| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2250781 = | 136 (0.950) | 7 (0.050) | 6/256 | NT | 5.5% | intergenic (+15/‑59) | yeiH/nfo | conserved inner membrane protein YeiH/endonuclease IV |
| ? | NC_000913 | 2250833 = | 116 (0.870) | intergenic (+67/‑7) | yeiH/nfo | conserved inner membrane protein YeiH/endonuclease IV | |||||
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
CTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGCCT > NC_000913/2250632‑2250930 | cTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGc > 2:1055719/1‑150 (MQ=255) gcgtcgtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTcc < 2:883412‑M1/4‑1 (MQ=255) gTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGAGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTTGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCt < 2:63777/150‑1 (MQ=255) cgtcgtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCt < 2:1495325‑M1/5‑1 (MQ=255) gtcgtgatcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTg > 1:872904‑M1/145‑150 (MQ=255) gtcgtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTg > 2:2005986‑M1/145‑150 (MQ=255) cTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGt > 1:1909591/1‑150 (MQ=255) gtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTa < 1:1960199‑M1/9‑1 (MQ=255) gACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTa > 1:173419/1‑150 (MQ=255) ccACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAc > 1:1558427/1‑150 (MQ=255) cACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAcc < 2:1817224/150‑1 (MQ=255) aCTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAccc > 1:1380491/1‑150 (MQ=255) aCTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAccc > 1:1942487/1‑150 (MQ=255) cTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAaccc > 1:2089428/1‑149 (MQ=255) cTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGCGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCg < 1:2283902/150‑1 (MQ=255) tCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGc < 1:2382902/150‑1 (MQ=255) cACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCt > 1:1072574/1‑150 (MQ=255) cACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCt > 1:818426/1‑150 (MQ=255) cGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTAt < 2:1774586/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCGCGCTCAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTTCTGTTTGCCTGGCTGAGTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAACCCACTACATCTTGCTCCTGTTTACCCGCttt > 2:383067/1‑148 (MQ=255) tCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCa < 1:2071983/150‑1 (MQ=255) cgcgcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTAc > 1:1150432/1‑150 (MQ=255) cgcgcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTGTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTAc < 2:1701402/150‑1 (MQ=255) cgcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCg < 2:297643/150‑1 (MQ=255) gcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGt > 2:2112296/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGtt > 1:1117326/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGtt > 2:1909264/1‑150 (MQ=255) gAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGtttt < 2:1392248/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTtc < 1:1668796/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTtcc > 1:1514460/1‑150 (MQ=255) tGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCg < 2:901297/150‑1 (MQ=255) tGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCg > 2:594593/1‑150 (MQ=255) cGAAACCTCTGGTGATGGCTCTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCTAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGttt < 2:833152/150‑1 (MQ=255) 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aTGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGcc > 1:1433508/1‑150 (MQ=255) ggATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCa < 2:1538199/149‑1 (MQ=255) gATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCaa > 1:2229363/1‑150 (MQ=255) gATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCaa > 2:1655592/1‑150 (MQ=255) aaGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTcgcg < 1:2458874/150‑1 (MQ=255) gCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGcgcc > 2:857357/1‑150 (MQ=255) gCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGcgcc < 2:5835/150‑1 (MQ=255) tCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCgccgcc < 2:1420551/150‑1 (MQ=255) cATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGccgccg < 2:1347842/150‑1 (MQ=255) aTCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGAGGGATTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGATCGCACGTTAGAGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCcgacga > 1:915454/1‑150 (MQ=255) gCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCCTTTTCCTCCAGCCGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAAt > 1:2211368/1‑150 (MQ=255) cATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATc < 2:249884/150‑1 (MQ=255) cATAAACCACTACATCTTGCTCATGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATc > 2:2145019/1‑150 (MQ=255) aTAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGTACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCg > 1:596776/1‑150 (MQ=255) aaCCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATGATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACg > 2:2354530/1‑150 (MQ=255) aaCCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACg < 1:2300296/150‑1 (MQ=255) aCCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGc < 2:502/150‑1 (MQ=255) aCCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGc > 1:139721/1‑150 (MQ=255) aCTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAAc > 1:1883116/1‑150 (MQ=255) tCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGtt > 1:1807153/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGttt < 2:1117326/150‑1 (MQ=255) ttGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTg < 2:1337663/150‑1 (MQ=255) gCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGcc > 1:1034192/1‑150 (MQ=255) gCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGcc < 2:1238062/150‑1 (MQ=255) CTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGCCt > 1:1718331‑M1/1‑150 (MQ=255) CTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGCCt < 1:498590‑M1/150‑1 (MQ=255) | CTGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGCCT > NC_000913/2250632‑2250930 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |