| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 569053 = | 2947 (66.330) | 3 (0.070) | 3/252 | NT | 0.11% | coding (152/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase |
| ? | NC_000913 | 569077 = | 2668 (62.930) | coding (176/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 3162 total aligned reads displayed.
TCACCAGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGATTTTGAAT > NC_000913/568935‑569219 | tcaCCAGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGcaca > 2:440935/1‑143 (MQ=255)tcaCCAGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGACTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGcaca > 1:253565/1‑143 (MQ=255) gaGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCa < 1:511131/142‑1 (MQ=255) cAGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCa < 1:563368/143‑1 (MQ=255) ggTCAGATGTCGGGCAACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAATGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAgg < 1:668789/143‑1 (MQ=255) gTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGa < 2:865591/143‑1 (MQ=255) aGATGAGTGGCGACTCAGCAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGCAGCt > 1:205969/1‑143 (MQ=255) gTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCttttt < 2:406955/143‑1 (MQ=255) tgtGGCGACTTACTAGACCGACAGAGGTGGCTTATTGCTGAATGATTAAAGATAAGTAGTTTTTATTATCATGATAACATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGTATGCACAATCAGGAGCTTTTTc < 2:813852/141‑1 (MQ=255) tCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTc < 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cTCGTTAAACCGACAGAGAAGACTGATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAAtttt < 1:179020/143‑1 (MQ=255) tCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAAttttt > 2:292980/1‑143 (MQ=255) tCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAAttttt > 1:872689/1‑143 (MQ=255) cATTAAACCGACAGAGAAGAAATGTTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTa < 2:138948/143‑1 (MQ=255) ttAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGAGAGCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGa > 1:621726/1‑143 (MQ=255) aaCCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGc > 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cAGAGAAGACTTATAGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATaga < 2:635603/143‑1 (MQ=255) agagAAGACATATTGCTGAATGGGTAAAGGTAAATCATGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATtgag < 1:598920/143‑1 (MQ=255) agaagaCTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCa > 1:219008/1‑143 (MQ=255) aagaCTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATg < 1:493211/143‑1 (MQ=255) aagaCTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATg > 1:302367/1‑143 (MQ=255) gaCTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGt > 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tGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATGTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTGCGGAATTTTGAGATGCTATAGAGCATGGTTatatat < 1:477232/143‑1 (MQ=255) gCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAACGGAAAGCATGCACAATCAGGCGCTTTTTCGGAACTCTTAGACGCTACAGAGCATGCTTacatatc > 2:654355/1‑142 (MQ=255) cTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTg > 1:650305/1‑143 (MQ=255) cTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGCTATATATTg > 2:848062/1‑143 (MQ=255) cTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGATGTATATTg > 2:165050/1‑143 (MQ=255) tGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGc > 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1:745352‑M1/143‑1 (MQ=255) CATGCAAAGGTAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCAGGGTTATATATTGACAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGcgatttaa > 2:396334‑M1/1‑140 (MQ=255) tCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGt > 2:509740/1‑143 (MQ=255) tCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGt > 2:228360/1‑143 (MQ=255) aaaGGACAGCGTGCACAGTCAGGGGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGTTCTAGGGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCt < 2:762055/143‑1 (MQ=255) ggAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGaa < 1:415924/143‑1 (MQ=255) caggcacAATCAGGAGCTTGTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTGAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGAt < 1:789661‑M2/136‑1 (MQ=255) cATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAACGTCGGTGAAGGGATTGAACGTCGGAAATTGAt > 1:382924/1‑143 (MQ=255) cATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGAt < 1:271740/143‑1 (MQ=255) atgcacAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGGAAGGAGGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGAATGAAAGTCTGAAATTGAtt > 2:12057‑M2/7‑143 (MQ=255) tgcacAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTTGGTGAAGCCATTGAACGCCGGAAATTGAttt > 2:615620‑M2/6‑143 (MQ=255) gcacAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGAtttt < 1:703205‑M2/139‑1 (MQ=255) gcacAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATAGTTCCAGGAAGTACATAGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGAtttt > 1:81953‑M2/5‑143 (MQ=255) acAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGCAATTGATTTTGa > 2:460499‑M2/3‑143 (MQ=255) | TCACCAGGTCAGATGTCTGGCGACTCATTAAACCGACAGAGAAGACTTATTGCTGAATGGTTAAAGGTAAATAGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTTGAAAGTCTGGACAGACTTTCAAGAGAAAAAGTCGGTGAAGCGATTGAACGTCTGAAATTGATTTTGAAT > NC_000913/568935‑569219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |