| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,440,356 | A→T | 5.0% | L287Q (CTG→CAG) | ytfL ← | putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,440,356 | 0 | A | T | 5.0% | 297.9 / 3.0 | 94 | L287Q (CTG→CAG) | ytfL | putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/52); new base T (2/3); total (39/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCA > NC_000913/4440207‑4440503 | ccAGATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCTGCACAATCa < 2:751046/150‑1 (MQ=255)ccAGATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCa < 1:735422/150‑1 (MQ=255) aGATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGc < 1:657539/150‑1 (MQ=255) gATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCACCGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCg > 2:116621/1‑150 (MQ=255) cGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGTGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCgtgt < 2:922928/150‑1 (MQ=255) cGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCgtgt < 1:149147/150‑1 (MQ=255) cGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCgtgt < 1:143352/150‑1 (MQ=255) ccATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGc < 1:652519/150‑1 (MQ=255) cATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCg > 1:642149/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGa < 1:529065/150‑1 (MQ=255) cGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTg < 2:775913/150‑1 (MQ=255) tGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTa < 2:1184076/150‑1 (MQ=255) tGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTa > 1:1210388/1‑150 (MQ=255) tGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTa > 1:1204484/1‑150 (MQ=255) tcatcaCCTCATTGAGGGTGATGATCACCCACACCAGCGCGTACTCGTTCAACATCACAGAGAAGTCTTCACCTGCGGTATTAAAAATTTCCAACGCCTCTGAAAGCGTTAACCTATCCGGCACAATAAGCGTGATGAGAATAAGTAcgc > 2:715035/1‑150 (MQ=255) catcaCGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTAcgcc < 2:193405/150‑1 (MQ=255) catcaCGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTAcgcc > 1:734038/1‑150 (MQ=255) tcaCGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTAcgccgc < 2:1204619/150‑1 (MQ=255) tcaCGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTAcgccgc > 1:520804/1‑150 (MQ=255) aCGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCCCCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTg < 1:1370820/150‑1 (MQ=255) ttGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGt < 1:1125085/150‑1 (MQ=255) tGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGGACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGGGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTg < 2:127678/150‑1 (MQ=255) aGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGcc > 1:1317696/1‑150 (MQ=255) ggTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAATGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAg < 2:938038/150‑1 (MQ=255) ggTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAg < 2:504827/150‑1 (MQ=255) gTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCTGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAgg > 1:197578/1‑150 (MQ=255) gTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCTGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAgg > 1:191917/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGc < 2:1166513/150‑1 (MQ=255) gatCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTg > 2:77061/1‑150 (MQ=255) atCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTTCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGACGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTgg > 2:649792/1‑150 (MQ=255) atCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTgg > 1:1098891/1‑150 (MQ=255) tCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACTATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGt < 2:61505/150‑1 (MQ=255) tCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGt < 2:328853/150‑1 (MQ=255) tCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACCTATCCGGAACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTCTTCAGTGCCAGGCTTTGGt > 2:326403/1‑150 (MQ=255) ccccACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGtt < 2:383146/150‑1 (MQ=255) cccACCACCAGCGCGTACTAGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTGGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTa > 1:1111986/1‑150 (MQ=255) accaccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGcc < 1:585007/150‑1 (MQ=255) accaccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGcc < 1:179181/150‑1 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTa > 1:610565/1‑145 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTa < 2:610565/145‑1 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAg > 1:298548/1‑150 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAg < 2:618376/150‑1 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAg < 2:881405/150‑1 (MQ=255) caccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAg > 1:681606/1‑150 (MQ=255) accaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGGTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGc < 1:1177151/150‑1 (MQ=255) ccaGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCa < 2:1505947/150‑1 (MQ=255) cgcgTACTCGTTCATGATCACCGCGTAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGGGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCAcgcg < 2:1438476/150‑1 (MQ=255) cgcgTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCAcgcg > 1:493674/1‑150 (MQ=255) aCTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTca < 2:296747/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcag > 2:1084054/1‑150 (MQ=255) tCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcagc < 2:937604/150‑1 (MQ=255) cGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTcagca < 1:183441/150‑1 (MQ=255) cATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTc < 2:642149/150‑1 (MQ=255) gATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCttt > 2:816870/1‑150 (MQ=255) aTCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTa < 1:423108/150‑1 (MQ=255) tCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAg > 2:41098/1‑150 (MQ=255) cACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGa < 2:1221027/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATc < 2:520804/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTATCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATc < 1:858091/150‑1 (MQ=255) gcgAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCGTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCGGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCg < 2:411958/150‑1 (MQ=255) aaGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACa < 1:1116303/150‑1 (MQ=255) aaGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACa > 2:260603/1‑150 (MQ=255) cTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAAc > 2:362827/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCgatg > 1:1024477/1‑150 (MQ=255) ccTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCgatg < 2:790404/150‑1 (MQ=255) cTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCgatga > 2:447552/1‑150 (MQ=255) tGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCgatgat < 1:1591083/150‑1 (MQ=255) ttttAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGt > 1:492611/1‑150 (MQ=255) tttAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTc < 2:1617387/150‑1 (MQ=255) tttAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTc < 2:734038/150‑1 (MQ=255) ttAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCa > 1:1508737/1‑150 (MQ=255) cTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCt < 2:1317696/150‑1 (MQ=255) cAACGCCTCTTAAAGGGTTAACGTATCCTGCACAATCTGCTTGTTGCTAATTTGTACGCCGCTTTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCAGGCGGTTCAGCAGGTCTTTTGAATCGTCATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCAtt < 1:715035/150‑1 (MQ=255) aCGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTAc < 1:77061/150‑1 (MQ=255) aCGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTAc < 1:1440673/150‑1 (MQ=255) tctGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACg > 1:1455892/1‑150 (MQ=255) ctGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGa > 2:1257515/1‑150 (MQ=255) ctGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGa < 2:1098891/150‑1 (MQ=255) ttaaaGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTAAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGAGGTGGTCAATATCTTCATGACAGACGAg > 2:976396/3‑150 (MQ=255) gAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGGTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAgg > 2:221600/1‑150 (MQ=255) gAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAgg < 1:462197/150‑1 (MQ=255) gAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAgg > 2:1139973/1‑150 (MQ=255) gTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATaa < 1:1052179/108‑1 (MQ=255) gTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATaa > 2:1052179/1‑108 (MQ=255) aaCGTATCCGGCACAATCTGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTagag < 2:197578/150‑1 (MQ=255) aaCGTATCCGGCACAATCTGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTagag < 2:191917/150‑1 (MQ=255) aaCGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTagag > 1:1556654/1‑150 (MQ=255) aCGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGt > 1:1495348/1‑150 (MQ=255) tATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACTCCGCTGTTCAGTGCCAGGGTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACGGATTATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCg < 2:1266263/150‑1 (MQ=255) tATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCg > 1:842682/1‑150 (MQ=255) aTCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGGTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCgg < 2:1077910/150‑1 (MQ=255) ggCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCgg < 1:936516/146‑1 (MQ=255) ggCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCgg > 2:936516/1‑146 (MQ=255) cacaATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTc > 2:919748/1‑150 (MQ=255) caATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCg < 1:362827/150‑1 (MQ=255) tCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCa < 1:447552/150‑1 (MQ=255) | CCAGATCGCCCATCAGCGTGGTCATCACGTCATTGAGGGTGATGATCCCCACCACCAGCGCGTACTCGTTCATGATCACCGCGAAGTCTTCACCTGCGGTTTTAAAACTTTCCAACGCCTCTGAAAGGGTTAACGTATCCGGCACAATCAGCGTGTTGCGAATTTGTACGCCGCTGTTCAGTGCCAGGCTTTGGTTAGCCAGCACGCGGTTCAGCAGGTCTTTAGAATCGACATAACCGATGATGTGGTCAATATCTTCATTACAGACGAGGAACTTAGAGTGCGGATGTTCCGCCA > NC_000913/4440207‑4440503 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |