New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 7100 = | 163 (1.140) | 9 (0.070) | 6/264 | NT | 5.9% | coding (860/1431 nt) | yaaJ | putative transporter YaaJ |
? | NC_000913 | 7130 = | 131 (0.960) | coding (830/1431 nt) | yaaJ | putative transporter YaaJ |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
GGATAAGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCACTCTCAAAA > NC_000913/6951‑7249 | gggcaacttccccacgtcatttggtctatttttgagagtgcttttggctggcaggaagcggcaggcggcgcggcgggatataccttaagccaggcgattactaacggttttcagcgcagtatgttttccaatgaggcgggaatgggttcg > 1:1049337‑M1/150‑150 (MQ=255) tAAGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcg > 2:1392502/1‑150 (MQ=255) caacttccccacgtcatttggtctatttttgagagtgcttttggctggcaggaagcggcaggcggcgcggcgggatataccttaagccaggcgattactaacggttttcagcgcagtatgttttccaatgaggcgggaatgggttcGAcg < 1:2407755‑M1/4‑1 (MQ=255) aacttccccacgtcatttggtctatttttgagagtgcttttggctggcaggaagcggcaggcggcgcggcgggatataccttaagccaggcgattactaacggttttcagcgcagtatgttttccaatgaggcgggaatgggttcGAcgc > 1:2396214‑M1/146‑150 (MQ=255) acttccccacgtcatttgggctatttttgagagtgcttttggctggcaggaagcggcaggcggcgcggcgggatataccttaagccaggcgattactaacggttttcagcgcagtatgttttccaatgaggcgggaatgggttcGAcgcc > 2:2472891‑M1/145‑150 (MQ=255) aGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcgcc > 2:766189/1‑150 (MQ=255) aGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcgcc > 1:2173556/1‑150 (MQ=255) aGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcgcc > 1:1804273/1‑150 (MQ=255) gCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcgccg > 1:413824/1‑150 (MQ=255) cTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGAcgccgc > 2:70254/1‑150 (MQ=255) tGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACgccgct > 2:315802/1‑150 (MQ=255) tGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACgccgct > 2:307053/1‑150 (MQ=255) aTACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTCGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACgccgctgcc < 2:1191251/150‑1 (MQ=255) tACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACgccgctgccg < 1:950424/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGccgctgccgctg > 1:574656/1‑150 (MQ=255) cTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATAAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTCGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGccgctgccgctg > 2:18154/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCgctgccgctgcc > 2:1938791/1‑150 (MQ=255) aGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCcgcg > 1:2273665/1‑150 (MQ=255) 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tAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTc < 2:1774637/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGa > 1:359133/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGa < 1:2112222/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAAc < 2:165295/150‑1 (MQ=255) ttGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAAc < 1:1724718/150‑1 (MQ=255) 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aTGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTatat < 2:1369984/150‑1 (MQ=255) atcatcTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCccgcc < 2:413824/150‑1 (MQ=255) tGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCcgccgcgccg > 1:257391/1‑150 (MQ=255) aaTCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGc < 1:1073210/150‑1 (MQ=255) cccTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGc > 2:1108843/1‑150 (MQ=255) ccTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCt > 1:1427942/1‑150 (MQ=255) ttGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTc > 2:1807934/1‑150 (MQ=255) tGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTcc < 1:1512285/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTcc < 1:1148179/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTg < 1:1938791/150‑1 (MQ=255) cgcTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTg < 2:2355854/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTgcc < 1:18665/150‑1 (MQ=255) cTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTgcc < 1:1410222/150‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTgccag < 2:1232136/150‑1 (MQ=255) ccGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTgccagc < 2:601191/150‑1 (MQ=255) gCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAg < 2:920696/150‑1 (MQ=255) gAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCAc < 1:496499/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCAct < 1:1880187/150‑1 (MQ=255) gCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCActct < 2:2158259/150‑1 (MQ=255) cAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCACTCTCa > 2:496124/1‑150 (MQ=255) ggACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCACTCTCaaa > 2:839766/1‑150 (MQ=255) GACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTAGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTTGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCTCTTCCTGCCAGCCAAAAGCACTCTTaaaa > 1:816167‑M1/1‑150 (MQ=255) | GGATAAGCTGAATACCTTCCAGCGGCATGTAGGTTGTGCCGTTACCCGCCAGTAATATCAGCATGGCGCTTGCCGTACAGATGACCAGGGTGTCGATAAAAATGCCAATCATCTGGACAATCCCTTGCGCTGCCGGATGCGGAGGCCAGGACGCCGCTGCCGCTGCCGCGTTTGGCGTCGAACCCATTCCCGCCTCATTGGAAAACATACTGCGCTGAAAACCGTTAGTAATCGCCTGGCTTAAGGTATATCCCGCCGCGCCGCCTGCCGCTTCCTGCCAGCCAAAAGCACTCTCAAAA > NC_000913/6951‑7249 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |