| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGTGAAGTGGTACAG > NC_000913/2805253‑2805549 | gATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAt < 1:1391276‑M2/150‑2 (MQ=255)gATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAt < 2:118435‑M2/150‑2 (MQ=255) tGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtcc > 1:1067929‑M2/1‑147 (MQ=255) 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cTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtccatta > 2:1339552‑M2/1‑143 (MQ=255) tGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGTACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtccattaa < 2:1944240‑M2/150‑9 (MQ=255) gTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTc < 2:2304265/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGc < 2:302509/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGc > 1:2198534/1‑150 (MQ=255) 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ccGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGc < 1:637539/150‑1 (MQ=255) cGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCg > 2:2051128/1‑150 (MQ=255) tatatatTTTTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTTTTGGCGAc < 1:2330551/149‑1 (MQ=255) tatatatTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGAc < 1:1327545/149‑1 (MQ=255) tattatTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGaa > 1:1437109/1‑150 (MQ=255) ttattaATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtccattaataatatatccggattaatcgctaacgcgcgggctaatcccacacgttgacgcatcccgccagagagttcatccgggtagctgtgggcataattttccagcccgacctgac < 2:915890‑M2/150‑119 (MQ=255) tattaATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtccattaataatatatccggattaatcgctaacgcgcgggctaatcccacacgttgacgcatcccgccagagagttcatccgggtagctgtgggcataattttccagcccgacctgacg < 2:293542‑M2/150‑120 (MQ=255) attaATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGAtccattaataatatatccggattaatcgctaacgcgcgggctaatcccacacgttgacgcatcccgccagagagttcatccgggtagctgtgggcataattttccagcccgacctgacgc < 1:1904691‑M2/150‑121 (MQ=255) aaTGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCAt > 2:544167/1‑150 (MQ=255) aaTGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCAt > 2:1713688/1‑150 (MQ=255) aTGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCAtt > 1:1259679/1‑150 (MQ=255) tGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTa > 2:450434/1‑150 (MQ=255) tGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTa < 1:1435662/150‑1 (MQ=255) ggACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCAatat > 1:1799184/1‑150 (MQ=255) ggACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTAt > 1:5237/1‑150 (MQ=255) ggACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTAt < 1:1207601/150‑1 (MQ=255) aGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGCCCGAATTGCCATTATGCaaaa > 2:1837853/1‑150 (MQ=255) cTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATgg > 2:1977652/1‑150 (MQ=255) cTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATgg < 2:927472/150‑1 (MQ=255) tctcGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGTg > 1:1142019/1‑150 (MQ=255) cgcTCGATCCATTAATTCTCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGTGAAGTgg < 1:913223/150‑1 (MQ=255) tCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGTGAAGTGGTAc < 1:1026408/150‑1 (MQ=255) | GATGCACTGCGTCAGGTCGGGCTGGAAAATTATGCCCACAGCTACCCGGATGAACTCTCTGGCGGGATGCGTCAACGTGTGGGATTAGCCCGCGCGTTAGCGATTAATCCGGATATATTATTAATGGACGAAGCCTTCTCGGCGCTCGATCCATTAATTCGCACCGAGATGCAGGATGAGCTGGTAAAATTACAGGCGAAACATCAGCGCACCATTGTCTTTATTTCCCACGATCTTGATGAAGCCATGCGTATTGGCGACCGAATTGCCATTATGCAAAATGGTGAAGTGGTACAG > NC_000913/2805253‑2805549 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |