| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,672,993 | C→A | 5.2% | P194T (CCG→ACG) | yhjC → | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhjC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,672,993 | 0 | C | A | 5.2% | 304.1 / 2.3 | 90 | P194T (CCG→ACG) | yhjC | putative DNA‑binding transcriptional regulator YhjC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/43); new base A (3/2); total (45/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTGGCGCGTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCG > NC_000913/3672847‑3673141 | caggCGCGTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGc > 1:1203636/3‑150 (MQ=255) gcgcGTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCAcc < 1:333734/150‑1 (MQ=255) cgcgTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCt > 1:389070/1‑150 (MQ=255) gTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCACACCTggg < 1:963852/150‑1 (MQ=255) gTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGGTGTATAACGCActattg < 2:362684/150‑6 (MQ=255) tACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGgtg < 1:1609749/150‑1 (MQ=255) tACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGGTGTATAACGCActattgcg < 1:1169794/150‑8 (MQ=255) aCCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGgtgt > 1:1400020/1‑150 (MQ=255) ccGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTa < 1:1578132/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTa > 1:571056/1‑150 (MQ=255) tGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGtt < 1:1173788/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGtt > 2:284085/1‑150 (MQ=255) cGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAgg > 2:250785/1‑150 (MQ=255) gTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGt < 2:853274/150‑1 (MQ=255) ttATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGtt > 1:512875/1‑150 (MQ=255) aTCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGtttt > 2:298966/1‑150 (MQ=255) cGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGa > 1:1108831/1‑150 (MQ=255) cGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGa > 2:437044/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAg > 2:1254076/1‑150 (MQ=255) gCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAg < 1:486225/150‑1 (MQ=255) ccccTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGcc < 2:1554634/150‑1 (MQ=255) ccccTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGcc < 2:1203636/150‑1 (MQ=255) cccTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCa > 1:27421/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAg < 1:800024/150‑1 (MQ=255) cTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGc > 2:1368679/1‑150 (MQ=255) cTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGc < 2:763563/150‑1 (MQ=255) cGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGt < 2:234704/150‑1 (MQ=255) ggCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCGCACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGtt > 2:201384/1‑150 (MQ=255) gcacagttGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGtt > 1:896277/8‑150 (MQ=255) gCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTa < 1:1252862/150‑1 (MQ=255) cAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTaa > 2:1378480/1‑150 (MQ=255) aaCTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATg > 1:295898/1‑150 (MQ=255) aaCTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATg < 1:770608/150‑1 (MQ=255) aTGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAg < 1:288375/150‑1 (MQ=255) tGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGt < 2:839398/150‑1 (MQ=255) ggTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTg < 1:284085/150‑1 (MQ=255) gcAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTGATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGGTAATGGCGTCCAGTGGt < 2:1590854/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACCCGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTaa > 2:1378869/1‑150 (MQ=255) ccAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGACGTTGCCAGCCTTAATCGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTg > 1:500567/1‑150 (MQ=255) gTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcg < 2:1340733/150‑1 (MQ=255) tCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcgg > 2:315892/1‑150 (MQ=255) ccGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTggcggc > 2:580006/1‑150 (MQ=255) aTCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGa > 2:46332/1‑150 (MQ=255) cTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACg > 2:265913/1‑150 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACgg > 2:16047/1‑150 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACgg < 1:1404644/150‑1 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACgg < 1:437044/150‑1 (MQ=255) tGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACgg > 1:288934/1‑150 (MQ=255) aCGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAAt > 1:1115338/1‑111 (MQ=255) aCGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAAt < 2:1115338/111‑1 (MQ=255) cgcTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAAc < 1:265913/150‑1 (MQ=255) tttGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGt > 1:1464594/1‑150 (MQ=255) ggTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGc < 2:561108/150‑1 (MQ=255) gTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCg < 1:410775/150‑1 (MQ=255) gTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCg < 1:410778/150‑1 (MQ=255) tATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGaa < 1:1368679/150‑1 (MQ=255) ccGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAAc > 2:420028/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACt > 2:162970/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACt > 1:887794/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTAt > 2:879206/1‑150 (MQ=255) cAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTAt > 2:565246/1‑150 (MQ=255) ccccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCAc < 2:896277/150‑1 (MQ=255) ccGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCAccg > 1:1321183/1‑150 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGTCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCgg < 1:1056342/150‑1 (MQ=255) tgatCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCgg < 2:27421/150‑1 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTc < 2:1344090/150‑1 (MQ=255) atCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTc > 1:842142/1‑150 (MQ=255) cTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCtt > 1:711438/1‑150 (MQ=255) aCTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGcc < 1:1378480/150‑1 (MQ=255) ttCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCgg < 2:735283/150‑1 (MQ=255) cacaCGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTc < 2:295898/150‑1 (MQ=255) cacGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCGAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTg > 1:60822/1‑150 (MQ=255) cacGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTg < 1:734785/150‑1 (MQ=255) cGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTggg < 1:315892/150‑1 (MQ=255) 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caggTGCGGTGTATAACGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGatt > 1:392691/4‑150 (MQ=255) tAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGatta > 1:1261138/1‑150 (MQ=255) tGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTc < 2:887794/150‑1 (MQ=255) tGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTc < 2:1400020/150‑1 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAg < 2:571056/150‑1 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAg < 1:46332/150‑1 (MQ=255) cGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAg > 2:112367/1‑150 (MQ=255) gTTTTACACCGCACCTTGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAATACTATCTCACCGCCTGTCTTGCCGGTCTTTGGATTATTgaga < 2:1245629/150‑1 (MQ=255) gTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGa > 1:788339/1‑150 (MQ=255) ttATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGAt > 2:1185395/1‑150 (MQ=255) taCACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATccc > 2:1526514/1‑150 (MQ=255) acacCGCACCTGGGTGTACATCCCTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCAAGTGGATTAAGTCTGGCTGCATGTAGACGGTAAACAGTAGCGAAAAGTTTCTCAAAGCATGTCTAGCGGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcg > 2:878761/1‑150 (MQ=255) cacCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcgc < 1:201384/150‑1 (MQ=255) acCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcgcg < 2:836121/150‑1 (MQ=255) acCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCcgcg > 1:363950/1‑150 (MQ=255) | CTGGCGCGTTACCGGAAGATGGCGTTATCGCCCGTCCCCTCGGCAAACTGACCATGGTCAACTGTGCCAGTCCGCACTATCTGACGCGCTTTGGTTATCCGCAAAGCCCCGATGATCTGACTTCACACGCAATAGTGCGTTATACACCGCACCTGGGTGTACATCCGTTAGGTTTTGAGGTTGCCAGCGTTAATGGCGTCCAGTGGTTTAAGTCTGGCGGCATGTTGACGGTAAACAGTAGCGAAAACTATCTCACCGCCGGTCTTGCCGGTCTGGGGATTATTCAGATCCCGCG > NC_000913/3672847‑3673141 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |