| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,119,574 | A→T | 7.2% | intergenic (‑462/+23) | yghJ ← / ← glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,119,574 | 0 | A | T | 7.2% | 420.7 / 17.3 | 138 | intergenic (‑462/+23) | yghJ/glcA | putative lipoprotein YghJ/glycolate/lactate:H(+) symporter GlcA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/77); new base T (2/8); total (53/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
TTGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATGCC > NC_000913/3119427‑3119722 | ttGCGTGAAAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACCCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGAATTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAAc < 2:450233/150‑1 (MQ=255)tcccgggATAACAACATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCCGAACGCAATACATTATTGCTGCCTGGATTATAAAGCGAGAAATCATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGTATGATATTAAc < 2:879584/144‑1 (MQ=255) tGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACg > 2:167768/1‑150 (MQ=255) tGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACg < 2:472580/150‑1 (MQ=255) tGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAAAAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGACGATATTAACg < 1:876102/150‑1 (MQ=255) cGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGat > 1:830505/1‑150 (MQ=255) gTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatc < 2:660733/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatca < 2:243557/150‑1 (MQ=255) tGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGatca < 1:445558/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATcc > 1:622064/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCgg < 1:1373241/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCgg > 1:887813/1‑150 (MQ=255) aaaaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCgg > 1:186915/1‑150 (MQ=255) aaaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCGGc < 2:563493/150‑1 (MQ=255) aaaaaTACTTGTTCACACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATACTAACGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTACCGATCATCCGGc < 2:911703/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCGGCt < 1:77112/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATAAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCGGCt < 1:119461/150‑1 (MQ=255) aaaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCtt < 1:1149602/150‑1 (MQ=255) aaTAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAGTAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCGGCttc < 2:669988/150‑2 (MQ=255) aTGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGa < 2:887813/150‑1 (MQ=255) tGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATCGTTAATATCATCCGGCTTCAtttac < 1:1480709/150‑4 (MQ=38) tGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGAt < 2:824922/150‑1 (MQ=255) ttCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCTGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGAttt < 2:464029/150‑1 (MQ=255) tctcACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTa < 2:1396567/150‑1 (MQ=255) tcACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACg < 1:230331/150‑1 (MQ=255) cACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACga > 2:1086880/1‑150 (MQ=255) aCGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACgag < 2:652799/150‑1 (MQ=255) aCGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACgag < 2:1583760/150‑1 (MQ=255) aCGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACgag < 1:1096267/150‑1 (MQ=255) gCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGAc < 2:746328/150‑1 (MQ=255) ctctTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACt < 2:1160468/150‑1 (MQ=255) ctTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTaa > 2:1231157/1‑150 (MQ=255) ctTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTaa > 1:665879/1‑150 (MQ=255) ttAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAAc < 2:181175/150‑1 (MQ=255) attattTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTaa > 2:557979/1‑146 (MQ=255) attattTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTaa < 1:557979/146‑1 (MQ=255) attTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCg < 1:518356/150‑1 (MQ=255) tttAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCgg < 1:1182777/150‑1 (MQ=255) tttAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCgg < 1:1510075/150‑1 (MQ=255) cAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAac < 2:33836/150‑1 (MQ=255) aGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAaca < 1:1320628/150‑1 (MQ=255) ggTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAacac > 1:137833/1‑150 (MQ=255) ggTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAacac > 2:682573/1‑150 (MQ=255) tttATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAAcaca < 1:309930/149‑1 (MQ=255) gTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAAcaca < 1:82496/150‑1 (MQ=255) gTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAAcaca < 2:1032286/150‑1 (MQ=255) tATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATa > 1:1410121/1‑150 (MQ=255) tCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACg > 1:1188790/1‑150 (MQ=255) cGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTgca < 1:1231157/150‑1 (MQ=255) cGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTgca > 2:1603107/1‑150 (MQ=255) cAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACg < 2:315106/115‑1 (MQ=255) cAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACg > 1:315106/1‑115 (MQ=255) cAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTgcagc < 2:820598/150‑1 (MQ=255) cAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTgcagc > 1:1323176/1‑150 (MQ=255) aaaaCATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTgcagca > 1:1471066/1‑150 (MQ=255) aaaCATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGcagcag < 1:1093014/150‑1 (MQ=255) aCATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAggg < 2:186915/150‑1 (MQ=255) ttattGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGa < 2:938111/150‑1 (MQ=255) tgcATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATg < 2:269251/148‑1 (MQ=255) cATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGa < 1:1086880/150‑1 (MQ=255) aTGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGAt < 2:726881/150‑1 (MQ=255) aTGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGAt > 1:964718/1‑150 (MQ=255) ggATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATaa < 2:773383/150‑1 (MQ=255) aataaAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCt > 1:48805/1‑150 (MQ=255) taaAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTgg < 2:1500240/150‑1 (MQ=255) gCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGc < 1:199267/134‑1 (MQ=255) gCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCaaa > 1:1000912/1‑150 (MQ=255) gCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCaaa > 2:769465/1‑150 (MQ=255) gCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCaaa > 1:158280/1‑150 (MQ=255) aaaTGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCa < 1:813054/150‑1 (MQ=255) tGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGAc < 2:1425047/150‑1 (MQ=255) tGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGAc < 2:830505/150‑1 (MQ=255) gATTTTCAATAAAAAAGACAGAATAATGAAAATTAAGCCAGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTAAAGATATACGAGACTAACATCCAGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACt > 2:1385885/1‑150 (MQ=255) aTTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACtg > 2:731397/1‑150 (MQ=255) aTTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCa < 2:964718/150‑1 (MQ=255) taataaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACg > 2:262083/1‑150 (MQ=255) aataaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACgg > 1:892146/1‑150 (MQ=255) aataaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACgg > 2:1020849/1‑150 (MQ=255) aataaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACgg < 2:1325017/150‑1 (MQ=255) aaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGgtgt > 1:1179036/1‑150 (MQ=255) aaGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGgtgt > 2:1077431/1‑150 (MQ=255) aGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTa > 2:567692/1‑150 (MQ=255) aCAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGc < 2:1264233/150‑1 (MQ=255) aGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCgg < 1:1042209/150‑1 (MQ=255) gAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGa > 1:896262/1‑150 (MQ=255) ataatGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAAc < 2:665879/150‑1 (MQ=255) tGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGtt > 1:1133660/1‑150 (MQ=255) aaTGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGa > 2:588019/1‑150 (MQ=255) aTGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGAt < 1:765877/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGAtt > 1:1233139/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCg > 1:900932/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGATATTAACGATCATACGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATACCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCg > 2:61/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGATAATTAATATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGCTAAACACAAACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCg > 2:705562/1‑150 (MQ=255) atgatATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCcca < 1:1043850/150‑1 (MQ=255) tgatATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGCAACAGTTCAGATTCTCGGCccac > 2:1247609/1‑150 (MQ=255) atTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATg < 2:1233139/150‑1 (MQ=255) atTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATg > 2:598545/1‑150 (MQ=255) ttAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCccacca < 2:1473666/147‑1 (MQ=255) ttAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCccacca > 1:1473666/1‑147 (MQ=255) tAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATGcc < 2:622064/150‑1 (MQ=255) | TTGCGTGATAAAAAAATAGATGTTCTCACGCTCTTAATTATTTAGCAGGTTATCTGAACGCAAAACATTATTGCTGCATGGATAATAAAGCGAGAAATGATTTTCAATTAATAAGACAGAATAATGTAAATGAAGCCGGATGATATTAACGATCATCCGGCTTTATTGATTTACGAGACTAACATCCCGGTAAACACATACGCCTGCAGCAGGGTGATAATGCCGATAACGCTGGCAAAAATCAGACTGTGCTTCACGGTGTAGCGGAACAGTTCAGATTCTCGGCCCACCATGCC > NC_000913/3119427‑3119722 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |