| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 420323 = | 112 (0.780) | 7 (0.050) | 6/262 | NT | 6.3% | coding (733/1320 nt) | brnQ | branched chain amino acid transporter BrnQ |
| ? | NC_000913 | 420352 = | 103 (0.760) | coding (762/1320 nt) | brnQ | branched chain amino acid transporter BrnQ | |||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
TTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGA > NC_000913/420203‑420501 | gttaccaggcaggcgatgaagattaacgccgccagcaggaagctaccgccgccgccaaaggtgtgctgaacgtaagcatgcagaatagcagcgccgtttgcagactgatcgaccagcgacGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGcgcg > 2:2354480‑M1/121‑150 (MQ=255) ttGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGt < 2:45682/150‑1 (MQ=255) ttGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGt < 2:2040649/150‑1 (MQ=255) tCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTgg < 2:93014/150‑1 (MQ=255) ggcaggcgatgaagattaacgccgccagcaggaagctagcgccgccgccaaaggtgtgctgaacgtaagcatgcagaatagcagcgccgtttgcagactgatcgagcaccgacGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTgg > 1:2145402‑M1/114‑150 (MQ=255) gcaggcgatgaagattaacgccgccagcaggaagctaccgccgccgccaaaggtgtgctgaacgtaagcatgcagaatagcagcgccgtttgcagactgatcgaccagcgacGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt > 2:1393413‑M1/113‑150 (MQ=255) gcaggcgatgaagattaacgccgccagcaggaagctaccgccgccgccaaaggtgtgctgaacgtaagcatgcagaatagcagcgccgtttgcagactgatcgaccagcgacGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt > 2:1384744‑M1/113‑150 (MQ=255) cGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt < 2:1946963/150‑1 (MQ=255) cGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt < 1:543075/150‑1 (MQ=255) cGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt > 1:493978/1‑150 (MQ=255) cGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGt < 1:2275233/150‑1 (MQ=255) gTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTc < 2:885525/150‑1 (MQ=255) gTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGGCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGGCAGACAGCGCGTCGCTGGTc < 2:597068/150‑1 (MQ=255) caggcgatgaagattaacgccgccagcaggaagctaccgccgccgccaaaggtgtgctgaacgtaagcatgcagaatagcagcgccgtttgcagactgatcgaccagcgacGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTc > 1:1021839‑M1/112‑150 (MQ=255) ttATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCg < 2:321273/150‑1 (MQ=255) tATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTTGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGa > 2:349250/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAg > 1:26060/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAg > 2:384946/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGACTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGCCTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTAAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAg > 2:1353336/1‑150 (MQ=255) gTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATAACGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAg > 1:35359/1‑150 (MQ=255) tAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTc > 2:1891268/1‑150 (MQ=255) tAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTc > 1:1905357/1‑150 (MQ=255) tAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTc < 1:1967003/150‑1 (MQ=255) cggcgCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCaa < 2:789057/150‑1 (MQ=255) gcgTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACgg < 1:1124018/150‑1 (MQ=255) tctcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgct > 1:1720983/1‑150 (MQ=255) ctcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctg < 2:1090303/150‑1 (MQ=255) ctcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctg > 2:2101397/1‑150 (MQ=255) tcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctgc < 2:412443/150‑1 (MQ=255) tcGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctgc < 1:1353656/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCgctgct > 2:1139770/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTa < 1:2360617/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTAt > 1:1090395/1‑150 (MQ=255) 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ccTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCgcctgccgtta > 2:674920/1‑146 (MQ=255) gacgcgctgtctgaccccagacggaacagcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTa > 2:332053‑M2/33‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTa > 2:2011516/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGTTCCGGCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTaa < 2:2367572/150‑1 (MQ=255) cgctgtctgaccccagacggaacagcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACgg > 1:479982‑M2/29‑150 (MQ=255) CGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACgg < 1:824092‑M1/150‑1 (MQ=255) GCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGc > 2:2441873‑M1/1‑150 (MQ=255) GTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGt < 1:1306579‑M1/150‑1 (MQ=255) tCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGACTGCAAACCGCGCTCCTAATCTGCATGCTTACGATCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTg > 1:1489411/1‑150 (MQ=255) cGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGc > 2:1377906/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGcc > 2:1060207/1‑150 (MQ=255) gTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGcc < 2:1949568/150‑1 (MQ=255) gggTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGAcc < 1:2408277/150‑1 (MQ=255) gggTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGAcc < 2:916814/150‑1 (MQ=255) cAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGACCTGACCtgtg > 1:2202773/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCt > 2:2236923/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCt > 1:1353465/1‑150 (MQ=255) gACAGCGCGGCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCt < 2:805442/150‑1 (MQ=255) gcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTtgtg > 1:1009677‑M2/5‑150 (MQ=255) gcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCAGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTAGGCGTCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTCCTtgtg > 2:1740101‑M2/5‑150 (MQ=255) gcgcGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGATTCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCATTCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTtgtg > 2:1748817‑M2/5‑150 (MQ=255) gTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGa > 1:1924856/1‑150 (MQ=255) | TTTGGTATCGTTATTGTTAACGCGGCGCGTTCTCGTGGCGTTACCGAAGCGCGTCTGCTGACCCGTTATACCGTCTGGGCTGGCCTGATGGCGGGTGTTGGTCTGACTCTGCTGTACCTGGCGCTGTTCCGTCTGGGGTCAGACAGCGCGTCGCTGGTCGATCAGTCTGCAAACGGCGCTGCTATTCTGCATGCTTACGTTCAGCACACCTTTGGCGGCGGCGGTAGCTTCCTGCTGGCGGCGTTAATCTTCATCGCCTGCCTGGTAACGGCAGTTGGCCTGACCTGTGCTTGTGCAGA > NC_000913/420203‑420501 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |