Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,866,488 | G→C | 7.0% | intergenic (+23/+71) | ygbN → / ← rpoS | putative transporter YgbN/RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,866,488 | 0 | G | C | 7.0% | 194.2 / 4.8 | 71 | intergenic (+23/+71) | ygbN/rpoS | putative transporter YgbN/RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base C (2/3); total (35/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.66e-01 |
TTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGC > NC_000913/2866347‑2866626 | ttGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGAAAGACAAACAGGATAGGTTGAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGGATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGc > 1:388145/1‑143 (MQ=255) attatatatTTGTGGTTCTCGGTATCCGTCGTTCTGAAGTCCTGGACTGTGTTAACGACCATTCTCGGTTCTACTGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCTGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCgg < 2:436167/138‑1 (MQ=255) cAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAc < 1:255803/143‑1 (MQ=255) aagtatCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAcc < 2:259275/140‑1 (MQ=255) aaaTATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAcc > 2:405738/1‑143 (MQ=255) aaaTATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAcc > 1:89172/1‑143 (MQ=255) aaaTATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGAcc > 1:891841/1‑143 (MQ=255) ttatCTGGGGTTGGCTGTAGCAGACGGTCTGATAACCTGGACAGTGTTTACGGCCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGGGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGCCCATCGGACC‑tt < 2:634765/142‑1 (MQ=255) ggatCTGGGGTGGTGGGTAGCGGACGGGCTGGAAGCCTGGACGGGGGTAACGACCATTCTCGGGTGTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAAGAGAAAGGTCCGATGCCCATCGGACC‑tt < 2:209753/141‑1 (MQ=255) ggTTTTCGGTAACAGCCGGTCTGCAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGGCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATtgtg < 1:651261/143‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATtgtg < 1:484113/143‑1 (MQ=255) ggTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATtgtg < 1:150321/143‑1 (MQ=255) ttGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGca < 2:529852/143‑1 (MQ=255) tGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGcac < 1:581718/143‑1 (MQ=255) gTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGGGGTAATTTGACCTTAATAAAACGGTCAGATGGGAACAGGAGA‑TTTTATTGTGAACAGaaa > 1:465128/1‑143 (MQ=255) gTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGaaa > 1:655081/1‑143 (MQ=255) tatgaggcGGTCTGAAAACCTGGAGAGTGGTAACGACGATTGTCGGGTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTGTGGGCGGTAAGTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGaaaa < 2:310616/136‑1 (MQ=255) cAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGc > 2:12267/1‑143 (MQ=255) gACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTCATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTCTATTGTGCACAGAAAAGGcaa > 2:106858/1‑141 (MQ=255) tCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTGAATAAAACCATCCGCTGGCCATCCGACC‑TTTTATTGTACACAGAAAAGGCCAGCCTc < 1:175613/143‑1 (MQ=255) tGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGc > 2:821776/1‑143 (MQ=255) tGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATCGGCATCGGGCC‑TTGTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGc > 1:10695/1‑143 (MQ=255) gAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCgtg > 2:537957/1‑141 (MQ=255) aaaaCCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCAGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCTCAGAAAAGGCCAGCCCCGCtt > 1:476065/1‑143 (MQ=255) aaCCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTga < 1:900279/143‑1 (MQ=255) ggACAGTGTTAACGATCATTCTCGGTTTTAGCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTg < 2:559781/143‑1 (MQ=255) aCAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGc > 1:700656/1‑143 (MQ=255) aCAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTAGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGc < 1:84201/143‑1 (MQ=255) aGTGTGAATGACTTTTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCt < 1:187900/143‑1 (MQ=255) ttAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCCCAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTCGCCTTCCt > 2:268773/1‑143 (MQ=255) ttAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGGAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCt > 1:545214/1‑143 (MQ=255) ttAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCt < 2:389678/143‑1 (MQ=255) ttAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCt < 2:389654/143‑1 (MQ=255) tcagcGACCAGTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGAGGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCt < 2:38882/139‑1 (MQ=255) aaCGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGa > 1:330536/1‑143 (MQ=255) aCGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAATAAGGTCCGATGGGCATCGTACC‑TTTTATTCTAATCAGAATAGGTCATCGTCTCTTGAGACTGGCCTTTCTGAc < 1:389177/143‑1 (MQ=255) cGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTAGCTTGAGACTGGCCTTCCTGACa > 1:616902/1‑143 (MQ=255) cATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGAGAGATg > 1:46157/1‑143 (MQ=255) ctcGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGctta > 1:412435/1‑143 (MQ=255) ctcGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGctta < 1:330862/143‑1 (MQ=255) gcgTTTTACCGGATTCTACATTCCCCATTACCTCTAGGCGGTAGTGTGAGCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGcttact < 1:762939/141‑1 (MQ=255) tCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTCACTTACTCGCGGAACac > 2:446829/1‑142 (MQ=255) ttAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAgcg < 2:805600/143‑1 (MQ=255) aaTTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCt < 1:41289/143‑1 (MQ=255) agtcgcTGGTGCGTATGGGCGGTAAGTTGACCTTAAGAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCtt < 2:594964/138‑1 (MQ=255) ttACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTc < 2:670779/143‑1 (MQ=255) gTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTc > 1:298626/1‑143 (MQ=255) gTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTc < 1:437534/143‑1 (MQ=255) gTGCGAATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTc < 1:121143/143‑1 (MQ=255) gTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGGCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTAGTGTGCACAGAAAGGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGcc > 1:696692/1‑143 (MQ=255) gtaaactGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCATCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGttt > 1:214830/7‑143 (MQ=255) gTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGACATTCAGCCCC‑TGCGttt > 2:301164/1‑143 (MQ=255) atgtGACCGTAATAAGAAGGTCCGATCGGAGTAGGAAC‑CTATATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCa < 2:888623/140‑1 (MQ=255) tttGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAg < 2:720526/143‑1 (MQ=255) tGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGa < 2:465479/143‑1 (MQ=255) cTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCCTTGCGTTTCCAGGAttt > 2:347561/1‑143 (MQ=255) ttACTAAAAAGGTCCGGTGGGCAGCGGCCG‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTcg < 2:30940/143‑1 (MQ=255) taataaAAATGTCCGATTCTCATCGTACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGTCCAGCCTCTCTTGAGACTTTCCTTTCTCACAGATGCTTACTTACTCGCGTAACAGCGCTTCTATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTcgc < 2:465128/143‑1 (MQ=255) aataaAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTcgcg > 1:720521/1‑143 (MQ=255) taaAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGCACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCa > 1:52579/1‑143 (MQ=255) taaAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTGTGCAGGATTTCGCGCa > 1:570660/1‑143 (MQ=255) taaAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCGTTCTGACCGATGCTTACTTCCTCGCGGGACAGCGCTTCGATATTCCGCCCC‑TACGTTTGCAGGCGTTCgcgcc > 1:263379/1‑142 (MQ=255) aaaaaGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCaa > 1:94507/1‑143 (MQ=255) aaaaGGGCCGATGGGCAGCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCaaa < 1:596975/143‑1 (MQ=255) ggTCCGATGCCCATCGGACCTTTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACCGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACgg > 1:95790/1‑143 (MQ=255) gTCCGATGCCCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCCGGATTTCGCGCAACCGgcg > 2:852942/1‑143 (MQ=255) tCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAACCGgcgc > 1:559311/1‑143 (MQ=255) ccGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGC‑TACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCACC‑TGCGGTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAg > 1:711751/1‑143 (MQ=255) cGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCCTACCCACTCGCGGAACCGCGCTTCGATATTCCGCCCC‑TGCGTTTGCAACACCTCGCCCCAACGCCGCac > 2:101279/1‑142 (MQ=255) aTGGGCATCGGCCC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGc < 1:271298/143‑1 (MQ=255) aTGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGc < 1:271170/143‑1 (MQ=255) | TTGTGACCAAATATCTGGGGTTGTCGGTAGCAGACGGTCTGAAAACCTGGACAGTGTTAACGACCATTCTCGGTTTTACCGGATTCTTAATTACCTGGTGCGTATGGGCGGTAATTTGACCTTAATAAAAAGGTCCGATGGGCATCGGACC‑TTTTATTGTGCACAGAAAAGGCCAGCCTCGCTTGAGACTGGCCTTTCTGACAGATGCTTACTTACTCGCGGAACAGCGCTTCGATATTCAGCCCC‑TGCGTTTGCAGGATTTCGCGCAAACGGCGCAGGC > NC_000913/2866347‑2866626 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |