| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,636,747 | T→C | 8.8% | T222A (ACC→GCC) | yhiN ← | putative oxidoreductase YhiN |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,636,747 | 0 | T | C | 8.8% | 249.7 / 12.5 | 91 | T222A (ACC→GCC) | yhiN | putative oxidoreductase YhiN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (40/43); new base C (3/5); total (43/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.17e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.60e-01 | |||||||||||
GCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACC > NC_000913/3636600‑3636894 | gctgctCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGc > 1:366199/1‑150 (MQ=255)gctgctCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGc > 2:321552/1‑150 (MQ=255) tgctCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCg > 1:1545431/1‑150 (MQ=255) gctCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCGCCGt > 1:1484840/1‑150 (MQ=255) cATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGtttt > 1:684231/1‑150 (MQ=255) cATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGtttt > 2:318097/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTc < 2:684231/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGc > 2:223291/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGc > 1:1461396/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGc > 2:91737/1‑150 (MQ=255) cAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCACCGTTTTccgt < 2:257851/150‑4 (MQ=255) aGGACGGTTTCGAGGTCCACATGCGGTAGCAGTTTTATGCTGACAAATTCCCCAGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCACCGTTTTccgtg < 1:1366597/150‑5 (MQ=255) aGGAAGGTTTCGAGGTCCACTTCCGGTAGCAGATTGATGCTGACATATTCCCCGGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTATGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCg < 1:42910/150‑1 (MQ=255) aGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCACCGTTTTccgtg < 2:88297/150‑5 (MQ=255) ggAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTTACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCgg < 1:1407416/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCgg < 1:356665/150‑1 (MQ=255) ggAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCACCGTTTTccgtga < 1:897120/150‑6 (MQ=255) gAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGt > 1:375074/1‑150 (MQ=255) ttCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCAc > 1:491457/1‑150 (MQ=255) cGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACgg < 1:973405/150‑1 (MQ=255) ccACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATTACGGAAGGCa < 1:318097/150‑1 (MQ=255) ccACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCa > 2:648029/1‑150 (MQ=255) ccACATCCGGTAGCAGATTGATGATGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCa > 1:1087307/1‑150 (MQ=255) aagaTCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTTGCTTGAAATCTGCAACACCGGCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGTAAAACGGTGCAGTTTTGAGCGGGAATCACGGAAGGCAc < 2:1307228/147‑1 (MQ=255) gTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACAGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCAcgc < 2:5089/150‑1 (MQ=255) cAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCAcgcccgc > 2:403856/1‑150 (MQ=255) aGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCAcgcccgcc < 1:897389/150‑1 (MQ=255) gATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCa < 1:771920/150‑1 (MQ=255) tGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCa < 1:206903/150‑1 (MQ=255) atgatgACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGACCGCCAGCAcc < 2:1087307/150‑1 (MQ=255) cTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTc > 2:810175/1‑107 (MQ=255) cTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTc < 1:810175/107‑1 (MQ=255) cTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGt > 1:1592875/1‑150 (MQ=255) tGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTa > 1:1495265/1‑150 (MQ=255) cAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAAct < 2:715631/150‑1 (MQ=255) aaTTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAActct > 2:923843/1‑150 (MQ=255) ttCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCCCGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTc > 2:802513/1‑150 (MQ=255) ccccGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAg > 2:1437216/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCa < 2:1461396/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAAc < 1:703215/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAAc < 2:1545431/150‑1 (MQ=255) ccAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGttt < 2:375074/150‑1 (MQ=255) ccAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGttt < 2:565678/150‑1 (MQ=255) gtgagaacttactcttcacccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTa > 2:481131‑M2/48‑150 (MQ=255) gaacttactcttcacccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCCCCGCCCCGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCACCGGTTTATGCa > 1:1314745‑M2/44‑150 (MQ=255) tGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGt < 1:403856/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGCGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGa < 2:1484840/150‑1 (MQ=255) ctcttcacccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCCCGGAAACCGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGaa > 2:836576‑M2/37‑150 (MQ=255) tcttcacccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAAt > 2:1619546‑M2/36‑150 (MQ=255) aTCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTg > 1:817200/1‑147 (MQ=255) aTCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTg < 2:817200/147‑1 (MQ=255) tCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATg < 1:923843/150‑1 (MQ=255) cTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATgg > 2:1264719/1‑150 (MQ=255) tGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGc > 2:718135/1‑150 (MQ=255) tGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGc > 2:752963/1‑150 (MQ=255) gCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGAGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTCTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCa > 2:209664/1‑150 (MQ=255) cacccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCCCGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGgcc > 1:1433188‑M2/32‑149 (MQ=255) cAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCAc < 1:1047060/150‑1 (MQ=255) acccaccgcggcttgtctggaccggcggtgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCAc > 2:308127‑M2/31‑150 (MQ=255) aaCACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCCGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCAcc < 2:546571/150‑1 (MQ=255) agACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGACACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCa > 1:1538407‑M1/3‑150 (MQ=255) GCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGAccc < 2:622273‑M1/150‑1 (MQ=255) cgGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCcgc < 1:1133653/150‑1 (MQ=255) cAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCggg < 2:230046/150‑1 (MQ=255) cAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCggg < 2:366199/150‑1 (MQ=255) cAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCggg < 1:342798/150‑1 (MQ=255) aGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACg > 2:59908/1‑67 (MQ=255) aGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACg < 1:59908/67‑1 (MQ=255) gACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGCCCCGCGCGAGTc > 1:208980/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGGATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgc < 1:305022/150‑1 (MQ=255) aaGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgc > 2:641470/1‑150 (MQ=255) aaGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgc < 1:648029/150‑1 (MQ=255) aGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgca < 2:1592875/150‑1 (MQ=255) gCCGCGGTGGGGGAAGATTAAGTCCTCACGGAAACCGGTGCCGCGTTCAGCGGCACTCACTGAAGGCACCGCCACGCCCGCCACCACCTGTACCTCAGCGCGCACCGGTCATTGCAGACCCCCTGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGgcag < 2:730371/150‑1 (MQ=255) tgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTg < 1:1591379‑M2/148‑1 (MQ=255) tgGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGAACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTg < 2:1227410‑M2/148‑1 (MQ=255) gGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGa > 2:642201‑M2/2‑150 (MQ=255) tgAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGATGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTTAGGc < 1:1626128/150‑1 (MQ=255) tgAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGc < 1:638276/150‑1 (MQ=255) tgAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGc < 2:975408/150‑1 (MQ=255) tAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTg > 2:1269878/1‑150 (MQ=255) aaGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGt > 2:1355220/1‑150 (MQ=255) gTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTc < 1:832203/150‑1 (MQ=255) tcACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCa > 2:535531/1‑150 (MQ=255) cgctgAAAACGGCACCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGATTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCaa > 2:212046/5‑150 (MQ=255) cACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCaa > 1:1303399/1‑150 (MQ=255) gctgAAAACGGCACCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAAt > 1:1108088/4‑150 (MQ=255) cGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATc > 2:1575748/1‑150 (MQ=255) ggAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCt < 1:466677/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc < 1:91737/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAAcc < 1:1264719/150‑1 (MQ=255) | GCTGCTCATTCAGGAAGGTTTCGAGGTCCACATCCGGTAGCAGATTGATGCTGACAAATTCCCCCGGTTGCCAGTAGCTTGAAATCTGCAACACCGCCGGTCCAGACAAGCCGCGGTGGGTGAAGAGTAAGTTCTCACGGAAAACGGTGCCGTTTTCAGCGGTAATCACGGAAGGCACCGCCACGCCCGCCAGCACCTGTAACTCTTCGAGCAACGGTTTATGCAGAGTGAATGGCACCAGACCCGCGCGGGTCGGCAGCACGTTGAGGCCAAATTGTTCGGCAATCTTATAACC > NC_000913/3636600‑3636894 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |