Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,308,635 | 0 | T | C | 31.6% | 276.1 / 202.7 | 215 | E97G (GAA→GGA) | nlpI | lipoprotein NlpI |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (79/68); new base C (30/38); total (109/106) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.41e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.65e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
GTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAA > NC_000913/3308538‑3308733 | tAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAg < 1:4823622/100‑1 (MQ=255) ggATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCatat > 1:5677411/1‑100 (MQ=255) aTCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATcc > 1:5219647/1‑100 (MQ=255) aTCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATcc < 1:3599570/100‑1 (MQ=255) cAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCa > 2:310764/1‑89 (MQ=255) cAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCa > 2:815578/1‑89 (MQ=255) aGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTc < 1:3011202/100‑1 (MQ=255) gCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCg < 1:1776047/100‑1 (MQ=255) gCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCg < 1:5376214/100‑1 (MQ=255) cTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCgg > 1:3043873/1‑100 (MQ=255) cTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCgg < 1:2220959/100‑1 (MQ=255) cTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCgg > 1:4002748/1‑100 (MQ=255) cAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCata < 2:4460972/89‑1 (MQ=255) aaGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGAtt < 1:1068961/100‑1 (MQ=255) aGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTg > 1:4905313/1‑100 (MQ=255) gTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGc < 1:1001695/100‑1 (MQ=255) gTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATACATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATcc < 2:4895491/89‑1 (MQ=255) aCAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCgg > 2:4013413/1‑89 (MQ=255) cAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGt > 2:1670663/1‑89 (MQ=255) cAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAg < 1:3527940/100‑1 (MQ=255) gAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCg < 2:513169/89‑1 (MQ=255) gAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCg > 2:568132/1‑89 (MQ=255) gAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCg > 2:2278075/1‑89 (MQ=255) aaTCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAgcgc < 1:815578/100‑1 (MQ=255) aTCACACGCTTCATAGGCAGCATCCAAATTGCCTCCCTCCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATCTCCGGTCGGa > 2:190689/1‑89 (MQ=255) aTCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGCTAAATATATGCCTAAGTAATAGAATACTTCAGGCATATCGGGACGGa > 2:3395330/1‑89 (MQ=255) tCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGAt < 2:572742/89‑1 (MQ=255) cAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGAtt < 2:1979148/89‑1 (MQ=255) cAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTg > 1:268041/1‑100 (MQ=255) aaaCGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGc < 1:4582620/100‑1 (MQ=255) cGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGaa < 1:2887790/100‑1 (MQ=255) cTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAgc > 2:1191099/1‑89 (MQ=255) cTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGaaaa > 1:1659407/1‑100 (MQ=255) cTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGaaaa < 1:3462578/100‑1 (MQ=255) ttCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGaaaaa < 1:310764/100‑1 (MQ=255) tCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAgcgc < 2:2012280/89‑1 (MQ=255) aTAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCg < 1:3778378/100‑1 (MQ=255) tAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTg > 2:518660/1‑89 (MQ=255) tAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGt > 1:1492548/1‑100 (MQ=255) ggCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTa > 1:3908195/1‑100 (MQ=255) gcagcaTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTAc < 1:2283419/100‑1 (MQ=255) cagcaTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGaa < 2:1577804/89‑1 (MQ=255) agcaTCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTAcgc > 1:1354330/1‑100 (MQ=255) tCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTa > 1:980861/1‑100 (MQ=255) tCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTa > 1:6195999/1‑100 (MQ=255) tCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTa < 1:174215/100‑1 (MQ=255) cAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCg < 2:5513426/89‑1 (MQ=255) aaaaTTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAAt > 1:3493372/1‑100 (MQ=255) aaTTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTa < 2:3925466/89‑1 (MQ=255) gcctgcctGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTc < 1:5905992/100‑1 (MQ=255) cctgcctgCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACgcgc > 2:5261937/1‑89 (MQ=255) cctgcctgCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACgcgc > 2:2686926/1‑89 (MQ=255) cctgcctgCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACgcgc > 2:3610311/1‑89 (MQ=255) cctgcctgCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCa < 1:2962302/100‑1 (MQ=255) tgcctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGa > 1:2647688/1‑100 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAAt > 2:3189181/1‑89 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGAcc > 1:3214410/1‑100 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGAcc < 1:735409/100‑1 (MQ=255) cctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAACTGAATACTCCAGGCATATCCGTTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAAt < 2:3688119/89‑1 (MQ=255) ctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATg > 2:793118/1‑89 (MQ=255) ctgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATg < 2:1455421/89‑1 (MQ=255) tgcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGAGAAAAATCGTTACGCGCTAATGc < 2:790329/89‑1 (MQ=255) gcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCgag > 1:4362332/1‑100 (MQ=255) gcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCgag < 1:4143783/100‑1 (MQ=255) gcGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCgag > 1:380330/1‑100 (MQ=255) cGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCGGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGccc < 2:4839904/89‑1 (MQ=255) ttAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACt > 1:4096426/1‑100 (MQ=255) aaaTATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAg < 2:242886/89‑1 (MQ=255) aaaTATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACACGCTAATGCCCTCAg > 2:4263836/1‑89 (MQ=255) aaTATATGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGa < 2:5059548/89‑1 (MQ=255) tatGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATac < 1:2406147/100‑1 (MQ=255) atGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATaca > 1:4487478/1‑100 (MQ=255) atGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATaca < 1:2092006/100‑1 (MQ=255) atGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCgag < 2:29664/89‑1 (MQ=255) tGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaa > 1:14047/1‑100 (MQ=255) tGCCTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaa > 1:4950870/1‑100 (MQ=255) cTAAGTAATTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAacac > 1:2749900/1‑100 (MQ=255) aaGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATc < 2:5281439/89‑1 (MQ=255) aaGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTc < 1:518660/100‑1 (MQ=255) tAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATa > 2:515093/1‑89 (MQ=255) aTTGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATaca < 2:4476343/89‑1 (MQ=255) ttGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCt < 1:6020619/100‑1 (MQ=255) tGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaac > 2:6222207/1‑89 (MQ=255) tGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATacaac < 2:6320804/89‑1 (MQ=255) tGAATACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTc < 1:5923921/100‑1 (MQ=255) gAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCa > 1:195093/1‑100 (MQ=255) gAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCa > 1:3606004/1‑100 (MQ=255) aaTACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCat < 1:5229605/100‑1 (MQ=255) aaTACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCat < 1:4701888/100‑1 (MQ=255) aaTACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCat < 1:5049647/100‑1 (MQ=255) aaTACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCat > 1:6338203/1‑100 (MQ=255) aTACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCata > 1:1624229/1‑100 (MQ=255) tACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTc < 2:4639538/89‑1 (MQ=255) tACTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTc < 2:1354330/89‑1 (MQ=255) aCTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCAtata < 1:4433640/100‑1 (MQ=255) aCTCCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAGAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCAtata > 1:6310330/1‑100 (MQ=255) cTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATaa > 1:239256/1‑100 (MQ=255) ttCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCcgc > 2:5036124/1‑89 (MQ=255) ttCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATaaa > 1:5265944/1‑100 (MQ=255) ttCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATaaa > 1:1575283/1‑100 (MQ=255) | GTAAGTTGGATCAAGCTCAAGTACAGAATCAAACGCTTCATAGGCAGCATCAAAATTGCCTGCCTGCGTTAAATATATGCCTAAGTAATTGAATACTTCAGGCATATCCGGTCGGATTGCCAGCGCTTGCGAAAAATCGTTACGCGCTAATGCCCTCAGACCGAGACTATCATACAACACTCCGCGCTCATATAAA > NC_000913/3308538‑3308733 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |