| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,596,499 | C→A | 9.8% | pseudogene (1588/5422 nt) | yneO ← | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,596,499 | 0 | C | A | 9.8% | 331.7 / 18.9 | 102 | pseudogene (1588/5422 nt) | yneO | AIDA‑I family autotransporter YneO |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/37); new base A (4/6); total (59/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.15e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.59e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTG > NC_000913/1596350‑1596648 | tgtATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGc < 1:1447661/150‑1 (MQ=255) gtATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCa < 1:777696/150‑1 (MQ=255) tATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCAt > 1:1525004/1‑150 (MQ=255) cACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtc > 2:1084631/1‑150 (MQ=255) cACGCGCATTAACTATACATCCGCTCGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtc > 2:1283209/1‑150 (MQ=255) cgcgCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcct > 2:901118/1‑150 (MQ=255) gcTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCg < 2:826689/150‑1 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGAt > 2:75971/1‑150 (MQ=255) tttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCggt < 1:618053/150‑3 (MQ=255) ttAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTa < 1:144780/150‑1 (MQ=255) aagtataCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTACTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATaaa < 2:1269969/147‑1 (MQ=255) aaCTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCGCCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATaaa > 2:1045201/1‑150 (MQ=255) aCTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTATCGGAGGAAATGCCTCCGGTaagg < 1:550051/150‑3 (MQ=255) aCTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTaagg < 1:1408714/150‑3 (MQ=255) cTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTaaggg < 1:818584/150‑4 (MQ=255) cTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGAAATGCCTCCGGTaaggg < 1:824106/150‑4 (MQ=255) tataCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATcc < 1:545898/150‑1 (MQ=255) taCCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCAt < 2:1587671/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc < 2:584334/135‑1 (MQ=255) tCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTtcctcc > 1:584334/1‑135 (MQ=255) ggtggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGt > 1:1258352/1‑150 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg > 1:552220/1‑150 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg < 1:1162420/150‑1 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg > 1:945581/1‑150 (MQ=255) tggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTg < 1:910730/150‑1 (MQ=255) ggtAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGa > 1:702585/1‑150 (MQ=255) atatTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTa < 1:1627874/150‑1 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg > 1:74857/1‑150 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg > 1:1373962/1‑150 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg < 2:74857/150‑1 (MQ=255) atTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAg > 2:834017/1‑150 (MQ=255) cACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCAc > 2:633655/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCa > 1:1095119/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCa > 2:1005683/1‑150 (MQ=255) cccGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCa > 1:1275289/1‑150 (MQ=255) cGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCAtt < 2:159378/150‑1 (MQ=255) ttccTAAAACACAGAACTGTAGCAATTGTGCGTTAGTACATGATTTATTTAAATTAAAGATACTCTCCGTTGAAATATAAACTATCCCCAAACCGGAGGCATATACTCCGAAAAAACCATACACCATTGAATTAAGGTTGTCACCATTaa > 2:175773/3‑149 (MQ=255) ccTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTg < 2:443704/150‑1 (MQ=255) cTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGa > 1:1177916/1‑150 (MQ=255) aaTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACa > 1:204340/1‑150 (MQ=255) aaTACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACa > 1:299616/1‑150 (MQ=255) cacCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGGGGCACCATTACTGACATTTa > 1:510113/1‑150 (MQ=255) acCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTAc < 2:204340/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATAc > 1:478870/1‑150 (MQ=255) tGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATAcag > 1:1331566/1‑148 (MQ=255) gTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTAAGATACCGc > 2:784530/1‑150 (MQ=255) aGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTTAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTa > 2:1026753/1‑150 (MQ=255) aGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTa > 2:257487/1‑150 (MQ=255) gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTaa > 2:205674/1‑149 (MQ=255) gCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCACTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGAACGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTAc > 1:1120573/1‑150 (MQ=255) gtgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAAt < 1:1064800/150‑1 (MQ=255) tgCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAAtt > 1:1380115/1‑150 (MQ=255) cGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAAttcc > 2:1116417/1‑148 (MQ=255) cGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTAc > 1:486592/1‑150 (MQ=255) agtagATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGAc < 2:187919/150‑1 (MQ=255) agATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACAtt > 1:1214966/1‑150 (MQ=255) atgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGa < 1:633655/150‑1 (MQ=255) tgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAt > 1:1017719/1‑150 (MQ=255) tgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAt > 1:642705/1‑150 (MQ=255) tgatgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGAt < 2:742728/150‑1 (MQ=255) tgTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAcc < 1:1005683/150‑1 (MQ=255) gTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATAccc < 2:1403370/150‑1 (MQ=255) tCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCca > 2:735274/1‑150 (MQ=255) tcttAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac > 2:561688/3‑150 (MQ=255) tcttAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac < 1:561688/148‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac < 1:23878/150‑1 (MQ=255) cTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCcac > 1:732110/1‑150 (MQ=255) aTTCCAGATACTGTCCTTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTTACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATc < 2:1120573/150‑1 (MQ=255) ccAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACAATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGaa > 1:805062/1‑150 (MQ=255) agagACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACg > 2:1591795/1‑150 (MQ=255) agagACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATAGAACg > 1:455865/1‑150 (MQ=255) tGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCATACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGTCATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGatgatg < 2:1078342/150‑1 (MQ=255) gTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACAGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGt > 1:1382268/1‑150 (MQ=255) ccGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCg > 2:315090/1‑150 (MQ=255) cGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGc > 2:1336635/1‑150 (MQ=255) cGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGc > 1:517254/1‑150 (MQ=255) gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcc > 1:1546058/1‑150 (MQ=255) gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcc < 1:1285757/150‑1 (MQ=255) gAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatcc > 1:955338/1‑150 (MQ=255) atatTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGcatccatc > 2:1473444/1‑150 (MQ=255) atTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAg < 2:702585/150‑1 (MQ=255) tatggatttATCGGAGGAAATGCCTCCGGTAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAg > 2:1238245/8‑150 (MQ=255) tCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAgtg < 2:1546058/150‑1 (MQ=255) cccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGtgtg > 1:1609228/1‑150 (MQ=255) ccTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGc > 1:114825/1‑150 (MQ=255) cTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 2:486592/150‑1 (MQ=255) cTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 1:735274/150‑1 (MQ=255) atcGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGAt > 1:410890/3‑150 (MQ=255) atcGGAGGAAATGCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGAt > 1:1160281/3‑150 (MQ=255) aCCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGAt < 1:1026753/150‑1 (MQ=255) ggAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc < 2:642705/150‑1 (MQ=255) ggAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc < 1:1084631/150‑1 (MQ=255) ggAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc < 1:901118/150‑1 (MQ=255) ggAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGCCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc < 1:501379/150‑1 (MQ=255) ggCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc > 2:452107/1‑141 (MQ=255) ggCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGcc < 1:452107/141‑1 (MQ=255) gCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgctt < 2:1380115/150‑1 (MQ=255) cATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATAcc > 1:529773/1‑145 (MQ=255) cATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttg > 2:887307/1‑150 (MQ=255) cATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGGGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCgcttg < 2:510113/150‑1 (MQ=255) | TGTATCACGCGCTTTAACTATACCTCCGGTGGTAATATTCAGTTCACCCGTGCCTAATACACCGACCTGTAGCAATTGTGCGTTAGTAGATGATGTCTTTAAATTCCAGAGACTGTCCGTTGAAATATTAACTATCCCCTTACCGGAGGCATTTCCTCCGATAAATCCATAGCCCGTTGAATTAAGGGTGGCACCATTACTGACATTTACGATACCGCTACCAAAATTACCGACATTGATACCCACAGTATCGAACGATGATGTCGCATCCATCAGGTTCAGTGTGCCGATACCGCTTG > NC_000913/1596350‑1596648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |