New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1879834 | 42 (0.920) | 3 (0.070) | 3/258 | NT | 6.7% | coding (115/360 nt) | yeaR | DUF1971 domain‑containing protein YeaR |
? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
CTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCA > NC_000913/2515474‑2515758 | cTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGGTCAACCCTTAGGTGGGCGCTTGTGGG < 1:25540‑M2/143‑1 (MQ=255) gAGCTTACAGGTGGCAATTCGTGGGACAGTATACCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAAAGAGAGGCATAGTCTTAACGAGGCACGGAGGCGTAGAATTCTTCAGATGGTTCAACACTTAAGTTAGCGAGTAGGGGATa > 2:28979/1‑143 (MQ=11) cTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAAtt < 1:318496/143‑1 (MQ=32) tACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTAGAACACGCAATTCAAGAACGCGAGGCATCGTCGTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTcc < 1:869077/143‑1 (MQ=255) aGGTGGCCATGCGTGGGACAGTATCCCAAACAGACAATAGATCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCg < 1:381614/143‑1 (MQ=11) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGGAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAAGTCCCCGGt > 1:579290/1‑143 (MQ=18) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGCTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATACTTCCCCggc > 2:617508/1‑142 (MQ=25) ggCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttt < 1:892940/143‑1 (MQ=39) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGttttttt > 1:805827/1‑143 (MQ=255) cGTGGAACAGTATCCTTGCCAGCATACAAACTGAAATGCAAGAACGCGCGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGgtttacccacgcctttccgtta > 2:325705‑M2/1‑121 (MQ=255) gTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCGCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAt < 2:451870/143‑1 (MQ=255) cTGACAGCCTACAAAACGCAATTGCAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATACTTCAAATGGTTCAACACTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAACTa > 1:840829/1‑143 (MQ=17) aCAAAACGCAATGAGAGAACGCGAGCCATCGTCTTAACGATGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTGTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg < 2:639934/143‑1 (MQ=18) aTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATc < 2:710570/143‑1 (MQ=255) aTTGAACATCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGNATTCTTCAGATTGTTCAACCCTTTCGTTANCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATc < 2:625659/143‑1 (MQ=21) atcgcgAGGCACGGTCGTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAGCCCTTACGTTATCGCTTATGTGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTCATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc < 2:601957/141‑1 (MQ=25) gCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAACTACCCTCGCAgc > 2:36424/1‑142 (MQ=255) aTCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGata > 1:837608/1‑143 (MQ=255) tCGTCTTAACGCGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGatat < 2:66947/143‑1 (MQ=255) gTCTTGACGAGGCACCGAGGCGCCGCAGTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGAGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTg < 1:62582/143‑1 (MQ=255) cTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCa < 1:588908/143‑1 (MQ=255) aaCGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAACTACCCTTGCAGATATTGCAccg > 1:239379/1‑142 (MQ=255) gAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTGCAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGTGATAATTCCCCGTTTTTTTTACGCCTTTTAATCAGCTAATGGCTGCTGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGa < 1:156172/143‑1 (MQ=37) aGGCACCGAGGCGTCGCATTCGTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGgtttacccacgcctttccgttatgcatggggcggtcaaatatctcggctacgctgatgaacacagtgcagagcctgatcaggtgat > 2:440861‑M2/1‑57 (MQ=255) cgCACCGGGGCGTCGCATGCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCCATCACATCCACTTTCAGATATTGCACCCCGAGc < 2:328663/142‑1 (MQ=37) acggtggCGTCGCGTTCTTCATGTGGTTCAACCCTTAAGTGAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTGTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTa < 2:546283/138‑1 (MQ=255) cggggCGTCGCATTCTGCAGGTGGTTCAGCCTTTGAGTTAGCGCGTAGCGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg < 2:647484/140‑1 (MQ=255) aTTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCct > 1:413340/1‑143 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctg > 1:408889/1‑143 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGAGt > 1:201918/1‑143 (MQ=255) cACCCCCTAAGGTAGCGCTTATGGCgtttacccacgcctttccgttatgcatggggcggtcaaatatctcggctacgctgatgaacacagtgcagagcctgatcaggtgatccttatcgaagcggggcagtttgcggtgttcc > 1:455752‑M2/1‑25 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCATCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCGCGAc > 2:547228/1‑143 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGAc > 1:671019/1‑143 (MQ=255) tAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcg < 1:492608/143‑1 (MQ=255) aGCGCTTTTGGGGTAATTCCCCGGTTTTTTTACTCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcgc < 2:374807/143‑1 (MQ=255) aGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAACTACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcgc > 1:782400/1‑143 (MQ=255) aGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcgc > 1:538127/1‑143 (MQ=255) gATAATTCCCCGGTTTTTTTTCGTCTGTTAATTAGCTAATGGCTGCGGGCGTCCACTCATTTTCTCTTGTAGATATTGCACGCTGTGCTTATGCCATAGCGCCTGCTGCTGTTTCGTGTCGTTAAAATGTGCGACCacacgtc > 2:379747/1‑140 (MQ=255) gATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAACCAAACACGCCTGCACATATTGCACCCCGTGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCATCTCTATCACCTTCGCGACCACACtag > 2:108765/1‑141 (MQ=255) | CTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCA > NC_000913/2515474‑2515758 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |