| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 4,242,547 | 0 | T | C | 7.7% | 337.9 / 14.4 | 118 | intergenic (‑293/+79) | xylE/malG | D‑xylose:H(+) symporter/maltose ABC transporter membrane subunit MalG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/63); new base C (6/3); total (52/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
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TAAAAACAATACTATTGCCGTGACTCAGAGCACGAAAGAGAATTATCGTAAGTGGGAAAACAAATAACGTAAAAATAATAAGCTCTATGATGGAAATATTAACCGGCGAACGATTCAGATTGCAGACGAAAGAAAAAAAGGCGCTCCGTGGAGCGCCGAATAACAGTCACAAGTTGGGATAACGTAAGTTGAGGGTGCAGCGGCATAACATTGGCAGAACAACATCTTTAACCTTTCACACCACCTGCCGTCAGGCCGTTGACCAGCCAGCGTTGAGCCAGCAAGAAGACGATGG > NC_000913/4242399‑4242693 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |