Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 414,827 | A→C | 6.7% | I309M (ATT→ATG) | sbcC ← | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 414,827 | 0 | A | C | 6.7% | 365.7 / 14.9 | 120 | I309M (ATT→ATG) | sbcC | ATP dependent, structure specific DNA nuclease ‑ SbcC subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (61/50); new base C (2/6); total (63/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.46e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 |
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GGAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATGCGCCAGCGCCGCGCTGTGTTCTGCGATGCGTTCCCAGTGTGGACGAAGATTTCGTGCCGGTTGTGCCAGACTAAGCGCCGCCAGTTGAGGTTGCGCTTTTTCTTCTTCGGCTAACGCCTGTTGCAAGGCCTGCTGACGGCGGCT > NC_000913/414679‑414976 | ggAAGCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGaa > 1:27986/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATg < 2:854625/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGTGTTCCTGTAACCAGGTATTCAGGCTTTGTTGCTGCTGCTGTAATTCTGCTGACTGCTTCGCCGCGTGGTGGCGAATGCTCGCGCGAAGCGCCATTGTGCTCTGTAAGCGAGTATTTACTTCTTCAATCTGCTGGCGAATATg < 1:798203/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |