| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,068,927 | 0 | T | C | 8.8% | 289.3 / 14.0 | 102 | intergenic (‑119/+20) | argO/mscS | L‑arginine exporter/small conductance mechanosensitive channel MscS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/44); new base C (5/4); total (54/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATC > NC_000913/3068780‑3069075 | gCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGtatta > 1:1167452/1‑150 (MQ=255)gCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGtatta < 2:1180501/150‑1 (MQ=255) cAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGtattat > 1:1320345/1‑150 (MQ=255) 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gagGCCAGATAATACTCTCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTaca > 2:161801/1‑150 (MQ=255) gagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGttt < 1:1388592/124‑1 (MQ=255) gagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGttt > 2:1388592/1‑124 (MQ=255) gagGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTaca < 2:467899/150‑1 (MQ=255) ggCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACg > 2:347581/1‑150 (MQ=255) ggCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACg > 1:199468/1‑150 (MQ=255) ccAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 2:1117816/1‑150 (MQ=255) ccAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGtt > 2:1624372/1‑150 (MQ=255) gagTATTATCTGGCCTGAGGGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACAGGTTTTGCa < 2:1239917/150‑1 (MQ=255) gagTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCa < 1:523594/150‑1 (MQ=255) attatCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATc > 2:532655/1‑150 (MQ=255) attatCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATc < 1:1474579/150‑1 (MQ=255) | GCAAGACCTTGAAAGTAATAAGAAAACACGTTGGATATTCCGAATTAAGTATCTGATGCAGAGACTATATCGCGGGATTGTTATTAGCGGAAATTGATAATATTAATTGGCAATCAGAAAAACTAATAAGAGAGAGGCCAGAGAGTATTATCTGGCCTCAGCGTTGATTACGCAGCTTTGTCTTCTTTCACCCGCTTAAAGTTCACATCCATTTGCGGGTACGGGAAGCTGATACCGGCGGCATCAAATTCACGTTTAATACGCTCCAGCACATCCCAGTACACGTTTTGCAGATC > NC_000913/3068780‑3069075 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |