Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,261,358 | T→A | 9.6% | intergenic (+52/‑311) | yjbM → / → dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,261,358 | 0 | T | A | 9.6% | 728.7 / 46.6 | 245 | intergenic (+52/‑311) | yjbM/dusA | uncharacterized protein YjbM/tRNA‑dihydrouridine synthase A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (134/87); new base A (9/15); total (143/102) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CGAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTGGGTTCTTTTTTCTCTATCAATACTATTAGCAGGGAGATATATCACCAGAGTTTAATGTGTGATTTTTTATTTATCGTCGAACCTGGATTGTTTATCATTGGCC‑TTAACAAAGTTAACGGCTAATAAGATTATTTCCAT > NC_000913/4261209‑4261502 | cgAAGTCGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAatat > 2:1007095/1‑150 (MQ=255) cGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTg > 2:1593258/1‑150 (MQ=255) cGTTTGACCCAACCTCAAAGGAAGAGATTAAAATACTTACAGACACTTCTAAATTAATTTATGATTTGTTCGGGGTTAAATCGGAGAAATAATATGTGAAGTTCTTCGATAGTATGGAAGGCATTATATAAAAGGACCCAATATTTATTg > 1:749558/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |