| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,391,775 | IS1 (+) +9 bp | 100% | coding (1259‑1267/1530 nt) | nuoM ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 59 (1.330) | 51/264 | NT | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2391783 | 0 (0.000) | coding (1259/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M | |||||
| * | ? | NC_000913 | 2391775 = | 0 (0.000) | 50 (1.130) | 42/264 | NT | 100% | coding (1267/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
| ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
TGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391910‑2391775‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058 TGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATG > 1:625049/1‑143 GGAGCTGGATGAGATGGCTGGCAGCACTTTCGCTTTTCTGTGCGGTGGCTACGCTTGGGATGCCTGGCTCCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGA < 2:744230/143‑1 GAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGAC > 2:855396/1‑143 AGATGACGTGGCTGCCAGCACCGTCGCTGTTCTTTGCGGTTGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAA < 2:324605/143‑1 GCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:625607/143‑1 CCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCGTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGTTAATGACTCCACCTTATTAAGAGTGT > 2:780759/1‑143 AGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATAATCCTGTTTGGCGGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT < 2:390903/143‑1 gTGTGGCTGTTCTTTGCGATGGAAATGCTTGGGGTGCCTGGCGCTGGTATCTTCGCCAGCGAATTTATTATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGGGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATG < 2:856904/142‑1 TGTGGCTGGTCGTTGCGGTGGCAACGCTTGGGGTGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGT < 2:781319/143‑1 CGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGAATTCAACTTATTGATAGTGGGATATGTTCA > 2:382812/1‑143 GCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 1:693379/143‑1 TTCTGTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAA < 1:74829/143‑1 CTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGACTTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGATGTACAGGTGATTACCGGGTAAGGACTCCAACATATTGATAGTGTCTTATGTTCAGATAATa > 1:562496/1‑142 GTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATG < 1:151206/143‑1 gGGCAGCCCTTGGGTTGCCGGGCCCCGGTAACTTCGTCGGCGAGTTGATGCTTCTGTTCGGCGGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:755541/142‑1 TGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGA < 2:533138/143‑1 TGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTACCAGGTAGTACCGGTGATTACCGGCTAATGACTCCCACTTATTGATAGTGCTTGATGTTCAGATAACGCCCGATGc > 2:147206/1‑142 AACTCTTGGGATGCCCGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT < 1:718782/143‑1 gggtgGCCGGGCCCCGGTAACTTCGTGGGCGAATTTATGATGCTGTTCTGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:473851/138‑1 GGGATGTCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATCTTGTTCGGGTGCTTCACGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATGGTGTTTTAGGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:582782/143‑1 GGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGCCTTTGTCATGC > 1:821658/1‑143 GGGAGGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTAGCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGC < 2:694041/143‑1 GATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCGGATAATGCCCGATGACTTTGTCCTGCcg > 1:17335/1‑141 ATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGC > 1:7732/1‑143 GCCTCGCACCGGTCACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTC < 1:292538/143‑1 CCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCC < 1:347663/143‑1 CTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTCCAGATCATGCCCGATGACTTTGTCATGCGGCTCCg > 2:643702/1‑142 CTGGCACCGGTAACTACGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA > 2:744285/1‑143 TGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATTATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCAC > 2:642185/1‑143 GGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 1:201937/143‑1 GGTAACTTCGTCGGCGAAGGTATGATGCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAAGGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 2:205064/143‑1 GTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCAGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG > 1:52535/1‑143 GGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC > 1:245298/1‑143 CGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAGTGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA > 1:32233/1‑143 ttctggTTCTGTCCGGCAGCTTCCAGGTTGTATCGGTGATTACCGGGCAATGACTCCATCTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATCATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCC < 2:469118/137‑1 TTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTGATGGATCTCCACGGGTTTTGAGGCCGACAGCGACTTCC > 1:85857/1‑143 ATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGT < 1:271834/143‑1 GATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCC > 1:247710/1‑143 CGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGC < 1:716200/143‑1 GCAGCTGCGAGGGTGTGCCGGTGATTACCGGGTAATGCCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGGCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCA < 2:96659/143‑1 CTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTG > 2:283069/1‑143 CTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTG > 2:238120/1‑143 cccgggTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTG < 1:428956/137‑1 CAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGC < 1:566284/143‑1 GTTGTCCCCGTGATTACCGGGTAATGCCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTGTGTTCAGATGATGCCCGATGACCTTGTCAGGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC < 2:276705/143‑1 GTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGCTAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC < 1:230325/143‑1 CCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCCCCGATCTTGAGAACGACAGCGACTTCCCTCCCACCCGTGCCAGATGCTGCCTCTGATTC > 2:132533/1‑143 CCGGTGATTACCGGGTAATGACTACAACTTCTTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGACGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTC > 1:605520/1‑143 ggcGATTACCGGGTAATGACTCTAACTTATTGTTAGTGTTTTATGTTCATCTAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAG < 2:176829/140‑1 TGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGg > 1:727081/1‑142 TACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACGCGATCAGGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < 1:642185/143‑1 TACCGGGTAATGACGCCAACTTATTGGTGGGGGTGTATGCTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCCCCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGGGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < 1:594944/143‑1 TGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391910‑2391775‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATG < NC_000913/3584195‑3584058 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |