| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,774,214 | C→T | 11.5% | intergenic (+20/‑210) | mtlA → / → mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component/mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,774,214 | 0 | C | T | 11.5% | 172.6 / 11.5 | 68 | intergenic (+20/‑210) | mtlA/mtlD | mannitol‑specific PTS enzyme IICBA component/mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/18); new base T (3/5); total (45/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
CGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCT > NC_000913/3774074‑3774348 | cGAGCACATTCAGTTTATCTCCAGCCTGACCAATTCACTGGATGATGATTTCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACAt < 1:475888/143‑1 (MQ=255) aacaacacTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCCCACACCACCAGCGTGGCTGAAGTGCGGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGCAATCCACTC‑CCACACTCTCCACGTg > 2:373345/5‑143 (MQ=255) aTTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGgagagg > 1:559840/1‑141 (MQ=255) tCATGTTATCGCCAGGCGGACCCATGCGCTGGATGATGAGTCCGTTTTCGAGCGTTTGGCACACACCACCCGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCATGTGGAGAGGGt < 2:100032/143‑1 (MQ=255) cAGGGTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTg < 1:694818/143‑1 (MQ=255) aGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTgg < 1:214735/143‑1 (MQ=255) gTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGCTGCAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAACC‑CCACCCTCTCCACATGGCGCAGCTgggg > 2:349325/1‑143 (MQ=255) gTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTgggg > 1:184412/1‑143 (MQ=255) gTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTgggg > 1:534555/1‑143 (MQ=255) tCACCTGCCTGACCAATGCACTGTATGAAGAGTCCGTGATCGAGCGTCTGGCACACCCCACCCTCGTGGATGCAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGAttgg < 2:912581/143‑3 (MQ=255) cccAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCGTACACCACCAGCGTGGATGAAGCGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAAtt < 2:125909/142‑1 (MQ=255) aCCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGGCGGTCAGCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAAtt > 2:556839/1‑143 (MQ=255) gACCACTGCACTGGATGATGAGTCCGTCACCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATg < 1:193892/143‑1 (MQ=255) tGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTa > 1:406677/1‑143 (MQ=255) ggATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCGGCGTGGCTGAAGTGCGGGAACTGCTGGGGAGCACAGACTGACCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTAt > 1:915249/1‑143 (MQ=255) gatgatGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATc > 1:427383/1‑143 (MQ=255) aGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa > 1:457086/1‑143 (MQ=255) aGTCCGTCATCGAGCGGCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTa < 1:302720/143‑1 (MQ=255) cATCGAGCGTCGGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATg < 2:865240/143‑1 (MQ=255) aTCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGATCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGCAGGTGGGGTTAATTGCCTGATCCGCTACGCTTATAAGGCCTACAGGATGc > 2:206496/1‑143 (MQ=255) cGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAt < 1:457907/143‑1 (MQ=255) gAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCCCCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATc > 1:443334/1‑143 (MQ=255) gAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGCTGCATc > 1:211429/1‑143 (MQ=255) aGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGGGAAGCTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATca > 1:668677/1‑143 (MQ=255) aGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATca > 1:582241/1‑143 (MQ=255) cGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCCCCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATcaca < 2:591013/143‑1 (MQ=255) tCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAt < 1:184802/143‑1 (MQ=255) tCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAt > 1:787436/1‑143 (MQ=255) tGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTAGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTCCAGGATGCATCACAAttt > 2:370202/1‑143 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCCGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTGAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt > 1:311332/1‑143 (MQ=255) gCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgt > 1:896854/1‑143 (MQ=255) gccgaccgccAGGGTGGATGCAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGTGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATttgttg < 2:208273/139‑1 (MQ=39) caccacCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAt > 1:824799/1‑143 (MQ=255) accaccAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAt‑t > 1:806356/1‑143 (MQ=255) caccaGGGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCGGGCAGGGCGTAAGCAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTg < 1:263399/143‑1 (MQ=255) ccaGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGCTGAGCTACGCTTCCCAGCCCTACAGGATGCCTCACAATTTGTCGAAT‑TCGCa > 2:889944/1‑143 (MQ=255) ccaGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCa > 1:78326/1‑143 (MQ=255) tGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTCATCAGGCCTACAGGATGCATCACACTCTGTTGAAT‑TTGCACGTTCt > 2:88221/1‑143 (MQ=255) ggctGAAGTGCTCGAACTGCCGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATG‑CGTCCCTCTCCGCATGCAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCtt < 1:763565/140‑1 (MQ=38) ggATGCAGGGGTGGAACTGCTGGCGGGTGGTAA‑TATTCGCATCTTCGGCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTGATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCtt < 2:645716/143‑1 (MQ=25) tGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTa < 2:713114/143‑1 (MQ=255) tGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCg < 1:215736/143‑1 (MQ=255) cTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTCGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGa > 2:706807/1‑143 (MQ=255) ggAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGACGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAACTCGTTGACT‑TTGCACGCTCTTGTAGGGCGGaga > 2:563524/1‑141 (MQ=38) ggAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACACTTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGCTa > 2:760048/1‑143 (MQ=255) gAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATaa > 1:786206/1‑143 (MQ=255) aaCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAg < 2:457086/143‑1 (MQ=255) aCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATGACAAGTTGTTCAAT‑TTGCACGTCCTTGTACGCCGGATGAgg > 1:727527/1‑143 (MQ=38) aCTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAgg < 1:282822/143‑1 (MQ=255) ctgctgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATACGCCCCGCATAACTGGCGTGCAGGATGCAGCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGgc < 1:251066/143‑1 (MQ=255) ctgctgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCAAATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGgc > 1:773188/1‑143 (MQ=255) tgGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCGACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAACAAAGTTCCGGGAAG‑TGGCACGTTCTTGTAGACCGGATCAGGCGCtg > 2:189874/1‑142 (MQ=37) gTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTAcgccg > 1:871390/1‑143 (MQ=255) taagtaaTCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACACATTGCTGAAG‑TTGCGCGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCCTc > 2:598478/1‑143 (MQ=37) ggtgatccaatc‑gCACCCTCTGCGTATGGTGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCg < 2:229208/139‑1 (MQ=25) atccaatc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGgcgc < 1:556839/143‑1 (MQ=255) tccaatc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACTTTCTTGTAGTCCGGATAAGGCCCTTACGCCGCATcctgacct > 2:573294/1‑137 (MQ=37) tccaatc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCt > 2:7658/1‑143 (MQ=255) ttaacc‑ccACCTTCTCCATGTGGAGCGGGAGGAATAAATTGCCTCATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TCGCACGTTCTCGTATGCCGACTAAGGCGCGTACGCCGCATCCGGCGCTg > 2:282630/6‑143 (MQ=16) caatc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGc > 2:73338/1‑143 (MQ=255) caatc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCAAAAC‑CGTCGCTGATTATATGACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGc > 1:209333/1‑143 (MQ=25) atc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGccc > 1:776642/1‑143 (MQ=255) tc‑cCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGcccc > 1:725052/1‑143 (MQ=255) ccACCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGTGT‑ATTCACACTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctc > 1:910642/1‑143 (MQ=25) ccACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTCCTGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAAGTTGTTGACT‑TTGCACGTTCTAATCCGCTTTTCTATGCGCTTACGCCGCACCCGCCGCTGccccgc > 2:190099/1‑141 (MQ=255) cACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCctct > 2:475298/1‑143 (MQ=255) aCCTTCTCCATGTGGAGAGGGTGGGATTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGCTGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTCGTCCAAAAGCAATGGATCTTTCGCCGCATCCGGCGCTGCCCCcctc > 1:167835/1‑143 (MQ=16) ccTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCGTACAGGATGCATTACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTctccg > 2:618601/1‑142 (MQ=255) | CGAGCACATTCAGGTTATCACCAGCCTGACCAATGCACTGGATGATGAGTCCGTCATCGAGCGTCTGGCACACACCACCAGCGTGGATGAAGTGCTGGAACTGCTGGCAGGTCGTAAGTAATCCAATC‑CCACCCTCTCCACATGGAGAAGGTGGGGTTAATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCTACAGGATGCATCACAATTTGTTGAAT‑TTGCACGTTCTTGTAGGCCGGATAAGGCGCTTACGCCGCATCCGGCGCTGCCCCTCTCCT > NC_000913/3774074‑3774348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |