| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | 438168 = | 133 (0.930) | 7 (0.050) | 5/262 | NT | 5.6% | intergenic (‑33/+147) | yajO/dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO/1‑deoxy‑D‑xylulose‑5‑phosphate synthase |
| ? | NC_000913 | 438259 = | 109 (0.800) | intergenic (‑124/+56) | yajO/dxs | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase YajO/1‑deoxy‑D‑xylulose‑5‑phosphate synthase | |||||
Only 100 of 159 total aligned reads displayed.
GCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTA > NC_000913/438019‑438317 | tttattccgcaaggaactcaggaagaaatgcgcgccgaactcggcctcgatgccgctggtatggaagccaaaatcaaggcctggctggcataatccctactccactcctgctatgcttaagaaattattcatagactctaaataattcga > 2:1005091‑M1/150‑150 (MQ=255) ttattccgcaaggaactcaggaagaaatgcgcgccgaactcggcctcgatgccgctggtatggaagccaaaatcaaggcctggctggcataatccctactccactcctgctatgcttaagaaattattcatagactctaaataattcgAg < 2:2159640‑M1/2‑1 (MQ=255) ttattccgcaaggaactcaggaagaaatgcgcgccgaactcggcctcgatgccgctggtatggaagccaaaatcaaggcctggctggcataatccctactccactcctgctatgcttaagaaattattcatagactctaaataattcgAg < 2:1290547‑M1/2‑1 (MQ=255) ctTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAg < 2:705362/150‑1 (MQ=255) tttCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGt < 1:198328/150‑1 (MQ=255) cttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCTGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGc > 2:49191/1‑150 (MQ=255) ttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTTTACTCTTCATACTTCTAGTTGct < 2:381299/150‑2 (MQ=255) ttcCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCa < 2:2276637/150‑1 (MQ=255) 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tgcCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTc > 2:1528488/1‑150 (MQ=255) cTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCAt < 2:2121794/150‑1 (MQ=255) cTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGc < 1:1036954/150‑1 (MQ=255) cTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGc < 2:2341500/150‑1 (MQ=255) cTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggag > 2:49865/1‑150 (MQ=255) cGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggagtg > 1:1262209/1‑150 (MQ=255) cATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAggagtggag > 1:2475599/1‑150 (MQ=255) aTACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTATTAAGCATAGCAggagtggagt < 1:61414/150‑1 (MQ=255) aCTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAg > 1:30517/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAgg > 1:500330/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAgg > 1:2141012/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAgg > 1:1511224/1‑150 (MQ=255) cTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAgg > 1:1227142/1‑150 (MQ=255) tCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGa < 2:2395985/150‑1 (MQ=255) cAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGAt < 1:519789/150‑1 (MQ=255) AGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCATGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTa < 2:1356548‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCTTTCTTCCGGCAGTGTCCATGCGTGATTACCGCGATCTGGCTCGCCAAAGGTCATACAGCCGAGGCAAAGTCGGGAAACGCGAAGGTCGGTTTTTCCTAAGGGGTTGTATTGCATGCTGCCACTCCTGCTATACTCGTCATACTTCAAGTTGCATGTGCTGCGGCTGCATTCGTTCACCCCAGTCACTTACTTATGTAAGCTCCTGGGGCTTCACTCGTTTGCCGCCTTCCTGCAACTCGAATTATTTAGAGTCTATGAATAATTTCTTAAGCATAGCAGGAGTGGAGTAGGGATTA > NC_000913/438019‑438317 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |