| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 900,710 | 0 | G | C | 9.1% | 330.3 / 18.8 | 107 | intergenic (‑135/+156) | artJ/artM | L‑arginine ABC transporter periplasmic binding protein/L‑arginine ABC transporter membrane subunit ArtM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/46); new base C (7/3); total (57/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACTAACTTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTA > NC_000913/900562‑900855 | actaactTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGt > 1:1605212/1‑150 (MQ=255) ctaacaTATTCATGATCGAACTCCCGTCTCTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTCTCTGCGGCATGTGATAAAAAAGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATCATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTg > 2:1353406/1‑150 (MQ=255) taactTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTgg > 1:1394649/1‑150 (MQ=255) 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tAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACaaaa > 1:1529873/1‑150 (MQ=255) aGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAAcccccc > 1:8026/1‑150 (MQ=38) aGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAAcccccc > 2:199100/1‑150 (MQ=38) aCGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTTATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCgg > 1:363873/1‑150 (MQ=38) aCGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTTATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCgg > 1:363876/1‑150 (MQ=38) 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aaCTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATg < 2:409845/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTa < 1:968319/150‑1 (MQ=255) | ACTAACTTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTA > NC_000913/900562‑900855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |