Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,144,160 | C→G | 9.4% | S2T (AGT→ACT) E327D (GAG→GAC) |
hybB ← hybA ← |
hydrogenase 2 membrane subunit hydrogenase 2 iron‑sulfur protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,144,160 | 0 | C | G | 9.4% | 229.6 / 11.1 | 73 | S2T (AGT→ACT) E327D (GAG→GAC) | hybB hybA | hydrogenase 2 membrane subunit hydrogenase 2 iron‑sulfur protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/34); new base G (3/4); total (35/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 |
CCCACGGGAAGCCGCCGTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGAAAGATCGTC > NC_000913/3144011‑3144309 | cccACGGGAAGCCGCCGTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGAc > 1:1268131/1‑150 (MQ=255) ccgccgTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGAGTCATGATccac < 1:436941/150‑4 (MQ=255) cgccgTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGtct < 2:669522/150‑1 (MQ=255) gccgTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGAGTCATGATccacaa < 1:166276/150‑6 (MQ=255) gccgTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGtctc > 2:1017469/1‑150 (MQ=255) gccgTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGtctc < 2:190672/150‑1 (MQ=255) gTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTctcctc < 2:1398431/150‑1 (MQ=255) cAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCcgt < 1:623572/150‑1 (MQ=255) ggTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCcgtcg < 1:31620/150‑1 (MQ=255) gTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCcgtcgt < 1:369470/150‑1 (MQ=255) cAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGa < 2:1473293/150‑1 (MQ=255) cAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGa > 2:1346896/1‑150 (MQ=255) cAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCGTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAACAATCATGACCGGTGTACTGATGATGTTGCCGCCCAGCGGTTGTTGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGa < 1:610921/150‑1 (MQ=255) agagACATAGCACAGACAGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGAt < 1:692992/150‑1 (MQ=255) cAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCg > 1:339572/1‑150 (MQ=255) gagCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGtt < 2:217217/150‑1 (MQ=255) ccAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTg < 2:56971/150‑1 (MQ=255) cAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCACAAATCATGACCGGTTTACTGAGGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGT‑GATCAAGCCTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTGTTGgt > 2:305418/1‑150 (MQ=255) cAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGGCGTTTTTgg < 2:859380/150‑1 (MQ=255) aGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGgt < 1:862571/150‑1 (MQ=255) gAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGc < 2:1195219/150‑1 (MQ=255) gAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGc > 1:144207/1‑150 (MQ=255) cacCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGcgac < 1:653259/150‑1 (MQ=255) cacCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGcgac > 2:926122/1‑150 (MQ=255) ccAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGcgacga > 2:800685/1‑150 (MQ=255) aGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAAc > 1:771832/1‑150 (MQ=255) tCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACg > 2:1507261/1‑150 (MQ=255) cacaATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACgg > 2:463157/1‑150 (MQ=255) cacaATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATATTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCCTCTCCTCCGTCCTGATGGTCCTATTAGGTCTTGCGACGATCCAGCACgg > 1:996579/1‑150 (MQ=255) caATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGtt > 2:69012/1‑150 (MQ=255) cAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGc < 2:771832/150‑1 (MQ=255) aGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGcc > 2:1078540/1‑150 (MQ=255) ggAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGccc > 2:312978/1‑150 (MQ=255) aTACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAg > 1:44647/1‑150 (MQ=255) tACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTCTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGc > 2:560644/1‑150 (MQ=255) aCAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGca < 2:339572/150‑1 (MQ=255) tGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGcc < 1:926122/150‑1 (MQ=255) taCGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCa < 1:445103/149‑1 (MQ=255) cGATTAACGGTCCAAAAATCATGGCCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCCCAGCCAGt > 2:440134/1‑150 (MQ=255) cGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGt > 1:343179/1‑150 (MQ=255) gATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTg > 2:898183/1‑150 (MQ=255) ttAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGt > 1:241892/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAg > 1:1006052/1‑150 (MQ=255) gTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCAAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGcatc > 2:628989/1‑150 (MQ=255) tCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGcatca < 2:1345320/150‑1 (MQ=255) aaaaTCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGcc < 1:1507261/150‑1 (MQ=255) aaTCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCtt < 2:224514/150‑1 (MQ=255) tGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATAc < 2:1624883/150‑1 (MQ=255) gACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACa > 1:1086119/1‑150 (MQ=255) gACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACa > 2:280319/1‑150 (MQ=255) aCCGGTTTACTGTTGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGTTCATGAGTCATGATCGTCTCCTACGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGAGACGAAGCAGAAGGGTTTAGCCCGCCAGCACACCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAg < 1:153451/150‑1 (MQ=255) cGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAggg < 1:1346896/150‑1 (MQ=255) ggTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGgt < 1:1017469/150‑1 (MQ=255) tttACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGgtgt < 2:1043265/150‑1 (MQ=255) ttACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGgtgtg < 1:645391/150‑1 (MQ=255) aCTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGtt < 1:463157/150‑1 (MQ=255) cTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTg > 1:622770/1‑150 (MQ=255) cTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTg < 2:44647/150‑1 (MQ=255) tgatgaTTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGa > 1:1561925/1‑150 (MQ=255) tgatTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAata > 1:1159749/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTc < 2:807274/150‑1 (MQ=255) gccgccCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCgg < 1:117320/150‑1 (MQ=255) gTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCg < 1:1230834/150‑1 (MQ=255) tgtgGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGt > 1:1420043/1‑150 (MQ=255) gacgATCATGAGTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCg < 2:1553200/132‑1 (MQ=255) gacgATCATGAGTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCg > 1:1553200/4‑135 (MQ=255) gacgATCATGAGTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTa > 2:1205685/4‑150 (MQ=255) tgGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAg > 2:321427/1‑150 (MQ=255) ggATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGa > 1:176692/1‑150 (MQ=255) cgATCATGAGTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGa > 2:1104704/2‑150 (MQ=255) aTCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGaaa < 1:132635/150‑1 (MQ=255) aTGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGAAAGAt > 2:472020/1‑150 (MQ=255) tGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTa < 2:642865/142‑1 (MQ=255) tGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTa > 1:642865/1‑142 (MQ=255) cTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGAAAGATCGTc > 2:1152569/1‑150 (MQ=255) | CCCACGGGAAGCCGCCGTTCAGGTCAGAGACAGAGCCCAGACCGAACACCAGACGCTTCACAATCAGGAGCATACAGATGACGATTAACGGTCCAAAAATCATGACCGGTTTACTGATGATTTTGCCGCCCAGCGGTTGTGGATCATGACTCATGATCGTCTCCTCCGTCGTGATGGTCGTTTTTGGTGTTGCGACGAACCAGCACGGTTAAGCCCGCCAGCACAGCCAGTGGTAGCATCATGCCTTTATACAGGGTGTGTTGAATATTTTCGGAACGCGCACCGGTAGAAAGATCGTC > NC_000913/3144011‑3144309 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |