| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,278,675 | 0 | T | A | 10.1% | 286.2 / 18.4 | 99 | L66Q (CTG→CAG) | ghxP | guanine/hypoxanthine transporter GhxP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/44); new base A (3/7); total (48/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.20e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.21e-01 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCC > NC_000913/4278526‑4278824 | tAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCt < 1:88559/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTg < 1:371069/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTg < 1:1009039/150‑1 (MQ=255) aaaaTTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTg < 2:141422/150‑1 (MQ=255) ttCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGc < 1:1462830/150‑1 (MQ=255) tCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCAGACAGGTTGca < 2:559137/150‑2 (MQ=255) cacaACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCg < 1:42246/150‑1 (MQ=255) acaACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCgg < 1:778641/150‑1 (MQ=255) 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gTTGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTg > 1:1076276/1‑150 (MQ=255) tGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTggg < 1:1422728/150‑1 (MQ=255) tGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTggg > 2:314482/1‑150 (MQ=255) tGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTggg < 1:1088344/150‑1 (MQ=255) gCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGATAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGt > 2:496107/1‑150 (MQ=255) 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tGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTcc < 2:1018223/150‑1 (MQ=255) | TAAAATTTCACAACGTGGAAGCACTGTCCGTCAGGAAGTGGTTGCCGGGTTAACAACGTTTCTGGCGATGGTCTACTCGGTCATCGTCGTTCCAGGTATGTTGGGTAAAGCAGGCTTCCCGCCTGCGGCAGTTTTCGTTGCAACCTGTCTGGTTGCCGGACTCGGTTCTATCGTGATGGGTCTGTGGGCTAATCTGCCGTTGGCGATTGGTTGCGCCATCTCCCTGACAGCGTTTACCGCATTCAGCCTGGTGCTGGGGCAACATATTAGCGTACCTGTCGCGCTGGGTGCCGTGTTCC > NC_000913/4278526‑4278824 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |