New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 569159 | 1390 (38.780) | 47 (1.420) | 18/260 | 0.8 | 3.4% | coding (258/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase |
? | NC_000913 | = 569161 | 1380 (41.760) | coding (260/1527 nt) | ybcK | DLP12 prophage; putative recombinase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
AGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/569007‑569159 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tt‑gaaagtctgTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < NC_000913/569161‑569020 agctaaTATTATCGTGATACAATAACATATGAAGATTTAGGATTAGTTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGTAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGT < 2:362976/137‑1 AGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGT < 2:189615/143‑1 gtgttcATTAGCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAATGGAATGCTTGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT < 2:396159/137‑1 GTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGGTAGTT > 1:577990/1‑143 TGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑G > 2:483044/1‑143 TGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGAATGGTTATATATTGCTAGGAACTAGAGTGTTAGTT‑G > 2:314840/1‑143 TGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGAGTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑G > 2:235952/1‑143 TGATTATTATCTTGATACCATAACATAAGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATAAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGATATAGAGCATGGTTATATATTGCAAGGAACTACATTGTTAGTT‑G > 2:438196/1‑143 TGAGTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑G > 2:652714/1‑143 GATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GA > 2:526834/1‑143 GATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GA > 1:503393/1‑143 GATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GA > 2:150992/1‑143 GATTAATATCTTGATACCATAACAAATGAAGATTTAGGATTGAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATGAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GA < 2:251012/143‑1 ATTGTTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTATTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATAGTAAGTA‑GAA > 2:326768/1‑143 ATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAA > 1:419541/1‑143 ATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAA > 1:416435/1‑143 ATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATCCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAA < 1:631716/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGCAGACTTACGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGGTGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 1:168181/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 1:618606/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 1:151452/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 2:626157/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 2:648885/143‑1 TTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTGTTTCGGAATTTTTAGAGGCTATAGAGCACGCTTATATATTGCCAGGAACAACATTGTTAGCT‑GAAg > 2:487916/1‑142 TTATTATCTTGAGACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 2:552076/143‑1 TATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GTAAG > 1:340408/1‑143 TATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCAAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAG > 1:218944/1‑143 ATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGT < 1:295607/143‑1 TTATCTTGATACCATAACATATGAAGCTTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACACTGTTAGTT‑GAAAGTC > 2:168930/1‑143 TTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCTGGAACTACATGGTTAGTT‑GAAAGTC > 1:439729/1‑143 TTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTC < 1:403608/143‑1 TATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTTGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTCTATATTGCAAGGACCTATATTATTAGTTCGAAAGct > 2:585958/1‑141 TATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCT < 1:53531/143‑1 TATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCT > 1:319584/1‑143 TATCTTGAGACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCT < 1:561658/143‑1 agCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG < 2:449180/141‑1 ATCTTGATATCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTCTTAGTT‑GAAAGTCTG < 2:557815/143‑1 ATCTTGATACCATAACATATGACGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTCTATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG > 1:594627/1‑143 ATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG < 1:428172/143‑1 ATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG < 1:266316/143‑1 CTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCCAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCGTTCTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCAGGGCTATATATGGCCAGGCACAGGATTGTTAGTT‑GAGAGcatcga > 2:347586/1‑137 CTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTC < 1:281316/143‑1 CTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGGGCATTCAAAGGAAAGCATGCAAAATCAGGTGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGGGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTC < 2:107502/143‑1 ATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTC < 1:473146/143‑1 AACATCTGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAA < 1:193075/143‑1 AACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGTCCTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAA < 2:296292/143‑1 AACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAA < 2:199830/143‑1 AACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAA < 1:348396/143‑1 AACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAA < 2:142120/143‑1 agATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAAC < 2:93054/141‑1 TGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACA < 2:602824/143‑1 AAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAA < 2:229830/117‑1 acgagCAGGAGCTTTTTCGGAATGTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCAT < 2:84200/138‑1 ctctcacAAGTCCGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATAT < 1:394962/136‑1 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTACATCTTCATATGTT > 2:264124/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:376076/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 2:470260/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:292267/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 2:503743/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:526433/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:200703/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:170538/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 2:169790/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 2:608329/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCACGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:515950/1‑143 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTC < 2:154189/79‑1 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAACTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT < 1:600453/143‑1 TT‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTAGAGCAGCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTT > 1:248579/1‑143 T‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTA < 1:555325/143‑1 T‑GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTA < 2:270127/143‑1 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTCAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTGAATCCGAAATCTTCATATGTTAT > 2:258882/1‑143 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGCATGCACTTAATCCTACATCTTCATATGctct > 2:280859/1‑139 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTgt > 1:229106/1‑141 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTAT > 2:217685/1‑143 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTAT > 1:78786/1‑143 GAAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAACATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTAT > 1:111607/1‑143 GAAAGGCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTAT < 2:343407/143‑1 AAATTCGGTCCAGACGTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTTCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATG < 2:425406/143‑1 AAAGTCTGTCCAGACTTTCAGCTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATG < 2:165882/143‑1 AAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATG < 1:54224/143‑1 AAAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTACATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATG < 1:316623/143‑1 AAAGTCTCTCCAGCCTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATG < 1:128503/143‑1 AAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGG < 2:119141/143‑1 AAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGG < 1:452443/143‑1 AAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGG > 1:658253/1‑143 AAGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTATTTTTACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGG < 1:126347/143‑1 AAGTCTGTCCAGACTTGCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGG > 2:580430/1‑143 AGTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGT > 2:52213/1‑143 GTCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTA > 2:61569/1‑143 TCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGCAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGAACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATTGTAT > 2:414526/1‑143 TCTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTAT > 1:643247/1‑143 CTGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATC < 2:574639/143‑1 TGTCCAGTCTTTCAACTACCATTGTCGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCA < 2:285472/143‑1 TGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGTAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCGCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCA < 2:38632/143‑1 TGTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCA < 1:366303/143‑1 GTCCAGACTTTCTACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < 2:532249/143‑1 GTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA > 1:142435/1‑143 GTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < 2:457661/143‑1 GTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < 1:13972/143‑1 GTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < 1:464618/143‑1 GTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < 1:89400/143‑1 AGTGATTATTATCTTGATACCATAACATATGAAGATTTAGGATTAAGTGCATTCAAAGGAAAGCATGCACAATCAGGAGCTTTTTCGGAATTTTTAGATGCTATAGAGCATGGTTATATATTGCCAGGAACTACATTGTTAGTT‑GAAAGTCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/569007‑569159 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tt‑gaaagtctgTCCAGACTTTCAACTAACAATGTAGTTCCTGGCAATATATAACCATGCTCTATAGCATCTAAAAATTCCGAAAAAGCTCCTGATTGTGCATGCTTTCCTTTGAATGCACTTAATCCTAAATCTTCATATGTTATGGTATCAA < NC_000913/569161‑569020 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |