| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,253,288 | T→A | 9.4% | intergenic (+21/+30) | yhaI → / ← yhaJ | putative inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional activator YhaJ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,253,288 | 0 | T | A | 9.4% | 255.9 / 14.9 | 96 | intergenic (+21/+30) | yhaI/yhaJ | putative inner membrane protein/DNA‑binding transcriptional activator YhaJ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/48); new base A (4/5); total (43/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-01 | |||||||||||
AGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGAC > NC_000913/3253141‑3253437 | aGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTc < 2:576805/150‑1 (MQ=255) gTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGc < 2:1331018/150‑1 (MQ=255) tGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGcc < 1:969517/150‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGAAATATCGcccc < 2:940637/150‑1 (MQ=255) gCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGAAATATCGccccaattc < 1:1361045/150‑6 (MQ=255) cTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGAAATATCGccccaattcta < 1:1097062/150‑8 (MQ=255) cTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGAAATATCGccccaattcta < 1:76255/150‑8 (MQ=255) cTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGAAATATCGccccaattcta < 1:1405972/150‑8 (MQ=255) ttGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAGACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt < 2:704399/150‑1 (MQ=255) ttGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatt > 2:743709/1‑150 (MQ=255) tGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTttatta < 2:175313/150‑1 (MQ=255) gCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTaa > 1:159608/1‑150 (MQ=255) gCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTaa > 1:165336/1‑150 (MQ=255) ctctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTTTAAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAAc > 2:1554867/1‑150 (MQ=255) ctctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAAc < 1:216922/150‑1 (MQ=255) ctTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaa > 2:481077/1‑150 (MQ=255) ttttttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTGTGGCTGCAATCGTTTCGGAAACGATCCGATGTTTGGTTGAATTTATTCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACatt > 1:822735/1‑148 (MQ=255) ttttttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaat > 2:1503874/1‑150 (MQ=255) tttttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaata < 1:949714/150‑1 (MQ=255) tttttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCAGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaata > 1:992057/1‑150 (MQ=255) tttGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACaataat < 2:1410924/150‑1 (MQ=255) tCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATaataaata > 2:319595/1‑150 (MQ=255) cGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAAtatt > 2:36604/1‑150 (MQ=255) cGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAAtatt < 1:1391783/150‑1 (MQ=255) tggctggcTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCtttt < 1:1035082/123‑1 (MQ=255) tggctggcTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCtttt > 2:1035082/1‑123 (MQ=255) ggctggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCAAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTc > 1:28144/1‑148 (MQ=255) ggctggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCAAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTc < 2:28144/148‑1 (MQ=255) tggctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTa > 1:533930/1‑150 (MQ=255) gctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaa > 2:685441/1‑150 (MQ=255) ctCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTaaaa > 2:828061/1‑150 (MQ=255) cGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGTCATCAATCGTTACGGAAACGATCAGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAg < 1:762611/150‑1 (MQ=255) gTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGt < 2:1171210/150‑1 (MQ=255) tGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACa > 1:971031/1‑120 (MQ=255) tGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACa < 2:971031/120‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTg > 1:665554/1‑150 (MQ=255) ttCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTgg < 2:1259447/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTggg < 1:1610471/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTggg < 2:565726/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGaa > 2:184329/1‑150 (MQ=255) tGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGaa < 2:831157/150‑1 (MQ=255) tGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGaa < 2:992057/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTg < 1:603747/144‑1 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTg > 2:603747/1‑144 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAAtt > 2:295044/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAAtt > 2:707083/1‑150 (MQ=255) ttttCTCCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTccc < 1:20774/150‑1 (MQ=255) tttCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCg > 1:714474/1‑150 (MQ=255) cTGCCCAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAg < 2:452723/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAg < 1:685441/150‑1 (MQ=255) cTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAg > 1:414526/1‑150 (MQ=255) cacaGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGaca < 1:319595/150‑1 (MQ=255) acaGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGATTTTCCCGCAGacac > 1:579061/1‑150 (MQ=255) caGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACAcc > 2:478486/1‑150 (MQ=255) caGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACAcc < 2:714474/150‑1 (MQ=255) aGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCCGACACCa > 2:1333591/1‑150 (MQ=255) aaGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAgg < 2:1369616/150‑1 (MQ=255) tCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCt < 2:819404/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTcc > 2:146665/1‑150 (MQ=255) cagcaATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTcccc > 2:359616/1‑150 (MQ=255) aaTCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATa > 1:1285170/1‑150 (MQ=255) aTCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATAc < 1:1249447/150‑1 (MQ=255) cGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCacg > 2:617291/1‑150 (MQ=255) cGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTATGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGAGTTCTCTTCCCCCATACTGTCacc > 2:1294115/1‑149 (MQ=255) gATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAg > 1:186865/1‑150 (MQ=255) tCCGAAGTTTGTTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGc < 2:1401274/150‑1 (MQ=255) ccGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGcc < 2:991819/150‑1 (MQ=255) ccGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGcc < 2:1303365/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCat < 1:1503874/150‑1 (MQ=255) gAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCat > 2:1048762/1‑150 (MQ=255) ttGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCataataa < 1:184329/150‑1 (MQ=255) ggTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCataataata < 1:478486/150‑1 (MQ=255) gTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAatat < 2:631994/150‑1 (MQ=255) ttCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATc < 1:1554867/150‑1 (MQ=255) tCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCg < 1:481077/150‑1 (MQ=255) tCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCg > 1:894403/1‑150 (MQ=255) cAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGa < 1:707083/150‑1 (MQ=255) aaTTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGAtc > 1:687104/1‑150 (MQ=255) ttAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGCCGCCAGGCCATAATAATATCGAtctc > 1:822084/1‑150 (MQ=255) aaTCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGc < 1:295044/150‑1 (MQ=255) tAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTc < 2:665554/150‑1 (MQ=255) ataaaaaggggCGAAATATCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGCCACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTc > 1:90116/8‑150 (MQ=255) ataaaaaggggCGAAATATCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGCAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCACCATACAGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTc > 2:923470/8‑150 (MQ=255) aaTTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACTCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGAt < 1:1444272/150‑1 (MQ=255) aTTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGAtt < 2:579061/150‑1 (MQ=255) aaggggCGAAATATCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCACGCAGACACCAGGATTTCGCTTCACCCATACTGTCACGACGACAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGACGAATc > 1:470265/3‑150 (MQ=255) aggggCGAAATATCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTcc > 1:133164/2‑150 (MQ=255) gggCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCgg < 1:528292/150‑1 (MQ=255) gggCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCgg > 1:1410946/1‑150 (MQ=255) ggCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCggg < 1:1271449/150‑1 (MQ=255) gccGATATTTCGCCCCTTTTTATAAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCggg < 2:822735/148‑1 (MQ=255) gCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGc < 2:165336/150‑1 (MQ=255) gCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGc < 2:159608/150‑1 (MQ=255) gATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTg < 1:707481/150‑1 (MQ=255) atatTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATATTAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTga > 2:1120689/1‑150 (MQ=255) atatTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTga > 2:292201/1‑150 (MQ=255) tttCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTgacga > 1:970920/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTgacgac < 2:533930/150‑1 (MQ=255) | AGGTGCCTGGGCCTTGCTCTTTTTTGTTCCGTTTATTGGCTGGCTCGTGCTTCTGGTTTTTTTCTGCACAGAAGGTACTTCTGGCAGCAATCGTTACGGAAACGATCCGAAGTTTGGTTCAAATTAATCTTAGAATTGGGGCGATATTTCGCCCCTTTTTATTAACAATAATAAATATTATTTTCCGTTAAAAAGTTTGGGAATTTCCCGCAGACACCAGGATTTCGCTTCCCCCATACTGTCACGACGCCAGGCCATAATAATATCGATCTCGCTGGTCGATTCCGGGCTGACGAC > NC_000913/3253141‑3253437 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |