| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,295,238 | C→T | 6.7% | N613N (AAC→AAT) | lpoA → | outer membrane lipoprotein ‑ activator of MrcA activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,295,238 | 0 | C | T | 6.7% | 326.2 / 8.3 | 104 | N613N (AAC→AAT) | lpoA | outer membrane lipoprotein ‑ activator of MrcA activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/47); new base T (5/2); total (55/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACAGGA > NC_000913/3295089‑3295386 | gCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAAc < 1:1062894/150‑1 (MQ=255) cggaaatccgggccagcggtcccttgcgcacggcgggagctggcCCGGAGTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTCCCGGTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAAGAACg > 1:1075787‑M2/45‑150 (MQ=255) cAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACg < 2:778407/150‑1 (MQ=255) cAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACg < 1:852426/150‑1 (MQ=255) aCGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGat < 1:1503736/150‑1 (MQ=255) ccgggccagcggtcccttgcgcactgcgggagctggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTc > 1:734110‑M2/38‑150 (MQ=255) cgggccagcggtcccttgcgcactgcgggagctggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCa > 2:1345429‑M2/37‑150 (MQ=255) cGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACt > 2:418725/1‑150 (MQ=255) GCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTg < 2:658461‑M1/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCCGCAGTTCGCAATGGACAGCTGGCCCGGATTTCCGACTTGAGATGGAATTCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATTCTGTCAGGCTGTAATCTACCGTTAATTCAGCAGGCAGTCAGCTAGGTGAATAATCGTTATTCAccgcg < 2:329177/150‑5 (MQ=255) CAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGc > 2:1478819‑M1/1‑150 (MQ=255) CTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCg > 1:1503247‑M1/1‑150 (MQ=255) tCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGc < 1:1114057/150‑1 (MQ=255) gCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGt > 2:1196629/1‑150 (MQ=255) gCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGt > 1:1204273/1‑150 (MQ=255) gTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATg < 2:1478851/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGa < 2:269098/150‑1 (MQ=255) cgcAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGa > 2:452651/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATggg > 1:1415953/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATggg > 2:588520/1‑150 (MQ=255) aGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATggg < 1:297416/150‑1 (MQ=255) gggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGc > 2:467754/1‑150 (MQ=255) ggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCg > 2:456905/1‑150 (MQ=255) ggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCg < 2:6110/150‑1 (MQ=255) ggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCg > 1:6110/1‑150 (MQ=255) ggACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCg < 1:452651/150‑1 (MQ=255) gACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGt > 1:206782/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCa < 2:32106/132‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCa > 1:32106/1‑132 (MQ=255) gctggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGAt > 1:708276‑M2/7‑150 (MQ=255) ctggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATg < 2:1075265‑M2/145‑1 (MQ=255) ggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGcc < 2:940440‑M2/147‑1 (MQ=255) ggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGcc > 1:233572‑M2/4‑150 (MQ=255) ggcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGcc < 1:1582097‑M2/147‑1 (MQ=255) gcCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCt < 1:1193011‑M2/148‑1 (MQ=255) cCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTg < 2:18177‑M2/149‑1 (MQ=255) cgtaTTTCCTACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCTAAATCCCGATGCTGGCTGGCTGTATTCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGTGCGTCGATGCCTTGt < 2:1141476/147‑1 (MQ=255) cGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGt > 2:1274235/1‑150 (MQ=255) ttCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTg < 1:986236/150‑1 (MQ=255) tCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTgg > 2:215814/1‑150 (MQ=255) tCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTgg > 1:1158569/1‑150 (MQ=255) tCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTgg < 1:1631153/150‑1 (MQ=255) ccGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGc < 1:272974/150‑1 (MQ=255) cgcgaTGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCa > 1:239210/4‑150 (MQ=255) aTGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTtc < 1:1286272/150‑1 (MQ=255) ggAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGc > 1:1078590/1‑111 (MQ=255) ggAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGc < 2:1078590/111‑1 (MQ=255) ggAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTtctc < 1:1196570/150‑1 (MQ=255) gAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTca < 2:433176/150‑1 (MQ=255) tGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATgc < 2:1482913/150‑1 (MQ=255) gCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATgcg < 2:1590627/150‑1 (MQ=255) cAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGt > 1:933154/1‑150 (MQ=255) cAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGt > 1:471778/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTc > 1:1144974/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTc > 1:341085/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTc > 1:948336/1‑150 (MQ=255) gCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAAT‑ACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCa > 2:735793/1‑150 (MQ=255) gAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAg > 2:1103156/1‑150 (MQ=255) cccGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGttt > 2:1054847/1‑150 (MQ=255) cccGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGttt > 2:108163/1‑150 (MQ=255) cccGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGttt > 2:1440775/1‑150 (MQ=255) cGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCAAGGTTCAGGGTTTTg > 1:231948/1‑150 (MQ=255) tGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGaaa < 2:471778/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATc > 2:566293/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCa < 2:206782/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTAATCTGCCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACgg < 1:1429532/150‑1 (MQ=255) ggCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGt < 1:830037/150‑1 (MQ=255) gCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTa < 2:1415953/150‑1 (MQ=255) cGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTaa > 2:1614765/1‑150 (MQ=255) gTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATa > 1:1543833/1‑150 (MQ=255) tAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATAc < 1:692570/150‑1 (MQ=255) aaTCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATAcc > 2:746090/1‑150 (MQ=255) cTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAATTCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGa < 1:1196629/150‑1 (MQ=255) aCCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAg > 2:1525958/1‑150 (MQ=255) ttAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTg > 1:64535/1‑150 (MQ=255) aTGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACg < 1:215814/150‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATg < 2:808483/69‑1 (MQ=255) tGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATg > 1:808483/1‑69 (MQ=255) gcagGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTaa > 1:1353659/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTg > 1:1290562/1‑150 (MQ=255) cAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTg > 2:805994/1‑150 (MQ=255) gcgcGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCg < 2:243366/150‑1 (MQ=255) agccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCg > 1:344836/6‑150 (MQ=255) gccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGt > 1:1291006/5‑150 (MQ=255) gccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGt > 2:589301/5‑150 (MQ=255) gccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGt > 1:1444809/5‑150 (MQ=255) cgcgGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGt < 1:318576/150‑1 (MQ=255) ccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACg < 1:117317/129‑1 (MQ=255) ccagTGAATAATCGTTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACg > 2:117317/4‑132 (MQ=255) ggTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGAt < 2:221735/150‑1 (MQ=255) ggTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGAt < 1:1103156/150‑1 (MQ=255) ggTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGAt < 1:1274235/150‑1 (MQ=255) ggTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGAt < 2:346891/150‑1 (MQ=255) gTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGAtt > 2:763337/1‑150 (MQ=255) tGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTa < 2:1222876/150‑1 (MQ=255) gAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGCCGGCTAACCCGGATTGCGTGATTaa > 2:804896/1‑150 (MQ=255) aTAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACa > 2:43986/1‑150 (MQ=255) tAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACAg < 1:418725/150‑1 (MQ=255) aaCGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACAgg < 1:1614765/150‑1 (MQ=255) aCGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACAGGa < 1:994234/150‑1 (MQ=255) | GCAACGCTGTACGCCAGCTCCCGCAGTGCGCAAGGGACCGCTGGCCCGGATTTCCGACTGGAGATGGAAGGCTTGCAGTACAGCGAAATCCCGATGCTGGCAGGCGGTAATCTACCGTTAATGCAGCAGGCACTCAGCGCGGTGAATAACGATTATTCACTGGCTCGCATGTATGCGATGGGCGTCGATGCCTGGTCGCTGGCAAATCATTTCTCACAAATGCGCCAGGTTCAGGGTTTTGAAATCAACGGTAATACCGGAAGCCTGACGGCTAACCCGGATTGCGTGATTAACAGGA > NC_000913/3295089‑3295386 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |