| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,044,327 | C→G | 5.5% | S222R (AGC→AGG) | bglA → | 6‑phospho‑beta‑glucosidase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,044,327 | 0 | C | G | 5.5% | 306.9 / 6.7 | 91 | S222R (AGC→AGG) | bglA | 6‑phospho‑beta‑glucosidase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/46); new base G (2/3); total (42/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
TACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCG > NC_000913/3044181‑3044475 | tACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGcc > 1:224562/1‑150 (MQ=255)tACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGcc > 1:739773/1‑150 (MQ=255) aTGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCg < 2:1272199/150‑1 (MQ=255) tGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCgg < 1:685286/150‑1 (MQ=255) gACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgac < 1:466390/150‑3 (MQ=255) gACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgac < 1:158686/150‑3 (MQ=255) aCCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTg < 2:258365/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa > 1:391158/1‑150 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa < 2:376682/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa < 2:743892/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa < 1:645696/150‑1 (MQ=255) ccTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGa > 2:350595/1‑150 (MQ=255) cTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaa < 2:1099053/150‑1 (MQ=255) ttCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGGGCGCTGGCgacaaac < 2:1524985/150‑7 (MQ=255) ttCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGaaa < 2:650988/150‑1 (MQ=255) tCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAg < 1:481216/150‑1 (MQ=255) cAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTGCTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGc > 2:647642/1‑150 (MQ=255) cAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGc < 1:819851/150‑1 (MQ=255) 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tgctgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGa > 1:289074/1‑150 (MQ=255) ctgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATg < 2:340448/150‑1 (MQ=255) tgcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATgc > 2:1136162/1‑150 (MQ=255) gcATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTACCCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATgcc > 2:347371/1‑149 (MQ=255) aCCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAAc < 1:1547679/150‑1 (MQ=255) ccAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACg > 1:745356/1‑150 (MQ=255) ctttcaccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTACCCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCt > 1:576889/8‑150 (MQ=255) tGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGt > 1:103617/1‑150 (MQ=255) caccGCCAGGGCGCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGt > 2:1061926/4‑150 (MQ=255) gTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTc < 1:1244929/150‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGCCGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCtt > 1:1583204/1‑150 (MQ=255) cGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCtt > 2:520771/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCttt > 1:1207137/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCg < 2:881358/150‑1 (MQ=255) | TACTGGATGACCTTCAACGAAATTAACAACCAGCGTAACTGGCGTGCACCGCTGTTCGGTTACTGCTGCTCCGGCGTGGTGTATACCGAGCATGAAAACCCGGAAGAGACGATGTATCAGGTGCTGCATCACCAGTTTGTCGCCAGCGCCCTGGCGGTGAAAGCTGCGCGTCGCATTAACCCGGAGATGAAAGTCGGCTGTATGCTGGCGATGGTGCCGCTCTATCCTTACTCCTGTAACCCGGACGATGTGATGTTCGCTCAGGAGTCGATGCGCGAACGCTACGTCTTTACCG > NC_000913/3044181‑3044475 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |