein YahC/ankyrin repeat‑containing protein YahD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (64/48); new base A (6/2); total (70/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
TCATCTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGACTAT > NC_000913/335019‑335309 | aTCTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATattatt < 1:1607719/150‑1 (MQ=255) tCTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTc > 1:114679/1‑150 (MQ=255) tCTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTc > 2:392527/1‑150 (MQ=255) cTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTca > 1:400141/1‑150 (MQ=255) ttGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTcaa > 2:853043/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTcaac > 2:676357/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTcaac > 2:827996/1‑150 (MQ=255) tGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATAATATTcaac < 2:393485/150‑1 (MQ=255) ccTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAg > 2:247679/1‑150 (MQ=255) ctctGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAgg > 1:385487/1‑150 (MQ=255) tGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCga > 1:339326/1‑150 (MQ=255) ggTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCgag > 2:1024152/1‑150 (MQ=255) cATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGc < 1:148761/150‑1 (MQ=255) aTGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCg > 1:810488/1‑150 (MQ=255) gACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAAt > 1:1200966/1‑150 (MQ=255) aCGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAAtt > 1:723047/1‑150 (MQ=255) cGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTa > 1:1071157/1‑150 (MQ=255) cGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTCATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACAGCACAATGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTa > 2:312496/1‑150 (MQ=255) aaaGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTaaa > 2:600568/1‑150 (MQ=255) aGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAGTAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAAtt > 1:144079/1‑150 (MQ=255) tACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTaa > 1:455607/1‑150 (MQ=255) tACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTaa > 1:351897/1‑150 (MQ=255) ctTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCgg < 2:1465163/150‑1 (MQ=255) ctTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCgg > 2:569034/1‑150 (MQ=255) ctTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCgg > 1:1513614/1‑150 (MQ=255) cATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTc < 1:247679/150‑1 (MQ=255) tgCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCtttt < 2:184666/150‑1 (MQ=255) gCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTa < 1:459844/150‑1 (MQ=255) gCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTa < 1:1615710/150‑1 (MQ=255) gACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATAGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCa < 1:1595549/150‑1 (MQ=255) aCTATAGAGAAATAAAACCTGTTTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACTCTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACATAAAGGCGAGATACGGCTAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAg < 1:1271118/150‑1 (MQ=255) tataGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGAt > 2:548484/1‑150 (MQ=255) ataGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGAtt > 2:900930/1‑150 (MQ=255) taGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATGAGATTa > 2:867363/1‑150 (MQ=255) taGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTa < 2:400141/150‑1 (MQ=255) taGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGAGTTCTTTTATCAGATTa > 1:31263/1‑150 (MQ=255) gaAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGt > 1:437058/1‑150 (MQ=255) aaTAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTg < 2:339326/150‑1 (MQ=255) aaTAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTg > 1:235441/1‑150 (MQ=255) aTAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGc < 2:1513614/150‑1 (MQ=255) aTAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGc < 1:853043/150‑1 (MQ=255) aaaaCCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTa < 1:99367/150‑1 (MQ=255) aaaCCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCgag > 1:27219/1‑99 (MQ=255) aaaCCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTAt > 1:829809/1‑150 (MQ=255) aCCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAATGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGTGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtc < 2:1358271/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGAGTGAAAGGGTATCGTGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtct < 2:371359/150‑1 (MQ=255) ccTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtct > 1:48662/1‑150 (MQ=255) aaagATTTAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCAATAACGCACAATGAGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtct > 2:1630769/4‑150 (MQ=255) cTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtctc < 2:1209592/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtctc < 1:1427231/150‑1 (MQ=255) cTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATtctc < 1:380570/150‑1 (MQ=255) tGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCa < 2:48662/150‑1 (MQ=255) aTTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAAt < 2:1525282/150‑1 (MQ=255) ttGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAAtt > 1:61883/1‑150 (MQ=255) gAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCa > 2:321274/1‑150 (MQ=255) gTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATc < 1:1520050/150‑1 (MQ=255) tGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCg > 1:1199758/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTGTTTTATCAGATTATCGTTGCTTTTCTCAATTCCTCGa > 2:823866/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTAATcta > 1:850940/1‑148 (MQ=255) aGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGaaaa > 2:452119/1‑150 (MQ=255) gcgTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAAc < 1:1326945/148‑1 (MQ=255) aTCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGcc < 1:676357/150‑1 (MQ=255) cGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCcac > 2:974586/1‑150 (MQ=255) cGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCcac < 2:1602333/150‑1 (MQ=255) cAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCt > 2:226950/1‑99 (MQ=255) cAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCt < 1:226950/99‑1 (MQ=255) aaaGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACaaaaaa > 2:138986/1‑149 (MQ=255) aaaGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAAc > 1:1291540/1‑150 (MQ=255) gAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAg > 1:1461799/1‑150 (MQ=255) gAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAg < 2:626439/150‑1 (MQ=255) aaaCAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAgg < 2:385487/150‑1 (MQ=255) aaCAAATATTGCACTACCGCACACTGCTAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCTAGATACGTCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAggg < 1:312496/150‑1 (MQ=255) cAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGa > 1:979806/1‑150 (MQ=255) cAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGa > 2:668269/1‑150 (MQ=255) cAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGa > 1:147171/1‑150 (MQ=255) atTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGTCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCTTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAAtgtg < 2:1200259/150‑1 (MQ=255) gCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAAt > 1:744996/1‑150 (MQ=255) gCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAAt < 2:1071157/150‑1 (MQ=255) gCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAAt > 2:465785/1‑150 (MQ=255) cACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATg < 1:1180706/150‑1 (MQ=255) aCTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGa > 2:450136/1‑150 (MQ=255) cTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAg < 1:569034/150‑1 (MQ=255) aCCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGta > 2:346571/1‑150 (MQ=255) acTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATaaaaaa > 2:1350004/1‑150 (MQ=255) tGCTAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATc < 2:829809/150‑1 (MQ=255) tGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATc < 2:723047/150‑1 (MQ=255) cGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTa > 2:1060697/1‑150 (MQ=255) gcctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATAGGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATATAcc > 1:216467/7‑150 (MQ=255) gcctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTAcc > 2:625647/7‑150 (MQ=255) gcctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGGTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTAcc > 2:664807/7‑150 (MQ=255) aaaaGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTAcc < 2:61883/150‑1 (MQ=255) cctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGATTGTGATTGAGTATAAAAAGTCTACCt > 1:13115/6‑150 (MQ=255) cctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCt > 1:562209/6‑150 (MQ=255) cctttttgttgAATAATATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCt > 1:816995/6‑150 (MQ=255) aaGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTg > 2:829963/1‑150 (MQ=255) ttgttgAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGa > 1:185434/1‑150 (MQ=255) ttgttgAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGa < 1:437277/150‑1 (MQ=255) gttgAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGACt > 1:907984/1‑150 (MQ=255) gttgAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGACt > 2:266031/1‑150 (MQ=255) ttgAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGACta > 1:30789/1‑150 (MQ=255) | TCATCTTGTTCCCCTCTGGTTAGACATGGACGAAAGCTACTCTTACATGTGCAGACTATAGAGAAATAAAACCTGATTGAGTGAAAGGGTATCGGGTCAAAGAAACAAATATTGCACTACCGCACACTGCGAAAAGATTGTTGAATATTATTCAACAAAAAGGCGAGATACGGCGAATTAAATTTAAGCGGGTTCTTTTATCAGATTATCGTTGCTATTCTCAATTCATCGAAAACAGCCACAAAAACCAGGGGAATGTGAATGAGTATAAAAAATCTACCTGCCGACTAT > NC_000913/335019‑335309 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |