| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 570701 | 3387 (23.680) | 176 (1.300) | 29/262 | NT | 5.3% | intergenic (+273/‑192) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL |
| ? | NC_000913 | = 570711 | 3127 (23.030) | intergenic (+283/‑182) | ybcK/ybcL | DLP12 prophage; putative recombinase/DLP12 prophage; periplasmic protein YbcL | |||||
Only 100 of 5030 total aligned reads displayed.
TAAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAATATCAAATA > NC_000913/570562‑570860 | taAATGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTa < 1:2134895/150‑1 (MQ=255) cctttatctcattatgcataaaggcgcaatgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattatttgccacaatatacacaaagcacattgatactatctaaaaactcttctttattattagTAACACCGACTTTCGTAgg > 2:1063781‑M1/132‑150 (MQ=255) tGAGCTATACAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAggtg > 1:246601‑M2/1‑146 (MQ=255) 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aCAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaat < 1:229581/150‑1 (MQ=255) cAATCTTAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACCAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaata > 2:1789904/1‑150 (MQ=255) atgcataaagccgcactgttcatgcaaaagcaatcacaattgtacccccaacccaattaattgccacaatatacacaaagcacattgatactatctaaaaactctgctttattattagTAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACtaataat > 1:2091877‑M1/119‑150 (MQ=255) ttAATCATTTGTTAGGTGAGAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCAAAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATaaa > 1:1922820/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTTAGGTGATAACTCTTGGTCGCAGATTCAAATACTGAAAATACGTGACAAATTATTATGAGCATAATGGTGTATGTCACGTATTTTGAATGGTAGGTTAAAAAATAACACCGACTTTCGTATGTGTTACTAATAATAAAGCag < 2:2154220/150‑1 (MQ=255) 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CCGACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGCGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAgg < 2:2202827‑M1/150‑1 (MQ=255) gACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGaa > 2:69011/1‑150 (MQ=255) gACTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGaa < 2:467699/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAATCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTTGTTTGTGGGTACAATTGTGATTTCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATTCATAATGAGATAAAGGAata < 2:1149432/150‑1 (MQ=255) cTTTCGTAGGTGTTACTAATAATAAAGCAGAGTTTTTAGATAGTATCAATGTGCTTTGTGTATATTGTGGCAAATAATTGGGTTGGGGGTACAATTGTGATTGCTTTTGCATGAACATTGCGCCTTTATGCATAATGAGATAAAGGAata < 2:2300339/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |