Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 2,391,775 | IS1 (+) +9 bp | coding (1259‑1267/1530 nt) | nuoM ← | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | 64 (0.930) | 54/282 | 0.1 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 2391783 | 0 (0.000) | coding (1259/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M | |||||
* | ? | NC_000913 | 2391775 = | 0 (0.000) | 52 (0.750) | 47/282 | 0.4 | 100% | coding (1267/1530 nt) | nuoM | NADH:quinone oxidoreductase subunit M |
? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
GTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391911‑2391775 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG < NC_000913/3584195‑3584055 GTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGCTTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGGGGTTACCGGGTcgt > 1:776959/1‑140 TGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATG > 1:134916/1‑143 GAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCCGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGAC > 2:650086/1‑143 TGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGA < 1:452397/143‑1 GCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTGTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATA < 1:240032/143‑1 CAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT < 1:454592/143‑1 CACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTA < 1:1147140/143‑1 ttcgTGTTCTTTGCGTTGGCGACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGTCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGTGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTC < 2:604340/139‑1 GCTGTTCGTTGCGGTGCCAACGCGTGTGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAG < 2:554754/143‑1 TGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGAT > 1:1205898/1‑143 TTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGC > 1:583195/1‑143 TGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:407460/143‑1 cCGGTCGCAACGTTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGACTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG < 2:1140963/142‑1 CGGTCGCAGCGCTCTGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGTTGATTATCGTGTAATGAGTTCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 1:240571/143‑1 GGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGAT < 1:1153197/143‑1 AACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTT > 2:737372/1‑143 ACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGGATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTG < 1:513783/143‑1 GCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTC > 1:551042/1‑143 CTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 1:830226/143‑1 GATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCcg > 1:398159/1‑141 CTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCA < 1:652935/143‑1 catCGGTAACTTCGTCGGTGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGA < 2:36378/140‑1 ACCGATAACTTCGTCGGCGAATGTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGGTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGAT < 2:201753/143‑1 CGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCCGCTCCACCGATTT > 1:1109683/1‑143 GGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTT < 1:414154/143‑1 gtgACTTCGGCGGTGAATTGATGTTTCTGTTCCGCAGCTTCCAGGTTGTGCCGGTGCTTACCGGGTCATGACGCCAACTTATTGATCGTGTGTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTG < 2:271304/140‑1 AACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAG < 1:1224374/143‑1 CTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGCTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAA < 1:1015496/143‑1 cgtGCGAATTTATGATTCGGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACA < 2:403015/140‑1 CGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAG < 2:583195/143‑1 GGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGC < 2:521066/143‑1 CGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGA < 2:208726/143‑1 TTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTC < 2:134916/143‑1 TGTTCGGCAGCTTCCCGGTTGTACCGGGGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTCCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCC < 1:395375/143‑1 TGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCGACTTATTGATAGTGTTTTATGCTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCACAGCa > 1:950290/1‑142 TGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGTAGCTTCACCGATTTTGCGCACGACAGCGACGTCCGTCCCAGCC > 2:930699/1‑143 GTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTAGCGGGTAATGACTCCAACTAATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCG > 2:667332/1‑143 GTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACGTCCGTCCCAGCCG > 2:1209461/1‑143 CGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA < 2:306655/93‑1 CGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCA > 1:306655/1‑93 CAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAG < 1:371601/143‑1 TTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC > 2:639619/1‑143 TTCCAGGGTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGC < 1:531707/143‑1 CAGGTTGTACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACCTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGTAGCTCCACCGATTTTGCGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGC > 2:103102/1‑143 GTACCGGTGCTTACCGGGTAATGGCTCCACCTTATTGATAGTGTTTTATGTTCCGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGA < 2:241590/143‑1 ACCGGTGATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATT < 1:915915/143‑1 GATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTC < 1:896789/138‑1 GATTACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTC > 2:896789/1‑138 TACCGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCGCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGGTATG > 2:598921/1‑143 CGGGTAATGGCTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCCGTTAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTGTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCGGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG < 2:699924/143‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG < 2:182136/143‑1 CGGGTAATGACTCCAACTTAGTTATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTCCCGACCCAACGCAACTAGTTCCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG < 2:700194/143‑1 GTGGAGCAAGATGAAATGGCTGCCAGCACTGTCGCTGTTCTTTGCGGTGGCAACGCTTGGGATGCCTGGCACCGGTAACTTCGTCGGCGAATTTATGATTCTGTTCGGCAGCTTCCAGGTTGTACCGGTGATTACCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2391911‑2391775 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCG < NC_000913/3584195‑3584055 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |