| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,917,895 | G→A | 7.2% | intergenic (+82/+150) | barA → / ← gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,917,895 | 0 | G | A | 7.2% | 337.8 / 10.3 | 111 | intergenic (+82/+150) | barA/gudD | sensory histidine kinase BarA/D‑glucarate dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/49); new base A (5/3); total (58/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGAGCTGCTGGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGT > NC_000913/2917747‑2918043 | ggAGCTGCTGGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATgc > 2:550543/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCTGGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATgcg < 1:1537885/150‑1 (MQ=255) aGCTGCTGGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATgcgg < 1:774281/150‑1 (MQ=255) ctgctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATgcggcg > 2:565240/1‑150 (MQ=255) tgctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGt > 1:524523/1‑150 (MQ=255) gctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGtt > 2:1100033/1‑150 (MQ=255) gctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGtt > 2:1353420/1‑150 (MQ=255) ctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTa > 2:1608783/1‑150 (MQ=255) ctgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTa > 1:670504/1‑150 (MQ=255) tgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTaa > 2:1608068/1‑150 (MQ=255) tgGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTaa > 1:1176527/1‑150 (MQ=255) ggAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAAc > 2:416743/1‑150 (MQ=255) ggAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAAc > 2:338622/1‑150 (MQ=255) cTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGAGCCTGTGTTTATGCCGGATgcg > 2:771786/1‑138 (MQ=255) cGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGc < 1:256101/150‑1 (MQ=255) gaTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTa < 2:569193/150‑1 (MQ=255) aTGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCATaa < 1:1346878/150‑2 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaa > 1:265130/1‑150 (MQ=255) ggATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACaa > 1:211020/1‑150 (MQ=255) gATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCATaaaca < 1:95483/150‑5 (MQ=39) tAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAAc < 1:153602/150‑1 (MQ=255) ggTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAAGCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCaa < 2:1550876/149‑1 (MQ=255) gTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTACCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTCTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAAt > 2:617807/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGAGGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTc < 2:1402230/150‑1 (MQ=255) aaGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAAt > 2:1516597/1‑150 (MQ=255) aGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTTTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATg < 2:840361/150‑1 (MQ=255) cAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAt > 1:818084/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGA‑TGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAtt > 2:983807/1‑150 (MQ=255) cAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGA‑TGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAAtt > 2:989967/1‑150 (MQ=255) aaaTTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTaaaa < 1:1100033/150‑1 (MQ=255) ttCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAat > 1:1557199/1‑150 (MQ=255) tctcGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatg < 2:1615348/150‑1 (MQ=255) cGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgatg > 1:952253/1‑150 (MQ=255) cGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgatg < 1:72112/150‑1 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTTTCGAGGAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATTACTTATTCTGAGTTAACGCCTTATCCGTCATAAAAAAACAATTAAATTCAATGAATTAAAAAatgattt < 2:1399958/150‑3 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt < 1:728423/150‑1 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt > 2:728423/1‑150 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt > 1:320166/1‑150 (MQ=255) gggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGt < 2:670504/150‑1 (MQ=255) ggTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGGTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTa < 2:1441236/150‑1 (MQ=255) aaTGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGAc < 1:1159296/150‑1 (MQ=255) ggATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTg > 2:1064165/1‑150 (MQ=255) aTGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGAt < 1:189692/150‑1 (MQ=255) aTGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGAt > 2:890530/1‑150 (MQ=255) aTGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGAt < 2:381812/150‑1 (MQ=255) tGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATa < 1:258731/150‑1 (MQ=255) tGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATa < 1:188519/150‑1 (MQ=255) gTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATAc < 1:410822/150‑1 (MQ=255) cTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACAt < 2:265130/150‑1 (MQ=255) tGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAg > 2:105324/1‑150 (MQ=255) tCGAGTAGCAATCTGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGca < 1:534038/150‑1 (MQ=255) tCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGca < 2:524523/150‑1 (MQ=255) cGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTGTCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac > 2:58471/1‑150 (MQ=255) cGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGGCTACAAAAGCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac < 2:1468928/150‑1 (MQ=255) cGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac < 1:111043/150‑1 (MQ=255) aGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac < 2:791169/148‑1 (MQ=255) aGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGcac > 1:791169/1‑148 (MQ=255) gTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCacaac < 1:1516597/150‑1 (MQ=255) tAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACg > 1:459543/1‑77 (MQ=255) tAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACAAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCacaaca < 2:1271296/150‑1 (MQ=255) aGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAg > 1:270164/1‑150 (MQ=255) ggCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTAttt > 2:481348/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 1:1230470/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTg > 2:768309/1‑150 (MQ=255) tttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGt < 2:410551/150‑1 (MQ=255) tttATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGt < 2:347092/150‑1 (MQ=255) tatATGAAGCTCGTAACAGATTCGTGACAAAGAGCCTGTCTTTATGCCGGATGCGGCGTTAAAGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGt > 2:564905/3‑150 (MQ=37) tATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGttt > 1:977310/1‑150 (MQ=255) gACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGc > 1:25557/1‑150 (MQ=255) gACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGc > 1:1139308/1‑150 (MQ=255) ttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGtctc < 2:952253/150‑1 (MQ=255) ttCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATAAGtctc > 2:1342680/1‑150 (MQ=255) tCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCa > 2:684371/1‑150 (MQ=255) cAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCTTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaa > 2:1386553/1‑150 (MQ=255) cAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCaa > 2:1341997/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAAcc > 1:220821/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATAAGTCTCAAAcc < 1:1342680/150‑1 (MQ=255) ttGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCg > 2:623021/1‑150 (MQ=255) ttGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTAAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCg > 2:132082/1‑150 (MQ=255) ggTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGc > 1:1567167/1‑150 (MQ=255) tGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTc > 1:1099152/1‑150 (MQ=255) tGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATAAGTCTCAAACCGGCTc > 1:1407257/1‑150 (MQ=255) aCAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCa > 1:373687/1‑150 (MQ=255) gCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATagag < 1:1353420/150‑1 (MQ=255) gCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATagag > 1:753362/1‑150 (MQ=255) tgtgTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCg > 2:166273/1‑150 (MQ=255) tttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTAC‑AAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggtttt < 2:211020/150‑1 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCTGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggtttt < 2:754218/150‑1 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 1:1608068/150‑2 (MQ=255) ttATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttg < 2:1230470/150‑2 (MQ=255) gtaggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggtttt > 1:23817/5‑150 (MQ=255) tATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg < 2:1139308/150‑1 (MQ=255) tATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttg < 1:617807/150‑1 (MQ=255) aggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg > 1:229837/3‑150 (MQ=255) aggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg > 2:109347/3‑150 (MQ=255) aggCCGGATAAGGCGTTAACGCCGCATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg > 1:1434096/3‑150 (MQ=255) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCTATCTGGAGCCggtttgag < 2:628137/150‑4 (MQ=38) aTGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCggttttgg > 1:45362/1‑150 (MQ=255) ggATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTc < 1:768309/150‑1 (MQ=255) tGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGt > 2:762618/1‑150 (MQ=255) | GGAGCTGCTGGAACTGTTGGACGAGATGGATAATGTCGCGCGCGAAGCCAGCAAAATTCTCGGGTAATGGATGTCTTGTCGAGTAGCAATCGGCTTTTTATGACGCTGGTTTCAGATTGGTGACAAAGTGCCTGTGTTTATGCCGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCCTACAAAACCAATTAAATTCAATGAATTAAAAAATGATGTAGACCTGATACATAGCACAACAGGCTATTTTGCGTTTAGCATCAGTCTCAAACCGGCTCCAGATAGAGCCGGTTTTGGTTTTCTGT > NC_000913/2917747‑2918043 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |