| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 900,712 | G→A | 9.5% | intergenic (‑137/+154) | artJ ← / ← artM | L‑arginine ABC transporter periplasmic binding protein/L‑arginine ABC transporter membrane subunit ArtM |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 900,712 | 0 | G | A | 9.5% | 309.1 / 14.7 | 104 | intergenic (‑137/+154) | artJ/artM | L‑arginine ABC transporter periplasmic binding protein/L‑arginine ABC transporter membrane subunit ArtM |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/47); new base A (7/3); total (54/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.23e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CTAACTTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTACGCAGC > NC_000913/900563‑900861 | ctaacaTATTCATGATCGAACTCCCGTCTCTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTCTCTGCGGCATGTGATAAAAAAGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATCATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTg > 2:1353406/1‑150 (MQ=255) taactTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTgg > 1:1394649/1‑150 (MQ=255) actTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAAT‑AAAAAGACGGACAACTTAGTGGGtt > 2:1358043/1‑150 (MQ=255) actTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAAAAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGt < 2:1257065/150‑1 (MQ=255) ctTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGtt > 2:581881/1‑150 (MQ=255) ttCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTcc < 1:98934/150‑1 (MQ=255) tCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCg < 1:278093/150‑1 (MQ=255) tCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCg < 1:899867/150‑1 (MQ=255) tCATGATGGAACTCCCGTCTGGCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCg < 1:1194141/150‑1 (MQ=255) atgatgGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTc > 1:505685/1‑150 (MQ=255) atgatgGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTc < 2:1303333/150‑1 (MQ=255) gatgGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCtt < 2:1244258/150‑1 (MQ=255) gatgGAACTCCAGTCTGTCAATCTTATGATATATTGAAGTGTATGCGGCATGCGATAACAATGCAATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCtt > 2:1111792/1‑150 (MQ=255) tgGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCa < 2:964239/150‑1 (MQ=255) ggAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCAt < 1:1504972/150‑1 (MQ=255) ggAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCttttt > 2:1311878/1‑147 (MQ=255) gatcTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATTACTATGGCATGAAGTTAATTTATATGCATTAAACATGATTATATTATTTAATTGAAATAAAATAGACGGACAACCCACTATGTTGTCCGTCtttttt < 2:282070/147‑5 (MQ=255) gAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCAtt > 1:1374792/1‑150 (MQ=255) aaCTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATta < 1:542730/150‑1 (MQ=255) aCTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATtat > 1:951888/1‑150 (MQ=255) cTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCGGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATtata < 1:1446821/150‑1 (MQ=255) cTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGGCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATtata < 2:1236179/150‑1 (MQ=255) cccGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAg < 2:478592/150‑1 (MQ=255) tCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATTTTCAATATACATGTTTAAATAATTTAAATTAAATAAAAAAGACGGTTAACTTAGTGGTTTGTCATTCTTAATTATAATAAtt < 2:662279/150‑1 (MQ=255) tCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGACATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAAtt > 2:1543380/1‑150 (MQ=255) tGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCTGTCTTCATTATAAGAATTTa > 2:313339/1‑150 (MQ=255) tGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTa < 1:729362/150‑1 (MQ=255) gTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTAt > 2:645689/1‑150 (MQ=255) gTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTGAGATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTGGTCCGGCTTCATTATAAGAAGTTAt > 2:795597/1‑150 (MQ=255) tCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATg < 2:644864/150‑1 (MQ=255) tCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATg > 2:231577/1‑150 (MQ=255) tCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATg < 1:581881/150‑1 (MQ=255) aaTCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTATTGGTTTTTCAGTCTTTATTATAAGTATTTATGCa < 2:1617719/150‑1 (MQ=255) aTGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGt < 1:313361/150‑1 (MQ=255) tGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTa > 1:1158280/1‑150 (MQ=255) tGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTa < 1:33153/150‑1 (MQ=255) tGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTa > 2:46186/1‑150 (MQ=255) gATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAg > 2:1048346/1‑150 (MQ=255) gATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAAGAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAg > 1:1611011/1‑150 (MQ=255) aTTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAgg > 2:1247819/1‑150 (MQ=255) tttttGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGc > 2:1544216/1‑150 (MQ=255) ttttGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGATGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGcc > 1:1550596/1‑150 (MQ=255) tttGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAAT‑AAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCgg < 1:1358043/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCGCTATGTAGGCCGGAt > 2:841079/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGAt < 2:335956/150‑1 (MQ=255) gCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATa > 2:373442/1‑150 (MQ=255) gtgtCTGCGGCATGTGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAgg < 2:655532/150‑1 (MQ=255) gtgtCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAgg < 2:1387694/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCg > 2:588830/1‑148 (MQ=255) cTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCg < 1:588830/148‑1 (MQ=255) tGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTcc > 1:1202456/1‑150 (MQ=255) tGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTcc > 1:1255817/1‑150 (MQ=255) tGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTcc < 1:762661/150‑1 (MQ=255) cGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTcccc > 2:1029442/1‑150 (MQ=255) cATTGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGCTTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGTACAACTTAGTGCGTTGTCCGTCTTCAATAAAAGACTTTCTGCACTAAGTAGGCCGGATACGGCGGCCccgcc < 2:1044993/150‑1 (MQ=255) aggATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCa > 2:689171/2‑150 (MQ=255) aaCAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCgg > 2:277412/1‑150 (MQ=255) aCAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACACGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGc < 1:368572/150‑1 (MQ=255) cATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGcc > 2:130472/1‑149 (MQ=255) cATCAACTTAATTTATATTCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCa < 1:731940/150‑1 (MQ=255) aGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGc > 2:384508/1‑138 (MQ=255) aGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGc < 1:384508/138‑1 (MQ=255) gTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGc < 2:421761/150‑1 (MQ=255) gTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGc < 1:46186/150‑1 (MQ=255) tttATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATg < 2:1215471/150‑1 (MQ=255) tatGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTg > 1:807144/1‑150 (MQ=255) tatGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTg > 2:1060033/1‑150 (MQ=255) atGCAATAAACATGATTAAGTAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGa < 1:129161/150‑1 (MQ=255) atGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGa > 1:496863/1‑150 (MQ=255) tGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGAt > 1:652303/1‑150 (MQ=255) tGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGAt > 2:251461/1‑150 (MQ=255) gCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGTGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATg < 1:1247819/150‑1 (MQ=255) gCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATg > 1:182136/1‑150 (MQ=255) cAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGc < 1:180804/150‑1 (MQ=255) aTAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGa > 2:357470/1‑150 (MQ=255) aataatTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCt < 2:652303/150‑1 (MQ=255) aatTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAt > 1:275630/1‑150 (MQ=255) atTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATc < 2:928501/150‑1 (MQ=255) atTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATc < 2:1158280/150‑1 (MQ=255) tttAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa < 2:1107829/150‑1 (MQ=255) tttAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa < 1:44520/150‑1 (MQ=255) tAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGa > 2:339529/1‑150 (MQ=255) aaTGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGAcc < 1:1510900/150‑1 (MQ=255) aTGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCt > 1:1105501/1‑150 (MQ=255) aTGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATAAGACGCGCCAGCGTCGCATCAGAcat < 1:1111792/150‑3 (MQ=255) aaaTAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACa > 2:790269/1‑150 (MQ=255) tAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACaaaa < 1:251461/150‑1 (MQ=255) tAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACaaaa > 1:1529873/1‑150 (MQ=255) aGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAAcccccc > 1:8026/1‑150 (MQ=38) aGACGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAAcccccc > 2:199100/1‑150 (MQ=38) aCGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTTATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCgg > 1:363876/1‑150 (MQ=38) aCGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTTATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCgg > 1:363873/1‑150 (MQ=38) aCGGACAACCCACTAAGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCgg > 2:1385373/1‑150 (MQ=38) gACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGa > 2:531062/1‑150 (MQ=255) gACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGa > 2:1587606/1‑150 (MQ=255) gACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGa > 1:1131527/1‑150 (MQ=255) cAACTTAGTGGGTTCTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGAACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTATTATCAGAGCTACAAAACCCCCCGGCGaaa > 2:698235/1‑149 (MQ=255) aaCTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATg < 2:409845/150‑1 (MQ=255) cTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTa < 1:968319/150‑1 (MQ=255) gggTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTACGCAGc > 2:334274/1‑150 (MQ=255) | CTAACTTTTTCATGATGGAACTCCCGTCTGTCAATCTTATGATTTTTGGCCGTGTCTGCGGCATGGGATAACAATGCCATCAAGTGAATTTATATGCAATAAACATGATTAAATAATTTAAATGAAATAAAAAAGACGGACAACTTAGTGGGTTGTCCGTCTTCATTATAAGAATTTATGCACTATGTAGGCCGGATAAGGCGTCCCCGCCGCATCCGGCACAGGCACCGTGCTGATGTCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGACCTACAAAACCCCCCGGCGAATGTACGCAGC > NC_000913/900563‑900861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |