Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,211,614 | C→T | 16.3% | intergenic (+37/+66) | icdC → / ← iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,211,614 | 0 | C | T | 16.3% | 329.0 / 47.0 | 135 | intergenic (+37/+66) | icdC/iraM | protein IcdC/anti‑adaptor protein IraM, inhibitor of sigma(S) proteolysis |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/49); new base T (13/9); total (77/58) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.73e-01 |
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
GGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGAC > NC_000913/1211466‑1211762 | ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca > 1:727406/1‑150 (MQ=255) ggAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAaca > 2:1552360/1‑150 (MQ=255) aGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGc < 1:182443/150‑1 (MQ=255) cgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 1:1007433/1‑150 (MQ=255) cgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg < 2:552405/150‑1 (MQ=255) cgcAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCg > 1:705529/1‑150 (MQ=255) caatcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGCCCgtt < 1:1515646/150‑1 (MQ=255) atcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGCCCgtttt < 1:279147/150‑3 (MQ=255) atcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGCCCgtttc < 1:837034/150‑3 (MQ=255) atcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTGTTATACGCCCgtttc < 1:135982/150‑3 (MQ=255) tcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTGCATGTGTTAAATATTGAAACGCGCGTGTTATACGCCCgtttca < 2:537707/150‑4 (MQ=21) tcaatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCgttgtt < 2:719403/150‑1 (MQ=255) caatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 1:125863/150‑1 (MQ=255) caatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGttt < 2:1007433/150‑1 (MQ=255) aatGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGtttt < 1:193601/150‑1 (MQ=255) atGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTttta < 1:105537/150‑1 (MQ=255) tGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTtttat > 2:286221/1‑150 (MQ=255) aCCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTAtgtg < 2:1410579/150‑1 (MQ=255) cGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGa < 1:1184969/150‑1 (MQ=255) gTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGat > 1:1225762/1‑150 (MQ=255) tATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATattatt > 2:976632/1‑150 (MQ=255) tGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTaa > 1:466239/1‑150 (MQ=255) gACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAAt > 1:468934/1‑150 (MQ=255) cTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAg > 1:1325115/1‑150 (MQ=255) tCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCa < 1:966860/150‑1 (MQ=255) tCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCa < 2:1624777/150‑1 (MQ=255) cGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCat < 2:503830/150‑1 (MQ=255) cGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCCGAAATTTTCAGAGTTTGGTGAAGCGAGCATCGAAAACATCTCATCTCTCCAACAGCTAAATATTGAAACGGGCGGATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGCCTATTATTAATAGCATATCg < 2:1037717/150‑1 (MQ=255) cTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGc > 1:720200/1‑150 (MQ=255) aaGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTta < 2:170877/150‑1 (MQ=255) aGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTtat < 1:286221/150‑1 (MQ=255) ggCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTtata < 1:574896/150‑1 (MQ=255) cgcTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATg > 1:385538/1‑150 (MQ=255) tAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAg > 1:507923/1‑150 (MQ=255) tgctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCAAt > 2:970316/1‑150 (MQ=255) gctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCAtt > 1:908121/1‑150 (MQ=255) ctgAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTa > 1:1571881/1‑150 (MQ=255) gAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACt < 2:799832/150‑1 (MQ=255) aaaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACtt < 1:334007/150‑1 (MQ=255) aaTGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTg < 2:204194/150‑1 (MQ=255) gTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGc < 1:548084/150‑1 (MQ=255) ttCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGcc > 1:76791/1‑150 (MQ=255) tCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGccc > 1:1364605/1‑150 (MQ=255) cAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCa > 1:1325202/1‑150 (MQ=255) agTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCatat > 1:410954/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGCTATAATCGAAAACATGTAATCTATAAATTTGTTAAATATTGAAAAGGGCGTATAAAAAGCCCGTTGTTTTATTTATGTGTATATTATTAATATCATATCGAGCATATTTATATGAATCCAATTAATTGAGCAAatattttaa > 2:834756/1‑145 (MQ=255) gTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCat > 2:1361279/1‑150 (MQ=255) gCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATAtttt > 1:451137/1‑150 (MQ=255) tcGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATg > 1:1447134/1‑150 (MQ=255) cGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGc < 2:1325115/150‑1 (MQ=255) gAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCa < 1:20791/150‑1 (MQ=255) aaCATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACt < 2:1029917/150‑1 (MQ=255) tGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACtatta < 2:109611/150‑1 (MQ=255) tGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACtatta > 2:180446/1‑150 (MQ=255) aTCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTa < 1:543142/150‑1 (MQ=255) aTCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTa < 1:970316/150‑1 (MQ=255) ctcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATaa < 1:1611295/131‑1 (MQ=255) ctcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATaa > 2:1611295/1‑131 (MQ=255) ctcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACa > 1:168798/1‑150 (MQ=255) ctcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACa < 2:1360222/150‑1 (MQ=255) ctcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTAGTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACa > 2:680071/1‑150 (MQ=255) tcCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACat < 1:1552360/150‑1 (MQ=255) ccATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTGTGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACatt > 1:919628/1‑150 (MQ=255) cATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACattt > 2:1207787/1‑150 (MQ=255) cATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACattt > 1:71091/1‑150 (MQ=255) gtgtTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCTAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACatttatt > 2:1299240/1‑150 (MQ=255) gtTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTg < 2:714955/150‑1 (MQ=255) gtTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGAAACTATTATGTAAACATTTATTTg > 2:259139/1‑150 (MQ=255) atatTGAAACGGTCCTATAACACGCACGTTGTTTTATTTATGTGGTTATTATTAATAGCAATTCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGATCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAATCATTTATTTGTTAtt < 2:637250/150‑1 (MQ=255) tatTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAttt < 2:76791/150‑1 (MQ=255) atTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtttt > 1:934343/1‑150 (MQ=255) atTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtttt > 2:1231516/1‑150 (MQ=255) atTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTAtttt > 1:211856/1‑150 (MQ=255) ttGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTg > 2:117210/1‑150 (MQ=255) aaacaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTg > 1:753865/5‑150 (MQ=255) aaacaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTg > 1:1207542/5‑150 (MQ=255) aaacaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTg > 1:1039792/5‑150 (MQ=255) tGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGc > 1:419891/1‑150 (MQ=255) tGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGc > 1:1407757/1‑150 (MQ=255) aacaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGc > 1:1019144/4‑150 (MQ=255) acaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCt > 1:902948/3‑150 (MQ=255) acaaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCt > 1:197932/3‑150 (MQ=255) caaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCtt > 1:1420477/2‑150 (MQ=255) caaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCtt > 1:1501948/2‑150 (MQ=255) aaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTTTTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCATTATGGGCATATTTTTATAATGAAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCttt > 2:1411726/1‑150 (MQ=255) aaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCttt > 2:1560030/1‑150 (MQ=255) aaCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCACATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCttt > 1:1517891/1‑150 (MQ=255) aCGGGCGTGTTATACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCttta > 1:1297279/1‑149 (MQ=255) cGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTtct < 1:1388491/150‑1 (MQ=255) tataACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCtt < 1:111810/141‑1 (MQ=255) tataACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTgga < 1:1207787/150‑1 (MQ=255) ataACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTggag > 1:1308235/1‑150 (MQ=255) ataACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCATggag > 2:578247/1‑150 (MQ=255) taACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTggagg < 2:619320/150‑1 (MQ=255) taACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCAATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTggagg > 1:1007773/1‑150 (MQ=255) gcacGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTACTGGAGGac > 1:129336/2‑150 (MQ=255) acacGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGac > 2:133840/1‑150 (MQ=255) acacGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGac > 2:1118294/1‑150 (MQ=255) acacGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGac > 2:899153/1‑150 (MQ=255) cacGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTggagg > 2:1065814/1‑147 (MQ=255) | GGAAGGCGCAATCAATGCCAAGACCGTAACTTATGACTTCGAACGTCTGATGGAAGGCGCTAAGCTGCTGAAATGTTCAGAGTTTGGTGAAGCGATCATCGAAAACATGTAATCTCTCCATGTGTTAAATATTGAAACGGGCGTATAACACGCCCGTTGTTTTATTTATGTGGATATTATTAATAGCATATCGAGCATATTTATATGAAGCCCATTACTTGAGCCCATATGGGCATATTTTTATAATGCAACTATTATGTAAACATTTATTTGTTATTTTGCTTTCTCCTGGAGGAC > NC_000913/1211466‑1211762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |