Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 175,486 | 0 | T | A | 10.4% | 325.0 / 19.6 | 112 | V127E (GTA→GAA) | clcA | chloride:H(+) antiporter ClcA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/44); new base A (6/6); total (62/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |