| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 1,896,480 | T→C | 6.0% | V104A (GTC→GCC) | nudL → | putative NUDIX hydrolase with low 3‑phosphohydroxypyruvate phosphatase activity |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,896,480 | 0 | T | C | 6.0% | 500.5 / 15.0 | 166 | V104A (GTC→GCC) | nudL | putative NUDIX hydrolase with low 3‑phosphohydroxypyruvate phosphatase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (76/80); new base C (7/3); total (83/83) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.28e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 167 total aligned reads displayed.
CTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGCGGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATA > NC_000913/1896332‑1896629 | cTGCTTAATCACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGTAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCTTCAGATATCGCCGCCGGGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTAGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTc < 2:2195705/150‑1 (MQ=255)cTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTc > 1:2014249/1‑150 (MQ=255) tGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCg < 1:1203619/150‑1 (MQ=255) 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gTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGCGGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGat > 2:1986610/1‑150 (MQ=255) tCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGCGGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGata < 2:2354264/150‑1 (MQ=255) | CTGCGTAAACACGCTGGACAAGTGGCATTCCCTGGAGGTGCAGTCGATGACACGGACGCATCAGCTATCGCCGCCGCGCTGCGCGAAGCTGAAGAAGAGGTCGCTATACCGCCTTCCGCCGTTGAAGTTATCGGCGTGCTGCCGCCCGTCGATAGCGTCACTGGCTACCAGGTAACCCCAGTGGTCGGCATTATCCCGCCCGATCTGCCGTATCGCGCCAGTGAAGATGAAGTCTCGGCGGTGTTTGAAATGCCGCTCGCCCAGGCATTACATCTGGGTCGTTATCACCCTTTAGATA > NC_000913/1896332‑1896629 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |