| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,502,962 | T→A | 5.8% | N157I (AAC→ATC) ‡ | insG ← | KpLE2 phage‑like element; IS4 putative transposase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,502,962 | 0 | T | A | 5.8% | 306.5 / 7.0 | 104 | N157I (AAC→ATC) ‡ | insG | KpLE2 phage‑like element; IS4 putative transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/47); new base A (2/4); total (53/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTCAGAGTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCGTGA > NC_000913/4502815‑4503109 | gTCAGAGTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTc < 2:44599/150‑1 (MQ=255) tCAGAGTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTcc < 2:1441382/150‑1 (MQ=255) gagTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCgg > 2:885814/1‑150 (MQ=255) gagTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCgg > 2:446740/1‑150 (MQ=255) gtgtTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCa > 1:1267628/1‑150 (MQ=255) gtTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCAtg > 1:952164/1‑150 (MQ=255) ttATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGAACCCGGcgctc < 1:1257053/150‑5 (MQ=255) ttATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGAACCCGGcgctc < 2:1333964/150‑5 (MQ=255) aTCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATgtgt > 1:908626/1‑150 (MQ=255) aTCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGAACCCGGcgctcta < 2:796559/150‑7 (MQ=255) tCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTc > 2:1074690/1‑150 (MQ=255) gTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTTGCgg < 2:137717/150‑1 (MQ=255) ttGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGAGCATTTTGACCTGCGGGTAGAGAGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCgggg < 2:1349486/150‑1 (MQ=255) ttGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCgggg < 2:1476062/150‑1 (MQ=255) tGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGAACCCGGcgctcta < 1:564777/140‑7 (MQ=255) tGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGAACCCGGcgctcta > 2:564777/1‑134 (MQ=255) gTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGa > 1:1033384/1‑150 (MQ=255) cTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAgg > 2:566944/1‑150 (MQ=255) cTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAgg < 1:885814/150‑1 (MQ=255) ataAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCt > 2:1464851/1‑150 (MQ=255) ataAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCt > 2:934869/1‑150 (MQ=255) taAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGc > 1:1089387/1‑148 (MQ=255) taAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGc < 2:1089387/148‑1 (MQ=255) gCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGt < 1:713983/150‑1 (MQ=255) gcAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCGGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGGCTGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGAGCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGtgc < 2:352624/149‑3 (MQ=255) cAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCAtg < 1:1313344/121‑1 (MQ=255) cAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCAtg > 2:1313344/1‑121 (MQ=255) cAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGttgt > 1:1364671/1‑148 (MQ=255) gCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTctct > 2:1129674/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTctct < 2:584977/150‑1 (MQ=255) cAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTg < 2:724463/150‑1 (MQ=255) aaGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGACGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGGTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTgg < 1:81375/150‑1 (MQ=255) gCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGgtg < 1:1296289/150‑1 (MQ=255) cTCATTTTAGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGgtgt > 2:1113530/1‑150 (MQ=255) ttttCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATcc > 2:1503936/1‑150 (MQ=255) ttttCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATcc < 1:1176523/150‑1 (MQ=255) tGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTTACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGTGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTgc < 2:255528/150‑1 (MQ=255) tcttcATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGcc > 1:1390014/1‑150 (MQ=255) cttcATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCa < 1:1192388/150‑1 (MQ=255) ttcATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAg < 2:475244/150‑1 (MQ=255) ttcATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAg < 2:192718/150‑1 (MQ=255) tcATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGa < 1:276543/150‑1 (MQ=255) cATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGaa > 2:770340/1‑150 (MQ=255) cATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGaa < 1:446740/150‑1 (MQ=255) cATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGaa < 2:1330359/150‑1 (MQ=255) cATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGaa > 2:1568504/1‑150 (MQ=255) cGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAacac > 2:1272046/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCAt > 1:516653/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCAt > 2:133946/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCAt > 2:1393557/1‑150 (MQ=255) gAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATc > 1:890390/1‑150 (MQ=255) gAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATc > 2:1076853/1‑150 (MQ=255) aGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGa > 2:1342679/1‑150 (MQ=255) ggCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGAt > 1:435379/1‑150 (MQ=255) tgaccAGCCATCTGCTGACGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGAt > 1:104511/5‑149 (MQ=255) tgaccAGCCATCTGCTGACGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGAt < 2:104511/145‑1 (MQ=255) cTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATgg < 2:1581194/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGcc < 1:222858/150‑1 (MQ=255) gCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGcc < 1:1342679/150‑1 (MQ=255) cAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCca < 1:359685/150‑1 (MQ=255) gCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCcagc > 1:1401099/1‑150 (MQ=255) gcagATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCa > 1:849588/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCa > 1:1290215/1‑150 (MQ=255) gCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCa > 2:873618/1‑150 (MQ=255) tGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCAcc > 2:74935/1‑150 (MQ=255) ggTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCa > 2:413326/1‑150 (MQ=255) ggTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCa > 1:613379/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAg < 2:1071093/150‑1 (MQ=255) ccATATGCCAGACCATTTTGACATGAGGGTAGAGCTCCGGGTTCCCGGCATGTGTATGGAGGTGAAATGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGAt > 2:1371199/1‑150 (MQ=255) cATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATg < 1:1113530/150‑1 (MQ=255) ggCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATgcggcg > 2:385573/1‑150 (MQ=255) ggCAGACCATTTTGACCTGCCGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTCCGCATgcggcg > 2:148490/1‑150 (MQ=255) cAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtg > 1:87779/1‑150 (MQ=255) cAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtg > 1:1369374/1‑150 (MQ=255) cAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtg < 1:934869/150‑1 (MQ=255) aGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtgg > 1:601101/1‑150 (MQ=255) aCCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtggcg < 1:1129674/150‑1 (MQ=255) ccATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtggcgt > 2:1120874/1‑150 (MQ=255) ccATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCggcgtggcgt > 1:724799/1‑150 (MQ=255) cATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACCCCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGtt > 1:1472075/1‑150 (MQ=255) ttttGACCTGCGGGTAGAGCTCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTAt < 2:220458/150‑1 (MQ=255) ttttGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGCACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTAt > 1:689412/1‑150 (MQ=255) tttGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATg < 2:516653/150‑1 (MQ=255) tGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCTAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGcc < 1:1568504/150‑1 (MQ=255) tGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGcc < 1:1076853/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCaga > 2:159955/1‑150 (MQ=255) cTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCagag < 1:816330/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCagag > 1:1072918/1‑150 (MQ=255) cGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTg < 1:592531/150‑1 (MQ=255) gggTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTgc < 1:566944/150‑1 (MQ=255) ggTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTgcg < 1:133946/150‑1 (MQ=255) gTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTgcgc < 1:1464851/150‑1 (MQ=255) catgcCGGGAACCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGtt > 1:427288/4‑150 (MQ=255) cgcCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGtttt < 1:889931/150‑1 (MQ=255) cgcCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGtttt < 2:890390/150‑1 (MQ=255) gcCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTc > 1:156187/1‑150 (MQ=255) ccGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCg < 2:548350/150‑1 (MQ=255) gggTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCGTg < 2:1177761/150‑1 (MQ=255) gggTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCGTg < 2:1033384/150‑1 (MQ=255) ggTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCGTGa < 1:1272046/150‑1 (MQ=255) | GTCAGAGTGTTATCGCCGGTTTGTTCTATAAGTTGCTCAGCAAGCTCATTTTCGCTGTTCTTCATCGTGCCGAAGGCTGCAGCCGTCAGCAGATGGCTGGTCAGTTCCATCTGGCAGACCATTTTGACCTGCGGGTAGAGCGCCGGGTTCCCGGCATGTGTCTGGCGGGGGAAGGCTGCATCGTTCTCTGGTGTATCCGGTGTGCGCCAGAACACACCATCGATGGCCAGCAGGGTCAGGCCGCACCAGTGCGGATGCGGCGTGGCGTTATGCCAGAGCTGCGCTGTTTTCGTGA > NC_000913/4502815‑4503109 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |