Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,167,881 | 0 | C | A | 6.6% | 367.1 / 8.4 | 111 | K122N (AAG→AAT) | mqsA | antitoxin of the MqsRA toxin‑antitoxin system/DNA‑binding transcriptional repressor MqsA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/47); new base A (2/6); total (58/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.49e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
GAGAAATTATAAGCCCAACAACAATACGCCTGTGGCATTGTTCGCTCAAACTTATCGCGAGTGATTTGGCTCACACTCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGTTGCCCCCGCTTTTCCATTAATTAACGGATTTCATTCAATAGTTCTGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACTATAAA > NC_000913/3167733‑3168030 | gagaAATTATAAGCCCAACAACAATACGCCTGTGGCATTGTTCGCTCAAACTTATCGCGAGTGATTTGGCTCACACTCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGTTGCCCCCGCTTTTCCATTAATTAACTGATTTCATTCAATAGTTCTGGATGCt < 2:1547320/150‑1 (MQ=255) gagaAATTATAAGCCCAACAACAATACGCCTGTGGCATTGTTCGCTCAAACTTATCGCGAGTGATTTGGCTCACACTCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGTTGCCCCCGCTTTTCCATTAATTAACGGATTTCATTCAATAGTTCTGGATGCt < 1:67820/150‑1 (MQ=255) gaAATTATAAGCCCAACAACAATACGCCTGTGGCATTGTTGGCTCAAACTTATCGCGAGTGATTTGGCTCACACTCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGTTGCCCCCGCTTTTCCATTAATTAACGGATTTCATTCAATAGTTCTGGATGCTTa < 1:104623/150‑1 (MQ=255) 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gTTCTGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCt > 2:1095715/1‑150 (MQ=255) tCTGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTc > 2:1169353/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCa > 2:1193967/1‑150 (MQ=255) tGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCAc > 1:1333515/1‑150 (MQ=255) ggATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACt > 2:1008607/1‑150 (MQ=255) ggATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACt > 1:724032/1‑150 (MQ=255) gATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACta < 1:1159780/150‑1 (MQ=255) tGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCg > 2:1230172/1‑137 (MQ=255) tGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCg < 1:1230172/137‑1 (MQ=255) tGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACtata < 2:1585568/150‑1 (MQ=255) cTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACTATaaa > 2:1239304/1‑150 (MQ=255) cTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACTATaaa > 2:1613937/1‑150 (MQ=255) | GAGAAATTATAAGCCCAACAACAATACGCCTGTGGCATTGTTCGCTCAAACTTATCGCGAGTGATTTGGCTCACACTCCGGTAAAGAAAAAAGCGAGTTGCCCCCGCTTTTCCATTAATTAACGGATTTCATTCAATAGTTCTGGATGCTTATCCAGAACACGTAAAAGTTTGATTGTGGAAGGATGAGGTTGGGCATTGCCTTTTTCGTAACGCGAAAACGCATTTACACCTCCCCCAAAAATTTCGCTTGCCTCTTTTTGGGTAAGAGAGAGCTTTTTTCGAACCTTCACTATAAA > NC_000913/3167733‑3168030 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |