Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,897,615 | T→C | 10.3% | L37P (CTG→CCG) ‡ | cbrB → | putative inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,897,615 | 0 | T | C | 10.3% | 345.4 / 24.8 | 128 | L37P (CTG→CCG) ‡ | cbrB | putative inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/61); new base C (2/11); total (55/73) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.94e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.19e-01 |
Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
GCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGCATA > NC_000913/3897466‑3897763 | gCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTGTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCt > 2:241109/1‑150 (MQ=255) cTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTg > 2:344576/1‑150 (MQ=255) tAAATTTGCGCTCAAATGTAATTTAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGt < 1:732716/150‑1 (MQ=255) 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GCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGCATA > NC_000913/3897466‑3897763 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |