| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,637,646 | +T | coding (5/1500 nt) | pitA → | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,637,645 | 1 | . | T | 99.4% | 629.0 / NA | 172 | L2L (CTA→TTA) | pitA | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); major base T (63/107); minor base G (0/1); total (63/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 185 total aligned reads displayed.
GGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑TACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCA > NC_000913/3637546‑3637739 | gggCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGc < 1:1957444/100‑1 (MQ=255) ggCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑t > 1:4424757/1‑100 (MQ=255) ggCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑t < 1:2114934/100‑1 (MQ=255) aaTCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑ttaca > 1:4146071/1‑96 (MQ=255) aaTCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑ttaca < 1:2962582/100‑5 (MQ=255) aaTCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGCCCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑tcaca > 1:540040/1‑96 (MQ=39) aTCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑ttacat > 1:4233210/1‑95 (MQ=255) cAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAttt < 1:2864182/100‑1 (MQ=255) aaaaaaaGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttg > 1:4687085/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgt < 1:4921322/100‑1 (MQ=255) aaaaaGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgtt < 1:2328017/100‑1 (MQ=255) aaaaGTCCATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgttt > 1:3221301/1‑100 (MQ=255) gTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTg < 1:1262188/100‑1 (MQ=255) gTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑ttaca < 2:2364096/89‑5 (MQ=255) tCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTgg < 1:2880430/100‑1 (MQ=255) tCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTgg < 1:3907021/100‑1 (MQ=255) tataTTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAttt > 2:1405946/1‑89 (MQ=255) tataTTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGcc < 1:1761038/100‑1 (MQ=255) ntatTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGTCGTAACGACCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCt > 1:3767614/2‑100 (MQ=255) tatTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgt > 2:1527831/1‑89 (MQ=255) atTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTgg > 1:2208956/1‑100 (MQ=255) atTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTgg > 1:3817888/1‑100 (MQ=255) tttCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgttt < 2:37128/89‑1 (MQ=255) tttCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACAtttgttt < 2:1213005/89‑1 (MQ=255) ttCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGAt > 1:1718264/1‑100 (MQ=255) tCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGc > 2:366627/1‑89 (MQ=255) tCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGAtt < 1:2027375/100‑1 (MQ=255) cACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑TACATTTGTTTGCTg < 2:1639615/89‑1 (MQ=255) aCTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTg > 2:1003233/1‑89 (MQ=255) aCTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCGTACATTTGCTTGCTGGCCTGGATTTg < 1:3382962/100‑1 (MQ=255) cTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTgg > 2:4553183/1‑89 (MQ=255) cTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGc > 1:2248930/1‑100 (MQ=255) tttGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCa < 1:1026627/100‑1 (MQ=255) tttGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCa < 1:1671585/100‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGcc < 2:196729/89‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTg < 2:3365638/89‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATAc < 1:1887188/100‑1 (MQ=255) cccGCGCCGCGAAAGTTACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTgg < 2:2623061/89‑1 (MQ=255) cccGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTgg < 2:4688466/89‑1 (MQ=255) cccGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTgg < 2:4452007/89‑1 (MQ=255) cccGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCCGGCCTgg > 2:2127430/1‑89 (MQ=255) ccgcgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCg > 1:1457206/1‑100 (MQ=255) cgcgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCgg < 1:3581171/100‑1 (MQ=255) gcgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGAtt < 2:4292228/89‑1 (MQ=255) cgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGc < 1:4452886/100‑1 (MQ=255) cgccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGc < 1:845474/100‑1 (MQ=255) ccgcgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGc < 2:1144902/89‑1 (MQ=255) cgAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGtta < 1:3254661/100‑1 (MQ=255) gAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGttat < 1:2821518/100‑1 (MQ=255) tCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGc < 2:4107349/89‑1 (MQ=255) tCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGc < 2:3667082/89‑1 (MQ=255) aCTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgct > 1:1812904/1‑100 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGtta > 2:2322818/1‑89 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGtta < 2:3824597/89‑1 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGtta < 2:1533691/89‑1 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgcttgc < 1:4018441/100‑1 (MQ=255) gATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgcttgc < 1:3811446/100‑1 (MQ=255) tAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGttatt < 2:2441714/89‑1 (MQ=255) tAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCGGTTATTAttgcttgcgc > 1:741727/1‑98 (MQ=255) aTGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTg > 1:4891057/1‑100 (MQ=255) gcgcCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGc < 1:2149403/100‑1 (MQ=255) gccgcGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgct < 2:4258340/89‑1 (MQ=255) ncgcgTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCttt > 1:4939131/2‑100 (MQ=255) ccgcGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgctt < 2:4142310/89‑1 (MQ=255) cgcgTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgcttg < 2:96334/89‑1 (MQ=255) cgcgTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTAttgcttg < 2:3941142/89‑1 (MQ=255) ttCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGc < 1:3125738/100‑1 (MQ=255) ttCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGc < 1:2663393/100‑1 (MQ=255) tCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCt < 1:4994094/100‑1 (MQ=255) cATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTgg > 2:1014453/1‑89 (MQ=255) cATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTgg > 2:4228787/1‑89 (MQ=255) cATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTg < 1:861364/100‑1 (MQ=255) aTGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGc < 2:540040/89‑1 (MQ=255) tGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGtt > 1:4774667/1‑100 (MQ=255) gTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCtt < 2:2994709/89‑1 (MQ=255) tCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCttt < 2:4868262/89‑1 (MQ=255) tCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCt > 1:1123641/1‑100 (MQ=255) ccTCAAAGTGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTa > 1:3191852/1‑100 (MQ=255) ccTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCtttt > 2:2285846/1‑89 (MQ=255) ccTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTa > 1:3845615/1‑100 (MQ=255) cTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTtg > 2:3527554/1‑89 (MQ=255) cAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTtgtg > 2:1117162/1‑89 (MQ=255) cAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTtgtg > 2:3719447/1‑89 (MQ=255) cAAAATGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTtgtg > 2:3260857/1‑89 (MQ=255) aaaTGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAg < 1:2529547/100‑1 (MQ=255) aaaTGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAg < 1:342653/100‑1 (MQ=255) aTGGCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGcc < 1:1469795/100‑1 (MQ=255) ggCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTc < 2:3523706/89‑1 (MQ=255) gCGTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATc < 1:3713981/100‑1 (MQ=255) gTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTAc < 2:1269664/89‑1 (MQ=255) gTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTAc < 2:2585837/89‑1 (MQ=255) gTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTAc < 2:2018262/89‑1 (MQ=255) gTAACGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTAc < 2:911540/89‑1 (MQ=255) aaCGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGa > 2:3368725/1‑89 (MQ=255) aaCGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGGTCTACGa > 2:2501135/1‑89 (MQ=255) cGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAg < 2:4760567/89‑1 (MQ=255) cGTCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAg < 2:770475/89‑1 (MQ=255) tCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGcc > 2:2951373/1‑89 (MQ=255) tCCTATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGttt > 1:1021565/1‑100 (MQ=255) tATGCTTACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCa < 1:4519098/100‑1 (MQ=255) | GGGCAAATCAAAAAAAGTCTATATTTCACTTTGCCCGCGCCGCGAAAGTCACTGATAATGCGCCGCGTTCATGTCCTCAAAATGGCGTAACGTCCTATGC‑TACATTTGTTTGCTGGCCTGGATTTGCATACCGGGCTGTTATTATTGCTTGCACTGGCTTTTGTGCTGTTCTACGAAGCCATCAATGGTTTCCA > NC_000913/3637546‑3637739 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |