New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 213120 = | 131 (0.940) | coding (790/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
TGGCCGCATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCG > NC_000913/212934‑213232 | acggatttaatccaccacagttgcgactgatagcgtcggatttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgccct > 1:708669‑M1/150‑150 (MQ=255) cggatttaatccaccacagttgcgactgatagcgtcggatttccaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgccctg < 2:874913‑M1/2‑1 (MQ=255) ggatttaatccaccacagttgcgactgatagcgtcggatttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgccctgc > 2:282851‑M1/148‑150 (MQ=255) 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cGCATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCC > 2:1099949‑M1/1‑150 (MQ=255) cATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCccgc > 2:411256/1‑150 (MQ=255) ttttGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCccgccg > 2:630359/1‑150 (MQ=255) cGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCgcggc < 1:1906020/150‑1 (MQ=255) aaGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCGGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGcggcgcggcgt < 2:562159/150‑2 (MQ=255) 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gCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACg < 1:1010858/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACg > 1:752146/1‑150 (MQ=255) ccAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGt > 1:400623/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGATGAGTGATTCCCGCCGCGCGGCGATTATACGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGCCGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTggg > 2:860296/1‑150 (MQ=255) cTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGgc < 1:1571012/150‑1 (MQ=255) ggCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGgcgc > 2:2435367/1‑150 (MQ=255) ggCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGgcgc > 2:1400002/1‑150 (MQ=255) gCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGcgcg < 2:2120879/150‑1 (MQ=255) cGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGt > 2:923608/1‑150 (MQ=255) cGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGt > 1:1005964/1‑150 (MQ=255) aTGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGttt > 2:954864/1‑150 (MQ=255) gAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGa < 1:135747/150‑1 (MQ=255) aGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGTTGGCTGGCAgggcatcactcatcgccagcattggcacaatctgcagcgtcccctgcggcgattgacagtgtgctaaatcatctgccagcagttcatccagcaggctctcttgttcag < 1:1983949‑M2/150‑109 (MQ=255) aGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAgggcatcactcatcgccagcattggcacaatctgcagcgtcccctgcggcgattgacagtgtgctaaatcatctgccagcagttgatccagcaggctctcttgttcag < 1:2433446‑M2/150‑109 (MQ=255) aGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAgggcatcactcatcgccagcattggcacaatctgcagcgtcccctgcggcgattgacagtgtgctaaatcatctgccagcagttcatccagcaggctctcttgttcag < 2:1945635‑M2/150‑109 (MQ=255) gTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGaaa < 2:1927858/150‑1 (MQ=255) tGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAtcactcatcgccagcattggcacaatctgcagcgtcccctgcggcgattgacagtgtgctaaatcatctgccagcagttcatccagcaggctctcttgttcagcacaaag < 2:500910‑M2/150‑111 (MQ=255) gATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCCCCGCTGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCCCCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATc > 1:231969/1‑150 (MQ=255) gATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATc < 1:63330/150‑1 (MQ=255) gATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATc > 2:2340030/1‑150 (MQ=255) TGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCg < 1:1378129‑M1/150‑1 (MQ=255) TGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCg < 2:1940777‑M1/150‑1 (MQ=255) | TGGCCGCATTTTGCCGAAGCAACGGCCCGCAGCGCCGCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCG > NC_000913/212934‑213232 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |