Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,802,106 | 0 | T | A | 7.3% | 422.9 / 16.7 | 137 | K318I (AAA→ATA) ‡ | waaO | UDP‑D‑glucose:(glucosyl)LPS alpha‑1,3‑glucosyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/73); new base A (4/6); total (58/79) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.45e-01 |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
AGGCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTG > NC_000913/3801957‑3802253 | aGGCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCtttt < 1:1630852/150‑1 (MQ=255) ggCTTTAACTTTATCTATCTCTAAGGCAGGAAATGAGTCAACAATGCTAACCTTATATCAATACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCATTATCTTTTCAAT‑AAATTAAAATGATAGTTGATAAAACCTATTAGATATATATCCttatta > 2:875599/1‑150 (MQ=255) gCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTa < 2:1001669/150‑1 (MQ=255) 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tAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCa < 2:658178/150‑1 (MQ=255) tAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCa > 2:325632/1‑150 (MQ=255) aaCTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCat < 2:784166/150‑1 (MQ=255) aCTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCata < 2:431269/150‑1 (MQ=255) cTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCatat > 1:201542/1‑150 (MQ=255) 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tatctatcTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGtt > 2:1408488/1‑150 (MQ=255) atctatctCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGttt < 2:399879/150‑1 (MQ=255) tctatctCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATTCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTAAAAAGCatagatatc < 2:1222864/150‑7 (MQ=255) tctatctCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTAAAAAGCatagatatc < 1:1150502/150‑7 (MQ=255) tatctCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTgc < 2:279052/150‑1 (MQ=255) 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tttttAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCttggtt > 2:39883/1‑150 (MQ=255) | AGGCTTTAACTTTATCTATCTCTATGGCAGGAAATGAGTCCACAATGCTACCCTTATATCATTACTTTATAGTTTCCCAGTTTTAATGCTTTATCTTTTCAATAAAATAAAAAAGATAGTTGCTAAATCCTTTTAGATATCTATGCTTTTTAAGCATATGTTTTGCGCTATATCTTAATTGATTGCTATTGTTCGGTTTCAGCAACGCCGTATTCTTCCATGGCGAAGCATTTTTTGCCTCCATAAAGGCTTGTGATACAGGATAATCCCAGGCCCAATCATGCCAGGGCTTGGTTG > NC_000913/3801957‑3802253 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |