Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 1,620,224 | C→G | 8.5% | intergenic (+17/+14) | marB → / ← eamA | multiple antibiotic resistance protein/cysteine/O‑acetylserine exporter EamA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,620,224 | 0 | C | G | 8.5% | 340.7 / 18.1 | 106 | intergenic (+17/+14) | marB/eamA | multiple antibiotic resistance protein/cysteine/O‑acetylserine exporter EamA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/45); new base G (2/7); total (54/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.99e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.33e-01 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAGCGTTCATCCAACAATAGTGCCGCACTTGC > NC_000913/1620075‑1620369 | tACTTCTTGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCAGATGGGTAGTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCTGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCGGAc < 2:480141/150‑1 (MQ=255) cttcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCCCCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAt > 1:1331606/1‑150 (MQ=255) tcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAtct > 2:109218/1‑150 (MQ=255) tcttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAtct > 2:299441/1‑150 (MQ=255) cttGTGCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACAtctc > 2:1507782/1‑150 (MQ=255) gtgCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCggg < 1:408709/150‑1 (MQ=255) gCCAATGTCGTGGTTGTTCCCCCATCGCAGGAACACCCACCGTTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGc < 2:1106597/150‑1 (MQ=255) ccAATGTCGGGGGTGTTCGCCCATGGCAGGAACACCCACCGGTTGATTTAAATCACATGGGTACTGGCAGTGATAAGTCGGATGCGCTCGGCGTGCCCTATTATAATCAACACGCTAGGTAGTTTGTTCTGGCCCCGAGATGTCGGGGcc < 1:689904/150‑2 (MQ=255) 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ataATCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGtt > 2:203482/1‑150 (MQ=255) ataATCAACACGCTATGTAGTATGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTAACGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCCCCTAAAAATTGCAGACCCGtt > 2:832582/1‑150 (MQ=255) aaTCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTaa > 2:797026/1‑150 (MQ=255) aTCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAg > 2:83143/1‑150 (MQ=255) aTCAACACGCTATGTAGTTTGTTCTGGCCCCGACATCTCGGGGCTTATTAACTTCCCACCTTTACCGCTTTACGCCACCGCAAGCCAAATACATTGATATACAGCCCGGTCATAATGAGCACCGCACCTAAAAATTGCAGACCCGTTAAg > 2:1316843/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |