Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 429,553 | T→A | 7.4% | Y17N (TAT→AAT) ‡ | secF → | Sec translocon accessory complex subunit SecF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 429,553 | 0 | T | A | 7.4% | 284.7 / 9.0 | 94 | Y17N (TAT→AAT) ‡ | secF | Sec translocon accessory complex subunit SecF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/42); new base A (3/4); total (48/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGC > NC_000913/429407‑429701 | gACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATg < 2:1056962/150‑1 (MQ=255) gACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATg < 1:337988/150‑1 (MQ=255) cGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCATGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGAc > 2:723594/1‑150 (MQ=255) cGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGAc > 1:1001164/1‑150 (MQ=255) cGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGAc > 2:1174284/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa > 1:644966/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa > 1:744602/1‑150 (MQ=255) gATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTa < 2:453655/150‑1 (MQ=255) tGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATg > 2:1356523/1‑150 (MQ=255) gTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATgc < 2:644966/150‑1 (MQ=255) gTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacgg < 1:1173942/150‑4 (MQ=255) tttACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacggc < 1:174638/150‑5 (MQ=255) tACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCt > 2:1320253/1‑150 (MQ=255) tACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCATAGACTTTacggccg < 2:964376/150‑7 (MQ=255) aCCGCGATTGGCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGTCCGTAAAGTCATAGACTTTacggccgt < 1:950047/150‑8 (MQ=255) ccGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTgg < 1:1380112/150‑1 (MQ=255) cgcgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTggg < 1:974863/150‑1 (MQ=255) cgcgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTggg < 1:819280/150‑1 (MQ=255) cgcgATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTggg < 1:1231813/150‑1 (MQ=255) gATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGact < 2:776343/150‑1 (MQ=255) tGTCGGTACGAGTGCCATCGTAATCCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGGCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGAACAGGAATTTACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGactact < 2:1337316/150‑1 (MQ=255) gTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTg < 2:908659/150‑1 (MQ=255) cGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTggg > 1:1287553/1‑150 (MQ=255) cGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTggg < 2:778577/150‑1 (MQ=255) ggTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGc > 1:995626/1‑150 (MQ=255) gcgTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCg > 2:1401968/1‑150 (MQ=255) cATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCAtct < 1:1134300/150‑1 (MQ=255) cATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCAtct > 1:1618741/1‑150 (MQ=255) aTCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCAtctc < 1:555925/150‑1 (MQ=255) tAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGt < 2:384706/150‑1 (MQ=255) ccTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgc > 1:233095/1‑150 (MQ=255) cTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgct > 1:1462650/1‑150 (MQ=255) cTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgct > 1:82194/1‑150 (MQ=255) tGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTctgctg < 2:1001164/150‑1 (MQ=255) cTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 1:571806/150‑1 (MQ=255) agatGGCGGGAAGCGCGGCTATAAGCTGTAGCTGTGAGGAGGGGGATGTGGCTCAGGTATTTACTGTTCAACAACTTAACCAGGGCCGTAAACTCTATGCGTTTATGCGCGGCGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTaa < 2:494526/148‑1 (MQ=255) tatGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAAt < 1:1174518/150‑1 (MQ=255) tatGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAAt > 2:290300/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt < 1:1600519/145‑1 (MQ=255) tGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGtt > 2:1600519/1‑145 (MQ=255) ggcATGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCgctgc < 1:723594/150‑1 (MQ=255) ggcAAGCGCGGCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGGGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGGCTGCTGTTAATCgctgc < 2:1397606/150‑1 (MQ=255) cgcgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGt < 1:870631/150‑1 (MQ=255) cgTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGtta > 1:1565000/1‑150 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGttatta < 2:333799/150‑1 (MQ=255) cAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGttatta < 2:395577/150‑1 (MQ=255) agaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg > 2:274643/1‑150 (MQ=255) agaagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATg < 2:1462650/150‑1 (MQ=255) aagCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATggg < 2:33515/150‑1 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg > 1:1148044/1‑150 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg < 2:269008/150‑1 (MQ=255) gCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACAACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTATGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCg > 2:86765/1‑150 (MQ=255) tGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTg > 2:131866/1‑150 (MQ=255) gTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTgc < 2:1287553/150‑1 (MQ=255) aaTCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGcgcg < 1:1356523/150‑1 (MQ=255) tCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGc < 1:290300/150‑1 (MQ=255) ttaggacTGCGATTTGGCACAGGAATATACTGTTGAAAAAAAACACAACTGCCGTAATGTATATTAATTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCtt > 2:1508263/3‑150 (MQ=255) gaggagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCttt < 2:970935/150‑1 (MQ=255) aggaggGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCGGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGGGCGGCTTTa < 2:944969/150‑1 (MQ=255) gagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTa > 2:528211/1‑148 (MQ=255) gagTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATCGGCGTGCGCGGCTTTa < 1:528211/148‑1 (MQ=255) tGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTgg > 2:725420/1‑150 (MQ=255) gCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTggg > 1:209675/1‑150 (MQ=255) tgGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTgg > 2:306794/1‑150 (MQ=255) tgGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTgg > 2:642969/1‑150 (MQ=255) ggCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGa > 2:1563152/1‑150 (MQ=255) ggCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGa > 2:975050/1‑150 (MQ=255) cacaGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGAtt > 2:723650/1‑150 (MQ=255) aacaGGAATATACTGTTGAACAACTATACCACGGCCGTAAATTCTTTGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGTGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGTAtt < 1:1033743/149‑1 (MQ=255) ggAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCAc > 2:1571171/1‑150 (MQ=255) taCTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtgg > 2:1343819/1‑150 (MQ=255) taCTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCggtgg < 2:233095/150‑1 (MQ=255) tGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGt > 1:490032/1‑150 (MQ=255) tGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGt < 1:1563152/150‑1 (MQ=255) tGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGt > 1:743610/1‑150 (MQ=255) gAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGtt > 1:958727/1‑150 (MQ=255) gAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGtt > 2:145389/1‑150 (MQ=255) gAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGtt > 2:811650/1‑150 (MQ=255) caacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAtt < 1:1401968/150‑1 (MQ=255) caacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTAtt > 2:1035488/1‑150 (MQ=255) aacTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTg < 2:958727/150‑1 (MQ=255) acTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGa > 2:1244832/1‑150 (MQ=255) acTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGa > 1:601191/1‑150 (MQ=255) ccACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTAc > 1:1610917/1‑150 (MQ=255) cACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGTGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACg < 2:995626/150‑1 (MQ=255) aCGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACgg > 1:323960/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGc > 1:96155/1‑150 (MQ=255) gcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGa > 2:317150/4‑150 (MQ=255) gcatAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGATTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATAGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGa > 2:285328/4‑150 (MQ=255) catAAAGTCATAGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaa > 1:24601/3‑150 (MQ=255) aaaGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaaaaa > 2:412290/1‑150 (MQ=255) aaaGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGaaaaa > 2:879833/1‑150 (MQ=255) cTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGc < 1:1244832/150‑1 (MQ=255) cTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGc < 1:1174284/150‑1 (MQ=255) | GACGTCGATGTTTACCGCGATTGTCGGTACGCGTGCCATCGTAAACCTGCTATATGGCGGCAAGCGCGTCAAGAAGCTGTCAATCTGAGGAGTGCGATGTGGCACAGGAATATACTGTTGAACAACTAAACCACGGCCGTAAAGTCTATGACTTTATGCGCTGGGACTACTGGGCTTTCGGCATCTCTGGTCTGCTGTTAATCGCTGCTATCGTTATTATGGGCGTGCGCGGCTTTAACTGGGGGCTGGATTTCACCGGTGGTACGGTTATTGAAATTACGCTCGAAAAACCGGC > NC_000913/429407‑429701 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |