| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,113,473 | T→C | 12.9% | L61L (TTG→CTG) ‡ | uspD → | universal stress protein D |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,113,473 | 0 | T | C | 12.9% | 207.1 / 21.1 | 85 | L61L (TTG→CTG) ‡ | uspD | universal stress protein D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/42); new base C (7/4); total (39/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.87e-01 | |||||||||||
CCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCTGT > NC_000913/4113324‑4113619 | ccGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAt > 2:1032232/1‑150 (MQ=255) gggAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttg > 1:988188/1‑150 (MQ=255) ggAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgt < 2:442688/150‑1 (MQ=255) gAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTTGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt > 1:1457739/1‑150 (MQ=255) gAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt < 1:548929/150‑1 (MQ=255) gAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt < 2:354639/150‑1 (MQ=255) gAATGAAGAAGATGACTTACTGGTGAATAAAGCCCTTGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATATAATTCCCTGAAACAGAAGATATTCTTCAAttgtt > 1:1463558/1‑150 (MQ=255) aaTGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttgttg < 2:1503512/150‑1 (MQ=255) gaagaaGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTgaag > 1:119579/1‑150 (MQ=255) gaagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAAt < 2:1290006/150‑1 (MQ=255) aagaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATa < 1:695200/150‑1 (MQ=255) gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAg < 1:328893/150‑1 (MQ=255) gaTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAATatc < 2:248152/150‑3 (MQ=255) aTGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGt < 2:466526/150‑1 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTc < 1:738449/150‑1 (MQ=255) tGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTc > 2:154876/1‑150 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCgg < 2:929293/150‑1 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCgg < 2:486339/150‑1 (MQ=255) ccTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAATatcttct < 1:1014168/150‑7 (MQ=255) cTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAACAATTGAAGAATatcttctg < 2:53158/150‑8 (MQ=255) tACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATa > 1:6299/1‑150 (MQ=255) tGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACa < 2:275232/150‑1 (MQ=255) ggTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttg > 1:187052/1‑127 (MQ=255) ggTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAAttg < 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ccTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGTGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACt < 1:1587397/150‑1 (MQ=255) tGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGa < 1:450050/150‑1 (MQ=255) ggAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATa < 2:114023/131‑1 (MQ=255) ggAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATa > 1:114023/1‑131 (MQ=255) gCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAat < 2:1627947/150‑1 (MQ=255) gCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAat > 2:1462353/1‑150 (MQ=255) cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAatat > 1:1473197/1‑150 (MQ=255) cAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAatat < 1:1419629/150‑1 (MQ=255) taaaTAATGACGCTCACCTGAAGTTAATTCATATTGATGATGGATTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTTCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTc < 1:1576235/147‑1 (MQ=255) gACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTc < 1:291490/150‑1 (MQ=255) aCATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCa < 2:119579/150‑1 (MQ=255) aTAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAAt < 1:1118046/150‑1 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATg < 1:443249/150‑1 (MQ=255) tAATGACGCTCACCTGAAGTTAATTCATATTGAAGATCGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGAAACAGAAGATATTCTTCATTTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAACCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATg > 2:384344/1‑150 (MQ=255) tGACGCCCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGcc > 2:832497/1‑150 (MQ=255) gCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGTCTTAAGCGAGTTGTATCCGGTTATCTACTTACCTGCAACAGAATATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGTCCGAAg < 1:1551255/150‑1 (MQ=255) 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aaTTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTAt < 1:1470948/150‑1 (MQ=255) ttCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCTGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGAGGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTg < 2:1116637/150‑1 (MQ=255) tatTGATGAT‑GCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAAcgc > 2:1348407/1‑150 (MQ=255) atTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAAcgc > 2:743234/1‑150 (MQ=255) ttGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAAcgcg < 2:988188/150‑1 (MQ=255) 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ttGTATCCGGGTATCTACTTACCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGTCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACActg < 2:1463558/150‑1 (MQ=255) ccGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGaa > 2:734476/1‑150 (MQ=255) ggTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAAtt < 1:832497/150‑1 (MQ=255) tATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTAt > 2:1141978/1‑150 (MQ=255) tATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTAt < 2:432167/150‑1 (MQ=255) 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ccTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAagag > 2:942319/1‑150 (MQ=255) cTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGc < 1:1549447/150‑1 (MQ=255) cAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGt > 1:51991/1‑150 (MQ=255) cAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGCATAACAAGATGTATACACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAACACAAAACTGGTTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGACACACTGCTCGAAATTATGCAAAAAGAGGAGTGCg < 2:1239006/150‑1 (MQ=255) ccgacttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGa > 1:197295/7‑150 (MQ=255) gacttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcc > 2:423248/5‑150 (MQ=255) gacttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcc > 1:923184/5‑150 (MQ=255) aagaTATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcc > 2:181129/1‑150 (MQ=255) acttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcct > 2:614838/4‑150 (MQ=255) acttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcct > 1:822162/4‑150 (MQ=255) acttatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcct > 1:1388113/4‑150 (MQ=255) tatTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGATGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGCGCAGTGCGAcctcct > 1:998114/1‑150 (MQ=255) tatTCTTCAACAATTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGAcctcct > 1:54602/1‑150 (MQ=255) atTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCtt > 2:848630/1‑150 (MQ=255) ttcttcAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTg < 1:1141978/150‑1 (MQ=255) cttcAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTc > 2:266389/1‑150 (MQ=255) cttcAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTc < 2:1276854/150‑1 (MQ=255) cttaAATTGTTTAAGAATAAGTCGTATAACAAGATGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAATACAAAACTGAGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGTAAACACTGATGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTTTc < 2:1239295/150‑1 (MQ=255) cAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCtgt > 2:173867/1‑150 (MQ=255) | CCGGGAATGAAGAAGATGCCTTACTGGTGAATAAAGCCCTGGAGCTCGCCAGACATAATGACGCTCACCTGACGTTAATTCATATTGATGATGGCTTAAGCGAGTTGTATCCGGGTATCTACTTCCCTGCAACAGAAGATATTCTTCAATTGTTGAAGAATAAGTCGGATAACAAGCTGTATAAACTGACGAAAAATATTCAATGGCCGAAGACAAAACTGCGTATTGAACGCGGAGAAATGCCGGAAACACTGCTGGAAATTATGCAAAAAGAGCAGTGCGACCTCCTTGTCTGT > NC_000913/4113324‑4113619 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |