| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 213119 | 135 (0.980) | coding (789/1299 nt) | tilS | tRNA(Ile)‑lysidine synthetase | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAA > NC_000913/212970‑213263 | gcACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGAAGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTCTGCCAATGATGGCGATGAGAGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGATCGCTggca > 1:732098/1‑150 (MQ=255)cggatttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgccc‑‑‑‑‑GCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcagggca > 2:1499012‑M1/114‑150 (MQ=255)cggatttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgccc‑‑‑‑‑GCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCCGGCTggcagggca > 1:1561299‑M1/114‑150 (MQ=255) cACTTTGTGTTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAg < 2:1116633‑M2/150‑2 (MQ=255) cACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAg > 1:319832‑M2/1‑149 (MQ=255) cACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAg < 1:37499‑M2/150‑2 (MQ=255) gatttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgcccTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcagg > 2:1115442‑M1/112‑150 (MQ=255) tttcaaacgcgcccaaacgtaaacagggtgaggcatcttcccgcgccagcgccacttcctgccagatcctcaccaacgcgtcgcgggaaggcatcggtgcattctgcccTGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTggcagggc > 2:824988‑M1/110‑150 (MQ=255) 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aTCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtg < 2:2403956/150‑1 (MQ=255) ccgccgCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACtgtg > 2:46560/1‑150 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtgg > 1:2036167/1‑150 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtgg > 1:1137141/1‑150 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtgg < 1:1099949/150‑1 (MQ=255) cgccgcTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTgtgg > 2:14924/1‑150 (MQ=255) ctggctggCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGAt < 1:1461696/150‑1 (MQ=255) tggctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGAtt < 1:769812/150‑1 (MQ=255) ggctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTa < 1:448338/150‑1 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTaaa > 1:1916304/1‑150 (MQ=255) ctggcAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTaaa > 1:1335196/1‑150 (MQ=255) | GCACTTTGTGCTGAACAAGAGAGCCTGCTGGATGAACTGCTGGCAGATGATTTAGCACACTGTCAATCGCCGCAGGGGACGCTGCAGATTGTGCCAATGCTGGCGATGAGTGATGCCCGCCGCGCGGCGATTATCCGCCGCTGGCTGGCAGGGCAGAATGCACCGATGCCTTCCCGCGACGCGTTGGTGAGGATCTGGCAGGAAGTGGCGCTGGCGCGGGAAGATGCCTCACCCTGTTTACGTTTGGGCGCGTTTGAAATCCGACGCTATCAGTCGCAACTGTGGTGGATTAAA > NC_000913/212970‑213263 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |