| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 485,720 | A→G | 7.6% | intergenic (‑101/‑41) | acrA ← / → acrR | multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrA/DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 485,720 | 0 | A | G | 7.6% | 269.4 / 10.1 | 92 | intergenic (‑101/‑41) | acrA/acrR | multidrug efflux pump membrane fusion lipoprotein AcrA/DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/46); new base G (3/4); total (42/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.16e-01 | |||||||||||
TCAGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGA > NC_000913/485577‑485869 | tCAGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatg > 2:1445350/1‑150 (MQ=255)tCAGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATCCACAAatg < 2:1527302/150‑1 (MQ=255) cAGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatgt > 2:1282951/1‑150 (MQ=255) aGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatgta > 2:366530/1‑150 (MQ=255) gAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatgtat > 1:1434948/1‑150 (MQ=255) aaCGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatgtatg > 1:1225649/1‑150 (MQ=255) aCGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTTGTGAatgtatgt < 1:1571156/150‑1 (MQ=255) aCGACCGCAAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCAGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAatgtatgt > 2:114043/1‑150 (MQ=255) gACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTCCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTTGTGAAtgtatgtac < 2:406742/150‑2 (MQ=255) aCCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTTGTGAAtgtatgtacc < 1:173385/150‑3 (MQ=255) aCCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTTGTGAAtgtatgtacc < 2:1233944/150‑3 (MQ=255) cGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATc > 2:1593081/1‑150 (MQ=255) gCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCt < 1:711161/150‑1 (MQ=255) agagGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAAc < 2:1544177/150‑1 (MQ=255) agagGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAAc < 1:473346/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGcc < 1:206217/150‑1 (MQ=255) ggCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGcc > 1:982597/1‑150 (MQ=255) tAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTa < 2:1572004/150‑1 (MQ=255) tAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTa < 1:1102705/150‑1 (MQ=255) cccTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAAtt > 2:469492/1‑150 (MQ=255) ccTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTc > 2:128115/1‑150 (MQ=255) ctctGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCa < 2:1513714/150‑1 (MQ=255) ctGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACg < 2:982597/150‑1 (MQ=255) ctGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCCATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACg < 1:373767/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTg < 2:1585616/138‑1 (MQ=255) gTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTg > 1:1585616/1‑138 (MQ=255) tttttGTTCATATGTAAACCTCGATTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAAc < 2:944812/150‑1 (MQ=255) ttttGTTCATATGTAAACCTCGAGTGGCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACa < 2:403056/150‑1 (MQ=255) tCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTCATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGc < 1:1070297/150‑1 (MQ=255) cATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCa < 1:1183157/150‑1 (MQ=255) gTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGaaa > 1:1002979/1‑150 (MQ=255) aaaCCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGaaaaa < 2:726342/150‑1 (MQ=255) aaCCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAAc > 2:602599/1‑150 (MQ=255) aCCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAAcc > 1:118969/1‑150 (MQ=255) ccTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCa < 1:159526/150‑1 (MQ=255) cTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCaa > 2:1310098/1‑150 (MQ=255) gtgtCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACaag < 1:1593081/150‑1 (MQ=255) tCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACaagaag > 1:438995/1‑150 (MQ=255) ccGATTTCAAATTTTTCAATGTTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCTTGCTATTTTACATACATTCAGAAATGTATGTAAATCTAACTCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAgc < 2:724720/150‑1 (MQ=255) ccGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAgc > 2:1100503/1‑150 (MQ=255) cGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAgcg > 2:152805/1‑150 (MQ=255) aTTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCa < 1:1623860/150‑1 (MQ=255) ttCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAg < 1:269847/150‑1 (MQ=255) cAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGaa > 1:464978/1‑150 (MQ=255) gtcaatggtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGcc > 2:144739/1‑150 (MQ=255) gtcaatggtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGcc < 2:1225649/150‑1 (MQ=255) gtcaatggtcaaAACTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAACGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGcc < 2:628290/150‑1 (MQ=255) atggtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAaca < 2:385555/150‑1 (MQ=255) atggtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAaca > 2:486278/1‑150 (MQ=255) tggtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAacac > 2:1553529/1‑150 (MQ=255) gtcaaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATAAATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACAt > 2:262622/1‑150 (MQ=255) caaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATcc > 2:214329/1‑150 (MQ=255) caaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATcc > 2:1460881/1‑150 (MQ=255) caaAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATcc > 1:601873/1‑150 (MQ=255) aaaaaGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATcc < 1:1061406/149‑1 (MQ=255) aaaaGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCt < 1:602599/150‑1 (MQ=255) gTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGAt > 1:482281/1‑150 (MQ=255) ttAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGAtg < 1:1001725/150‑1 (MQ=255) taataaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGcc < 1:1454158/134‑1 (MQ=255) taataaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGcc > 2:1454158/1‑134 (MQ=255) taataaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGAtgt > 2:84743/1‑150 (MQ=255) taataaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGAtgt < 2:1505155/150‑1 (MQ=255) aataaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGAtgtg < 2:1083160/150‑1 (MQ=255) taaACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGAACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGc < 1:660813/150‑1 (MQ=255) aCCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCGAGGAtgtgttggc < 2:344620/150‑6 (MQ=255) aCCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGctct > 2:19601/1‑150 (MQ=255) cATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACg < 2:1045231/150‑1 (MQ=255) ttGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTc < 1:878508/150‑1 (MQ=255) gcGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTtc < 1:1445350/150‑1 (MQ=255) gcGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTtc < 2:1434948/150‑1 (MQ=255) gcGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGAAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCtttta > 2:1460044/1‑149 (MQ=255) ttATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTcac < 2:1002979/150‑1 (MQ=255) cgtcgtGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAggggg < 2:118969/150‑1 (MQ=255) gtcgtGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGt > 1:438681/1‑150 (MQ=255) tcgtGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTa > 1:977696/1‑150 (MQ=255) tGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTatca > 1:1054284/1‑150 (MQ=255) tGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTatca > 2:1144278/1‑150 (MQ=255) tGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTatca < 2:417732/150‑1 (MQ=255) gCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTatcat < 2:1531945/150‑1 (MQ=255) tATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATcc < 1:366530/150‑1 (MQ=255) tATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATcc > 1:1256179/1‑150 (MQ=255) aTGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCa > 1:827977/1‑150 (MQ=255) tttacatacaTTTGTGAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCAcc > 1:399319/3‑150 (MQ=255) ggTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCAcc < 1:977562/150‑1 (MQ=255) ttacatacaTTTGTGAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCt > 1:579195/2‑150 (MQ=255) tacatacaTTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTc > 1:314683/1‑150 (MQ=255) acatacatTTGTGAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCg > 2:954280/1‑150 (MQ=255) tacatTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTg < 1:707152/150‑1 (MQ=255) catTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAACCGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTggg < 2:1382220/150‑1 (MQ=255) catTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTggg < 2:1283349/150‑1 (MQ=255) caatCACAAATGTATGTAAATCTAACCACTCTAAATTAACTAACATATGGCACGAAAAAACAAACAAAAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTggg > 2:1447095/4‑150 (MQ=255) tCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCga < 1:263808/150‑1 (MQ=255) cacaAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCgag > 2:248083/1‑150 (MQ=255) acaAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAAGAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTGTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCgaga < 2:52580/150‑1 (MQ=255) | TCAGAACGACCGCCAGAGGCGTAAACCCTCTGTTTTTGTTCATATGTAAACCTCGAGTGTCCGATTTCAAATTGGTCAATGGTCAAAAGTTAATAAACCCATTGCTGCGTTTATATTATCGTCGTGCTATGGTACATACATTCACAAATGTATGTAAATCTAACGCCTGTAAATTCACGAACATATGGCACGAAAAACCAAACAAGAAGCGCAAGAAACGCGCCAACACATCCTCGATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGA > NC_000913/485577‑485869 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |