Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,790,300 | 0 | A | T | 10.1% | 344.5 / 23.4 | 119 | intergenic (‑219/+20) | waaH/tdh | UDP‑glucuronate:LPS(HepIII) glycosyltransferase/threonine dehydrogenase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.48e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TGAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATACCAGCCCTTGTTCGTGTTAATCCCAGCTCAGAATAACTTTCCCGGACTGGCCCGAACGCATAGCGTCAAAGCCCTTCTGGAAATCATCGATAGAGAAACGATGGGTAATGATCGGCGAAAGATCGAGGCCAGACTGAATCAGCG > NC_000913/3790151‑3790447 | tgAGATATTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGa < 1:1147305/150‑1 (MQ=255) tatatTATTTTTACAGGTGAGAGAGTCACTTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAATTACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTAGATATTTAACAGATTATCCTCAGATAAAAGGGCTGGAATa < 2:949186/149‑1 (MQ=255) atatTATTTTTACAGGTGAGAGAGACAATTCAGGGTAGAGAGATAATGAGAGCAGCTATATAAGAGATCAGCACAAATACGAACTCTTTATTACACTGACAGGATTTTACATATTTAACAGATTATACTCAGATAAAATTGCTGGAATaa > 2:601220/1‑149 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |